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基于生物信息学筛选卵巢癌预后的坏死性凋亡相关基因
1
作者
罗永金
胡晓霞
林泳秀
《广西医学》
CAS
2023年第21期2629-2636,共8页
目的通过生物信息学筛选与卵巢癌患者预后的坏死性凋亡相关基因。方法从公共数据库下载坏死性凋亡相关基因、卵巢癌的基因表达和相关临床数据,利用RStudio 4.1软件筛选出在卵巢癌组织与卵巢正常组织间差异表达的坏死性凋亡相关基因(差...
目的通过生物信息学筛选与卵巢癌患者预后的坏死性凋亡相关基因。方法从公共数据库下载坏死性凋亡相关基因、卵巢癌的基因表达和相关临床数据,利用RStudio 4.1软件筛选出在卵巢癌组织与卵巢正常组织间差异表达的坏死性凋亡相关基因(差异表达基因),对差异表达基因进行基因本体论(GO)功能富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用多因素COX回归模型筛选出与卵巢癌患者预后有关的坏死性凋亡相关基因。根据多因素COX回归结果构建卵巢癌预后风险模型,根据该模型风险评分中位数将卵巢癌样本分为高风险组和低风险组,采用Kaplan-Meier法比较高风险组和低风险组患者的生存情况,采用受试者工作特征(ROC)曲线验证卵巢癌预后风险模型的评估效能。通过COX回归模型分析卵巢癌预后的独立影响因素,并通过列线图展示卵巢癌独立预后影响因素与卵巢癌患者总生存率的相关性。结果(1)确定卵巢癌中有25个差异表达基因,包括13个上调基因与12个下调基因。(2)GO分析结果显示,差异表达基因涉及的生物学过程包括调节凋亡信号通路等,涉及的细胞组分主要为晚期内体膜等,涉及的分子功能主要包括细胞因子活性等。KEGG通路富集分析结果提示,差异表达基因主要富集在坏死性凋亡等信号通路。(3)多因素COX回归模型分析结果显示,信号转导与转录激活因子4(STAT4)基因和钙/钙调素依赖蛋白激酶Ⅱ型亚基α(CAMK2A)基因与卵巢癌患者预后相关(P<0.05),其中STAT4基因属于保护基因,CAMK2A基因为危险基因。(4)构建基于STAT4基因和CAMK2A基因的卵巢癌预后风险模型,生存分析结果显示高风险组患者总生存期低于低风险组(P<0.05),根据此模型评估卵巢癌患者1年、2年和3年生存情况的曲线下面积分别为0.575、0.616和0.593。(5)COX回归分析结果显示,该模型风险评分是卵巢癌患者预后的独立影响因素(P<0.05);基于卵巢癌独立预后影响因素构建的预测患者总生存期的列线图C指数折线图、列线图校准曲线分析结果提示列线图具有较好的准确性。结论坏死性凋亡相关基因中的STAT4基因和CAMK2A基因与卵巢癌患者预后相关,其中STAT4基因属于保护基因,CAMK2A基因为危险基因,基于STAT4基因和CAMK2A基因构建的卵巢癌预后风险模型对评估卵巢癌患者预后具有一定价值。
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关键词
卵巢癌
坏死性凋亡相关基因
预后
风险评分
生物信息学
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职称材料
免电热条件下行单孔腹腔镜卵巢畸胎瘤剥除术对卵巢成熟性畸胎瘤患者卵巢储备功能的影响
被引量:
1
2
作者
黄伟容
韦利英
+3 位作者
韦仕洋
刘媛媛
吴玉英
赵仁峰
《广西医学》
CAS
2022年第15期1730-1733,共4页
目的探讨免电热条件下行单孔腹腔镜卵巢畸胎瘤剥除术对卵巢成熟性畸胎瘤患者卵巢储备功能的影响。方法回顾性分析在免电热条件下行单孔腹腔镜卵巢畸胎瘤剥除术治疗的60例卵巢成熟性畸胎瘤患者的临床资料,根据卵巢畸胎瘤侧数分为单侧组5...
目的探讨免电热条件下行单孔腹腔镜卵巢畸胎瘤剥除术对卵巢成熟性畸胎瘤患者卵巢储备功能的影响。方法回顾性分析在免电热条件下行单孔腹腔镜卵巢畸胎瘤剥除术治疗的60例卵巢成熟性畸胎瘤患者的临床资料,根据卵巢畸胎瘤侧数分为单侧组51例和双侧组9例。记录患者手术情况、手术前后卵巢储备功能[抗米勒管激素(AMH)、卵泡刺激素(FSH)、黄体生成素(LH)、雌二醇水平及窦卵泡数(AFC)]变化,并比较两组患者术后卵巢储备功能减退的发生率。结果60例患者均顺利完成手术,无中转多孔腹腔镜及开腹手术,手术时间为50.00~135.00(67.15±3.91)min,术中出血量为80.00~400.00(158.82±29.13)mL,住院时间为4.00~9.00(5.28±1.31)d。所有患者均无明显并发症。术后1个月、3个月、6个月的AMH、FSH、LH、雌二醇水平及AFC与术前比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。单侧组与双侧组患者的FSH、LH、雌二醇、AMH水平及AFC差异均无统计学意义,两组上述指标均无随时间变化的趋势(均P>0.05)。两组术后卵巢储备功能减退发生率差异亦无统计学意义(P>0.05)。结论在免电热条件下行单孔腹腔镜卵巢畸胎瘤剥除术治疗卵巢成熟性畸胎瘤患者安全可行,对患者术后卵巢储备功能无明显影响。
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关键词
卵巢成熟性畸胎瘤
单孔腹腔镜技术
免电热
卵巢畸胎瘤剥除术
卵巢储备功能
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职称材料
题名
基于生物信息学筛选卵巢癌预后的坏死性凋亡相关基因
1
作者
罗永金
胡晓霞
林泳秀
机构
广西医学科学院·广西壮族自治区人民医院妇科
出处
《广西医学》
CAS
2023年第21期2629-2636,共8页
基金
国家自然科学基金(81660434)
广西自然科学基金(2018GXNSFAA050098)
广西壮族自治区卫生健康委员会自筹经费科研课题(Z20201035)。
文摘
目的通过生物信息学筛选与卵巢癌患者预后的坏死性凋亡相关基因。方法从公共数据库下载坏死性凋亡相关基因、卵巢癌的基因表达和相关临床数据,利用RStudio 4.1软件筛选出在卵巢癌组织与卵巢正常组织间差异表达的坏死性凋亡相关基因(差异表达基因),对差异表达基因进行基因本体论(GO)功能富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用多因素COX回归模型筛选出与卵巢癌患者预后有关的坏死性凋亡相关基因。根据多因素COX回归结果构建卵巢癌预后风险模型,根据该模型风险评分中位数将卵巢癌样本分为高风险组和低风险组,采用Kaplan-Meier法比较高风险组和低风险组患者的生存情况,采用受试者工作特征(ROC)曲线验证卵巢癌预后风险模型的评估效能。通过COX回归模型分析卵巢癌预后的独立影响因素,并通过列线图展示卵巢癌独立预后影响因素与卵巢癌患者总生存率的相关性。结果(1)确定卵巢癌中有25个差异表达基因,包括13个上调基因与12个下调基因。(2)GO分析结果显示,差异表达基因涉及的生物学过程包括调节凋亡信号通路等,涉及的细胞组分主要为晚期内体膜等,涉及的分子功能主要包括细胞因子活性等。KEGG通路富集分析结果提示,差异表达基因主要富集在坏死性凋亡等信号通路。(3)多因素COX回归模型分析结果显示,信号转导与转录激活因子4(STAT4)基因和钙/钙调素依赖蛋白激酶Ⅱ型亚基α(CAMK2A)基因与卵巢癌患者预后相关(P<0.05),其中STAT4基因属于保护基因,CAMK2A基因为危险基因。(4)构建基于STAT4基因和CAMK2A基因的卵巢癌预后风险模型,生存分析结果显示高风险组患者总生存期低于低风险组(P<0.05),根据此模型评估卵巢癌患者1年、2年和3年生存情况的曲线下面积分别为0.575、0.616和0.593。(5)COX回归分析结果显示,该模型风险评分是卵巢癌患者预后的独立影响因素(P<0.05);基于卵巢癌独立预后影响因素构建的预测患者总生存期的列线图C指数折线图、列线图校准曲线分析结果提示列线图具有较好的准确性。结论坏死性凋亡相关基因中的STAT4基因和CAMK2A基因与卵巢癌患者预后相关,其中STAT4基因属于保护基因,CAMK2A基因为危险基因,基于STAT4基因和CAMK2A基因构建的卵巢癌预后风险模型对评估卵巢癌患者预后具有一定价值。
关键词
卵巢癌
坏死性凋亡相关基因
预后
风险评分
生物信息学
Keywords
Ovarian cancer
Necrotic apoptosis-related genes
Prognosis
Risk score
Bioinformatics
分类号
R737.3 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
免电热条件下行单孔腹腔镜卵巢畸胎瘤剥除术对卵巢成熟性畸胎瘤患者卵巢储备功能的影响
被引量:
1
2
作者
黄伟容
韦利英
韦仕洋
刘媛媛
吴玉英
赵仁峰
机构
广西医学科学院·广西壮族自治区人民医院妇科
出处
《广西医学》
CAS
2022年第15期1730-1733,共4页
基金
广西壮族自治区卫生和计划生育委员会自筹经费科研课题(Z20170340)
广西壮族自治区人民医院青年基金(QN2018-29)。
文摘
目的探讨免电热条件下行单孔腹腔镜卵巢畸胎瘤剥除术对卵巢成熟性畸胎瘤患者卵巢储备功能的影响。方法回顾性分析在免电热条件下行单孔腹腔镜卵巢畸胎瘤剥除术治疗的60例卵巢成熟性畸胎瘤患者的临床资料,根据卵巢畸胎瘤侧数分为单侧组51例和双侧组9例。记录患者手术情况、手术前后卵巢储备功能[抗米勒管激素(AMH)、卵泡刺激素(FSH)、黄体生成素(LH)、雌二醇水平及窦卵泡数(AFC)]变化,并比较两组患者术后卵巢储备功能减退的发生率。结果60例患者均顺利完成手术,无中转多孔腹腔镜及开腹手术,手术时间为50.00~135.00(67.15±3.91)min,术中出血量为80.00~400.00(158.82±29.13)mL,住院时间为4.00~9.00(5.28±1.31)d。所有患者均无明显并发症。术后1个月、3个月、6个月的AMH、FSH、LH、雌二醇水平及AFC与术前比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。单侧组与双侧组患者的FSH、LH、雌二醇、AMH水平及AFC差异均无统计学意义,两组上述指标均无随时间变化的趋势(均P>0.05)。两组术后卵巢储备功能减退发生率差异亦无统计学意义(P>0.05)。结论在免电热条件下行单孔腹腔镜卵巢畸胎瘤剥除术治疗卵巢成熟性畸胎瘤患者安全可行,对患者术后卵巢储备功能无明显影响。
关键词
卵巢成熟性畸胎瘤
单孔腹腔镜技术
免电热
卵巢畸胎瘤剥除术
卵巢储备功能
Keywords
Mature ovarian teratoma
Laparoendoscopic single-site surgery
Without electrocoagulation
Ovarian teratoma stripping
Ovarian reserve function
分类号
R737.31 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
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基于生物信息学筛选卵巢癌预后的坏死性凋亡相关基因
罗永金
胡晓霞
林泳秀
《广西医学》
CAS
2023
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职称材料
2
免电热条件下行单孔腹腔镜卵巢畸胎瘤剥除术对卵巢成熟性畸胎瘤患者卵巢储备功能的影响
黄伟容
韦利英
韦仕洋
刘媛媛
吴玉英
赵仁峰
《广西医学》
CAS
2022
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