重症肌无力的miRNA生物信息学分析及靶点预测

目的:基于重症肌无力(myasthenia gravis,MG)miRNA表达的差异,分析下游基因、信号通路和蛋白的改变。方法:从GEO下载GSE111870表达谱数据,利用Limma分析差异表达;使用TargetScan和STRING对差异miRNA-mRNA-蛋白质相互作用进行预测,构建相互作用网络,并进行GO和KEGG分析,对差异表达进行功能富集分析。受到多个差异miRNA共同调控。结果:筛选出23个差异表达miRNA,10个上调,13个下调;miRNA-mRNA预测发现7个基因(MAVS、TFAM、LPP、FBXL18、SCLT1G、RIN2B、CACNG8、GRIN2B;GO和KEGG分析发现差异表达miRNA-mRNA与神经、骨骼肌生理显著相关(P<0.001),与TGF-β信号通路显著相关(P<0.001)。通过构建蛋白质相互作用网络,发现FBXL18、GRIN2B、PRKACB、KLHL42处于蛋白相互作用的枢纽位置。结论:TFAM、MAVS、GRIN2B等基因可能与MG疾病的发生发展有关,其在MG中的作用有待进一步验证。