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芒果点斑螟不同发育阶段转录组及保幼激素和蜕皮激素相关基因分析
1
作者
彭鹏
唐莹莹
+5 位作者
覃昱茗
杨世安
黄国弟
李日旺
罗世杏
陈永森
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期710-720,共11页
【目的】探明芒果点斑螟(Citripestis eutraphera)不同发育阶段的转录组差异,挖掘保幼激素(JH)和蜕皮激素(Ecd)合成等生长发育相关基因,为芒果点斑螟特异性防治和研发环保型生长调节类杀虫剂打下基础。【方法】利用高通量测序技术对芒...
【目的】探明芒果点斑螟(Citripestis eutraphera)不同发育阶段的转录组差异,挖掘保幼激素(JH)和蜕皮激素(Ecd)合成等生长发育相关基因,为芒果点斑螟特异性防治和研发环保型生长调节类杀虫剂打下基础。【方法】利用高通量测序技术对芒果点斑螟幼虫、蛹和成虫进行转录组测序、数据组装、功能注释和比较分析,筛选出JH和Ecd合成相关基因,并通过实时荧光定量PCR进行验证。【结果】芒果点斑螟幼虫、蛹和成虫3个阶段共组装得到254154条Unigenes。幼虫与蛹阶段比较筛选出10688个差异表达基因(DEGs),幼虫与成虫阶段比较筛选出10041个DEGs,蛹与成虫阶段比较筛选出12896个DEGs;将DEGs进行Nr数据库比对,结果显示与脐橙螟蛾(Amyelois transitella)的序列相似度最高;进行GO功能注释分析,共注释到61266条Unigenes,各发育阶段芒果点斑螟的DEGs多富集在细胞结构体、细胞过程、催化活性和结合等过程;在KEGG数据库中共有14731条Unigenes得到注释,涉及147个代谢通路,DEGs富集在代谢过程、核糖体和氧化磷酸化过程等通路的数目较多,筛选出49条Unigenes涉及JH和Ecd合成相关基因,对DIB、JHAMT、FPPP、ALDH-1和ALDH-2等5个DEGs进行实时荧光定量PCR分析,结果ALDH-1、ALDH-2DIB和DIB在蛹期高表达,且相对表达量显著高于其他时期(P<0.05,下同),FPPP和JHAMT在幼虫期低表达且相对表达量显著低于其他时期。【结论】基于转录组分析获得不同发育阶段芒果点斑螟的DEGs多富集在细胞结构体、细胞过程、催化活性和结合等过程,且主要富集在代谢相关通路中;筛选出49条与JH和Ecd合成相关的基因,DIB、JHAMT、FPPP、ALDH-1和ALDH-2等基因在芒果点斑螟不同发育阶段表达差异显著,可能在芒果点斑螟生长发育中发挥重要作用。
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关键词
芒果点斑螟
转录组
基因注释
保幼激素
蜕皮激素
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题名
芒果点斑螟不同发育阶段转录组及保幼激素和蜕皮激素相关基因分析
1
作者
彭鹏
唐莹莹
覃昱茗
杨世安
黄国弟
李日旺
罗世杏
陈永森
机构
广西亚热带作物研究所/广西芒果产业绿色高效发展工程研究中心/广西亚热带特色水果质量安全控制重点实验室
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期710-720,共11页
基金
广西科技重大专项(桂科AA22068098)
国家现代农业产业技术体系广西创新团队建设专项(nycytxgcxtd-2021-06-01)
广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2021YT141,桂农科2022YM22)。
文摘
【目的】探明芒果点斑螟(Citripestis eutraphera)不同发育阶段的转录组差异,挖掘保幼激素(JH)和蜕皮激素(Ecd)合成等生长发育相关基因,为芒果点斑螟特异性防治和研发环保型生长调节类杀虫剂打下基础。【方法】利用高通量测序技术对芒果点斑螟幼虫、蛹和成虫进行转录组测序、数据组装、功能注释和比较分析,筛选出JH和Ecd合成相关基因,并通过实时荧光定量PCR进行验证。【结果】芒果点斑螟幼虫、蛹和成虫3个阶段共组装得到254154条Unigenes。幼虫与蛹阶段比较筛选出10688个差异表达基因(DEGs),幼虫与成虫阶段比较筛选出10041个DEGs,蛹与成虫阶段比较筛选出12896个DEGs;将DEGs进行Nr数据库比对,结果显示与脐橙螟蛾(Amyelois transitella)的序列相似度最高;进行GO功能注释分析,共注释到61266条Unigenes,各发育阶段芒果点斑螟的DEGs多富集在细胞结构体、细胞过程、催化活性和结合等过程;在KEGG数据库中共有14731条Unigenes得到注释,涉及147个代谢通路,DEGs富集在代谢过程、核糖体和氧化磷酸化过程等通路的数目较多,筛选出49条Unigenes涉及JH和Ecd合成相关基因,对DIB、JHAMT、FPPP、ALDH-1和ALDH-2等5个DEGs进行实时荧光定量PCR分析,结果ALDH-1、ALDH-2DIB和DIB在蛹期高表达,且相对表达量显著高于其他时期(P<0.05,下同),FPPP和JHAMT在幼虫期低表达且相对表达量显著低于其他时期。【结论】基于转录组分析获得不同发育阶段芒果点斑螟的DEGs多富集在细胞结构体、细胞过程、催化活性和结合等过程,且主要富集在代谢相关通路中;筛选出49条与JH和Ecd合成相关的基因,DIB、JHAMT、FPPP、ALDH-1和ALDH-2等基因在芒果点斑螟不同发育阶段表达差异显著,可能在芒果点斑螟生长发育中发挥重要作用。
关键词
芒果点斑螟
转录组
基因注释
保幼激素
蜕皮激素
Keywords
Citripestis eutraphera
transcriptome
gene annotation
juvenile hormone
ecdysone
分类号
S436.679 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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作者
出处
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被引量
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1
芒果点斑螟不同发育阶段转录组及保幼激素和蜕皮激素相关基因分析
彭鹏
唐莹莹
覃昱茗
杨世安
黄国弟
李日旺
罗世杏
陈永森
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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