新医科背景下的本科基础医学创新人才培养模式的研究与实践

目的探讨新医科背景下的基础医学创新人才培养模式。方法学校通过开设新医科本科新专业等方面优化专业结构,通过新增新医科特色课程、创新创业类课程教学内容以及运用互联网新型教学工具等途径改进课程设置,通过“做中学(Learning by Doing)”、科教融合、教赛融合等方式创新教学方法,从而对本科基础医学创新人才培养模式的深入研究与实践。结果基础医学创新人才培养模式的实践成效显著,学生创新能力素质明显提高。结论培养“医学+”基础医学创新人才符合新时代医学人才培养的需求,对推动人类卫生健康事业发展具有重要的意义。

石墨相氮化碳二维纳米片载洋川芎内酯Ⅰ应用于缺血性脑卒中大鼠的治疗研究

目的:探讨石墨相氮化碳(g-C_(3)N_(4))二维纳米片负载洋川芎内酯I(SEI)对缺血性脑卒中大鼠的治疗作用。方法:利用三聚氰胺通过热相反应生成层状g-C_(3)N_(4),热剥酸剥后得到薄层g-C_(3)N_(4)纳米片并进行表征;将SEI负载到g-C_(3)N_(4)纳米片上,通过紫外可见吸收光谱测定上清中的SEI,计算g-C_(3)N_(4)负载SEI质量比,测定SEI-g-C_(3)N_(4)复合纳米片在1 h、3 h、6 h、12 h、24 h和48 h的药物释放情况;SD大鼠大脑中动脉闭塞(MCAO)造模前48 h通过脑立体定位注射SEI-g-C_(3)N_(4)复合纳米片,造模后24 h进行神经行为学评分,评分结束后取材分别进行TTC染色、TUNEL染色和HE染色。结果:通过表征实验,制备的g-C_(3)N_(4)纳米片尺寸小(约100 nm)、比表面积大、分散性好、表面带正电荷(33.3 mV);紫外可见吸收光谱测定结果显示,g-C_(3)N_(4)已成功负载SEI,且SEI/g-C_(3)N_(4)质量比为15.06;药物释放结果显示,24 h时SEI的释放率接近50%;与sham组相比,MCAO组神经功能缺失评分显著升高(P<0.0001),表明造模成功;与MCAO组相比,MCAO+SEI组神经功能缺失评分减少(P>0.05),MCAO+SEI-g-C_(3)N_(4)组神经功能缺失评分减少(P<0.001);与MCAO+SEI组相比,MCAO+SEI-g-C_(3)N_(4)组神经功能缺失评分减少(P<0.01);TTC染色结果表明,与sham组相比,MCAO组的脑梗死面积显著增加(P<0.0001);与MCAO组相比,MCAO+SEI组梗死面积减少(P<0.0001),MCAO+SEI-g-C_(3)N_(4)组脑梗死面积显著减少(P<0.0001);与MCAO+SEI组相比,MCAO+SEI-g-C_(3)N_(4)组脑梗死面积减少(P<0.001);TUNEL染色结果表明,与sham组相比,MCAO组的凋亡率升高(P<0.0001),表明造模成功;与sham组相比,MCAO+SEI-g-C_(3)N_(4)组凋亡率升高(P>0.05);与MCAO组相比,MCAO+SEI-g-C_(3)N_(4)组凋亡率减少(P<0.001);体内生物安全性实验结果表明,与sham组相比,SEI组、SEI-g-C_(3)N_(4)组大鼠体重无统计学差异,且皮层脑组织结构和细胞形态无明显病理性变化。结论:成功制备了生物安全性较好的SEI-g-C_(3)N_(4)复合纳米片,且其能够减少MCAO大鼠的脑梗死面积,抑制细胞凋亡,减轻脑组织病理性变化,并且能改善大鼠的神经行为功能,表明SEI-g-C_(3)N_(4)复合纳米片可用于治疗缺血性脑卒中大鼠。

傅里叶变换衰减全反射红外光谱检测血液样本在疾病筛查及诊断的应用进展

傅里叶变换衰减全反射红外(attenuated total reflection Fourier transform infrared,ATR-FTIR)光谱技术以其快速、准确、无创的特点,在生物医学领域尤其是临床血液学检验中显示出巨大潜力。该技术记录样本中分子的振动光谱,提供生物样品内核酸、蛋白质和脂质的化学结构信息,可用于疾病筛查和诊断。ATR-FTIR光谱技术在地中海贫血、艾滋病毒感染、乳腺癌、卵巢癌和脑瘤等疾病中的研究现状和发展情况,提示该技术结合化学计量学方法可实现疾病的快速筛查、诊断与鉴别诊断。ATR-FTIR光谱技术与偏最小二乘法回归模型相结合,以定量法分析人外周血样品中平均红细胞血红蛋白含量、平均红细胞体积和血红蛋白等地中海贫血筛查指标,筛查地中海贫血的灵敏度、特异度分别达到100.0%和95.3%。采用ATR-FTIR光谱技术,基于遗传算法的线性判别分析法,分析血液样本红外图谱中1653 cm-1(酰胺Ⅰ带)、1558 cm-1(酰胺Ⅱ带)、1506 cm-1(环基)和901 cm-1(磷酸二酯伸缩带)处的特征峰,对人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染孕妇血液样本的辨别准确率为89%,灵敏度、特异度分别为83%、92%。采用主成分回归(principal component regression)法对乳腺患者血液ATRFTIR光谱进行识别,其灵敏度与特异度高达92.3%与87.1%此外,ATR-FTIR光谱技术还可应用于生物医学领域的其他方面,如细胞和组织学样本的检测、疾病严重程度的分类等。ATR-FTIR光谱技术展现出广阔的应用前景,但仍面临环境干扰、样本污染等挑战。未来,随着ATR-FTIR光谱技术的优化、发展,其有望在更多疾病的临床血液学检验中发挥重要作用。

生物医用高分子材料细胞膜表面功能化的策略与应用

细胞膜是细胞的外层包裹结构,保护细胞内部免受外界干扰.通过对细胞膜进行修饰,引入特定的分子或结构,可以实现对细胞命运和功能的调控,从而赋予细胞特殊的功能.近年来,利用高分子材料在细胞膜上发生自组装的策略用于功能化修饰细胞膜表面已被广泛研究.本文综述了利用高分子、多肽及DNA纳米材料对细胞膜进行修饰的策略,总结了其带来的包括受体寡聚化、细胞膜通透性改变以及调节细胞间通讯的生物效应以及细胞膜表面功能化的生物应用.

生物纳米材料在骨关节炎诊断中的应用进展

骨关节炎(OA)是一种起病隐匿、预后差、影响广泛的关节疾病,目前临床上使用的诊断方式很难做到早发现、早诊断、诊疗一体。生物纳米材料具有高效、安全、灵敏度高、价格较低等优点。近年来,随着对生物纳米材料研究的不断深入,其在OA诊断方面的研究也逐步开展。目前已有的关于OA诊断研究的生物纳米材料,按化学组成可分为无机纳米材料、有机纳米材料和其他纳米材料。无机纳米材料主要包括金纳米材料、碳纳米材料、量子点、超顺磁性氧化铁材料。有机纳米材料主要包括脂质体和聚合物纳米材料。本文就上述几种纳米材料在OA诊断中的应用研究进行综述。

人脐带间充质干细胞的异质性探讨及基于单细胞RNA测序结果的亚群分析

目的探讨人脐带间充质干细胞(hUCMSCs)的异质性,并基于单细胞RNA测序结果进行亚群分析。方法选择两株由郑州奥博细胞医学实验室有限公司提供的hUCMSCs(分别命名为hUCMSCs-1和hUCMSCs-2),通过实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)进行干性基因[性别决定区Y-box 2(Sox2)、Nanog]检测。对hUCMSCs进行成骨诱导,3 d后检测成骨基因碱性磷酸酶(Alp)的表达,7 d后进行碱性磷酸酶染色,14 d后进行茜素红染色。对两株hUCMSCs进行成软骨诱导,21 d后检测成软骨基因二型胶原(COL2A1)的表达。用10 ng/mL白细胞介素-1β(IL-1β)刺激大鼠软骨细胞24 h,与hUCMSCs-1和hUCMSCs-2共培养后,检测软骨细胞合成代谢基因蛋白聚糖(ACAN)和分解代谢基因基质金属蛋白酶3(MMP3)的表达。对hUCMSCs-1进行单细胞RNA测序,并根据功能进行亚群分组,通过生物信息学分析方法描绘各个亚群标志基因热图、富集的信号通路。结果两株hUCMSCs的Sox2、Nanog、Alp、COL2A1表达水平差异有统计学意义(P<0.05)。在成骨诱导7 d后,hUCMSCs-1的碱性磷酸酶染色程度深于hUCMSCs-2。在成骨诱导14 d后,茜素红染色结果显示,hUCMSCs-1钙结节数量多于hUCMSCs-2。经IL-1β干预后,软骨细胞与两株hUCMSCs共培养后的MMP3表达水平差异有统计学意义(P<0.05),但ACAN表达水平差异不显著(P>0.05)。基于单细胞RNA测序结果,hUCMSCs-1可分为C1、C2、C3三个功能亚群。C1亚群的信号通路在细胞外基质受体相互作用上富集,与软骨细胞合成代谢相关;C2亚群信号通路在细胞衰老和凋亡上富集,与细胞的自我更新相关;C3亚群信号通路在DNA复制和减数分裂上富集,与细胞周期相关。结论不同个体来源的hUCMSCs存在异质性,其在成骨、成软骨和抗分解代谢能力方面可能存在差异。通过单细胞RNA测序可较好地根据hUCMSCs的功能特性对其进行分群,有助于提高间充质干细胞治疗的临床疗效。

地中海贫血基因治疗进展和现状

地中海贫血(地贫)是由于α-或β-珠蛋白基因突变或者缺失使α-或β-珠蛋白链生成缺陷,最终导致的遗传性溶血性疾病。同种异体造血干细胞移植是一种能够治愈输血依赖型地贫(TDT)的选择,但由于匹配的供体来源的限制,以及不匹配供体移植的风险,只有不到10%的患者能受益于这种治疗。自体造血干细胞的基因治疗为TDT患者提供了一个新的、可治愈的选择。β-地贫的基因治疗主要有两种策略:一是通过慢病毒载体介导补充β-珠蛋白的基因替代;二是通过基因编辑技术重新激活胎儿期γ-珠蛋白的表达。α-地贫基因治疗的研究还未有报道。本文综述了β-地贫基因治疗国际和国内的进展和现状,还讨论了目前地贫基因治疗的问题和后续研发的可能方向。

早期创伤性膝骨关节炎动物模型构建方案的比较

背景:现有骨关节炎的有创造模方法包括前交叉韧带横断手术和前交叉韧带横断联合内侧半月板前角切除手术,前交叉韧带横断术后需要过量运动,而完整切除内侧半月板前角可能造成副损伤并增加造模结果的差异性,对术者手术技巧要求较高。目的:对传统的骨关节炎有创造模手段进行改良和简化,并比较不同方案在无高负荷运动环境下的造模效果。方法:采用随机数字表法将48只SD大鼠分为4组,每组12只:假手术组完全暴露左侧后肢膝关节腔后缝合关节腔及皮肤;横断组、横断+切除组、横断+撕裂组左侧后肢分别进行前交叉韧带横断手术、前交叉韧带横断联合内侧半月板前角切除手术、前交叉韧带横断联合内侧半月板前角撕裂手术。术后4周取膝关节标本,进行大体、X射线片、CT扫描、病理组织切片观察及PCR检测。结果与结论:①大体观察:横断组可见半月板处轻度磨损;横断+撕裂组可见外侧髁关节面严重磨损、内侧髁关节面轻度磨损、半月板严重磨损,内侧半月板全层磨损;横断+切除组可见外侧髁关节面严重磨损、内侧髁关节面轻度磨损、半月板内侧前角缺如,半月板磨损面积>50%;②X射线片与CT扫描:4组无明显差异,其中3个手术组可见胫骨前移,横断+切除组内侧半月板前角缺失;③病理组织切片观察:苏木精-伊红、甲苯胺蓝、天狼猩红染色显示,假手术组与横断组关节面光滑平整;横断+撕裂组、横断+切除组可见明显的软骨损伤及基质降解,其中横断+撕裂组软骨损伤及基质降解情况较轻;④PCR检测:横断+撕裂组、横断+切除组白细胞介素1β、白细胞介素6、白细胞介素8、肿瘤坏死因子α、基质金属蛋白酶1、基质金属蛋白酶3的mRNA表达量高于假手术组、横断组(P<0.05),聚集蛋白聚糖的mRNA表达量低于假手术组、横断组(P<0.05);横断+切除组白细胞介素6、基质金属蛋白酶1、基质金属蛋白酶3的mRNA表达量高于横断+撕裂组(P<0.05);⑤单纯的前交叉韧带横断手术较难诱发明显的骨关节炎,前交叉韧带横断联合内侧半月板前角切除或者内侧半月板前角撕裂手术均能诱发明显的骨关节炎,且造模效果相近。

罕见β-珠蛋白基因Codon 24(GGT>GGA)突变导致β-地中海贫血1例及文献分析

目的:分析罕见β-珠蛋白基因突变类型、血液学及临床特征。方法:收集疑为β-地中海贫血的病例120例。对病例进行全血细胞分类及计数、血红蛋白(Hb)电泳分析检测。用跨越断裂点PCR方法、荧光PCR熔解曲线方法、DNA测序等分析α-和β-珠蛋白基因突变类型。结果:120例β-地中海贫血病例中,检出1例为罕见β-珠蛋白基因突变,基因分析为Codon 24(GGT>GGA,HBB:c.75T>A)杂合子。该病例为男性,39岁,血常规检测显示:Hb 127.3 g/L,血红细胞(RBC)5.81×10^(12)/L,红细胞平均体积(MCV)70.29 fL,红细胞平均血红蛋白量(MCH)21.94 pg,红细胞平均血红蛋白浓度(MCHC)312.10 g/L。Hb分析显示Hb A_(2)4.5%,Hb F 0.4%。a-地中海贫血基因分析未发现常见的基因突变类型。结论:首次在国内发现罕见β-珠蛋白基因Codon 24(GGT>GGA,HBB:c.75T>A)突变导致β-地中海贫血。该病例在临床上易漏诊,应引起重视。

小口径人工血管的研究现状及展望

近年来,由于心血管疾病发生率逐渐上升,临床上对再生血管的需求日益增加。目前,大口径人工血管(直径>6 mm)已成功应用于临床,小口径人工血管(直径<6 mm)由于血栓形成、内膜增生、炎症反应和顺应性差导致血流动力学改变等原因,使其移植后远期通畅率低,距离临床应用尚有一段距离。其中,快速内皮化、抑制血栓形成及与自体血管相匹配的顺应性仍是解决问题的关键。本文简述制备小口径人工血管常用材料及技术的特点,重点讨论提高人工血管生物相容性和顺应性的策略,并对未来的研究工作进行展望。

成年斑马鱼脊髓损伤模型的制备和评估

目的:建立一种成年斑马鱼脊髓损伤(SCI)模型。方法:将成年斑马鱼随机分为正常组、假手术组和SCI组。SCI组进行脊髓完全横断手术,假手术组对斑马鱼的脊髓只暴露而不切断,正常组不做特殊处理。通过测试处理后斑马鱼的自由游泳能力和顺行轴突追踪来评估神经再生的情况。结果:假手术组与正常组斑马鱼5 min游泳路径的平均距离比较,差异无统计学意义(P>0.05),与第1周相比,SCI组斑马鱼第6周的5 min游泳路径的平均距离显著增加(P<0.05)。顺行神经示踪显示SCI组斑马鱼在损伤后2周出现可观察的轴突恢复。结论:成年斑马鱼具有显著的SCI恢复能力,本实验建立的成年斑马鱼SCI模型技术成熟、容易复制,可应用于SCI的相关研究。

中枢神经系统边界相关巨噬细胞在大脑稳态和脑疾病中作用的研究进展

随着中枢神经系统“免疫豁免”的观点被打破,越来越多的研究聚焦于免疫调节在中枢神经系统疾病中的重要作用。其中,中枢神经系统边界相关巨噬细胞(BAMs)在大脑稳态和脑疾病调节中的作用日益凸显。与长期定植在脑实质内的小胶质细胞不同,BAMs是特化的巨噬细胞群,包括硬脑膜、蛛网膜、软脑膜、血管周围间隙和脉络膜丛的巨噬细胞,它们发挥着免疫监测、脑脊液引流、抗原清除和物质交换等重要功能。我们拟对BAMs的起源、功能及其在大脑稳态和脑疾病中的作用进行综述,以丰富对BAMs维持大脑稳态机制的理解,并为阿尔茨海默病等中枢神经系统疾病的治疗提供新思路。

地榆皂苷Ⅰ对大鼠膝骨关节炎的作用机制研究

目的研究地榆皂苷Ⅰ对大鼠膝骨关节炎的作用机制。方法选择SD雄性乳鼠8只,提取乳鼠软骨细胞,采用CCK-8实验检测细胞增殖率以确定最佳药物浓度。将软骨细胞随机分为对照组、炎症组和治疗组,对照组在完全培养基中进行培养,炎症组在含有10μg/mL白细胞介素-1β(IL-1β)的培养基中培养,治疗组在含有10μg/mL IL-1β和最佳浓度地榆皂苷Ⅰ的培养基中培养。采用Calcein-AM/PI染色观察各组软骨细胞生长情况。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测各组软骨细胞中白细胞介素-6(IL-6)、基质金属蛋白酶13(MMP13)mRNA相对表达量。取8周龄左右的SD雄性大鼠24只随机分为对照组、炎症组和治疗组,每组8只,对炎症组和治疗组建立骨关节炎模型,建模完成4周后,炎症组和对照组的关节腔内注射等体积生理盐水,治疗组的关节腔内注射100μL最佳浓度的地榆皂苷Ⅰ溶液,1次/周,连续给药4周。采用HE染色和番红O-固绿染色观察各组膝关节组织结构。采用免疫组化染色观察各组膝关节组织中IL-6、MMP13蛋白表达情况。结果CCK-8实验结果显示,各实验浓度均未表现明显细胞毒性,当地榆皂苷Ⅰ的浓度为20 mg/L时,软骨细胞增殖率最高。Calcein-AM/PI染色结果显示,炎症组和治疗组细胞增殖率低于对照组,治疗组细胞增殖率高于炎症组,差异有统计学意义(P<0.05)。RT-qPCR检测结果显示,炎症组和治疗组IL-6、MMP13 mRNA相对表达量高于对照组,治疗组IL-6、MMP13 mRNA相对表达量低于炎症组,差异有统计学意义(P<0.05)。HE染色和番红O-固绿染色结果显示,对照组的膝关节组织结构比炎症组和治疗组完整,与炎症组相比,治疗组膝关节组织损伤有所减轻。免疫组化染色结果显示,炎症组IL-6、MMP13蛋白表达水平最高,治疗组IL-6、MMP13蛋白表达水平高于对照组。结论地榆皂苷Ⅰ可通过维持软骨细胞活力、降低炎症因子的释放以及减少软骨细胞外基质(ECM)的降解发挥抗炎作用,对膝骨关节炎有一定的药用潜力。

地塞米松磷酸钠纳米制剂对IL-1β诱导大鼠原代软骨细胞炎症的影响

目的:探讨地塞米松(Dex)磷酸钠纳米制剂(Nano-Dex)对白细胞介素(IL)-1β诱导的大鼠原代软骨细胞炎症的影响。方法:利用透射电镜观察Nano-Dex纳米粒的形态,马尔文粒径仪检测Nano-Dex的粒径和电位。培养SD大鼠软骨细胞,将细胞分为空白组、IL-1β组、IL-1β+Dex组和IL-1β+Nano-Dex组。用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测软骨细胞基质金属蛋白酶(MMP)13、MMP3、IL-1β、IL-6、Ⅱ型胶原α1(Col2a1)和蛋白聚糖(ACAN)基因表达水平,免疫荧光染色观察MMP13的表达,western blotting法检测软骨细胞MMP13、Col2a1、IL-6、IL-1β、P65和Caspase 3蛋白表达水平。结果:Nano-Dex形状圆润,大小均一,直径约在90 nm,带正电荷。与空白组比较,IL-1β组软骨修复基因Col2a1、ACAN表达下调,而炎症基因IL-1β、IL-6、MMP3、MMP13表达上调(均P<0.05);与IL-1β组比较,Nano-Dex+IL-1β组Col2a1基因及蛋白表达上调,ACAN基因表达上调,IL-1β、IL-6、MMP3、MMP13基因表达下调,MMP13、P65、IL-6、IL-1β和Caspase 3蛋白表达均下调(均P<0.05)。免疫荧光结果显示,IL-1β+Nano-Dex组MMP13的荧光强度明显低于IL-1β组(P<0.05)。结论:Nano-Dex能有效抑制IL-1β诱导的软骨细胞炎症。

钯锌合金纳米酶对炎症软骨细胞模型的影响

目的:探讨钯锌合金(PdZn/C)纳米酶对过氧化氢(H_(2)O_(2))诱导的炎症软骨细胞模型的抗炎作用。方法:合成PdZn/C纳米酶并对其进行表征。检测PdZn/C纳米酶模拟超氧化物岐化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)活性的能力。体外通过CCK-8法检测PdZn/C纳米酶与软骨细胞的生物相容性。将过氧化氢(H_(2)O_(2))诱导的炎症软骨细胞与PdZn/C纳米酶共培养,通过活性氧(ROS)荧光探针评估炎症软骨细胞的ROS水平,免疫荧光实验检测炎症软骨细胞中白细胞介素(IL)-1β与肿瘤坏死因子(TNF)-α蛋白水平表达。结果:透射电子显微镜(TEM)、X射线衍射(XRD)、Zeta电位证实PdZn/C纳米酶合成成功。CCK-8实验结果证实PdZn/C纳米酶有着良好的生物相容性。PdZn/C纳米酶可较好地模拟SOD和CAT活性。PdZn/C纳米酶能够降低H_(2)O_(2)诱导的炎症软骨细胞模型中的ROS水平及IL-1β和TNF-α蛋白表达水平。结论:PdZn/C纳米酶有着良好的生物相容性,可减轻软骨细胞的炎症反应,是一种有着良好前景的抗炎纳米材料。

基于网络药理学和分子对接探究莪术-三棱药对治疗前列腺癌的作用机制

目的探究莪术-三棱药对治疗前列腺癌(prostate cancer,PCa)的药物活性成分、核心靶点及分子机制。方法基于HERB和PubChem数据库获取莪术-三棱的药物活性成分和作用靶点,利用Genecards、OMIM、PhamGkb、TTD、DrugBank数据库获取PCa疾病靶点,药物靶点和疾病靶点取交集得到共同靶点。采用Cytoscape 3.9.0软件构建莪术-三棱活性成分与PCa靶点网络,将交集靶点导入String数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络(protein-protein interaction network,PPI),对潜在靶点进行基因本体(gene gontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,最后利用AutoDockTools 1.5.7等软件对核心靶点和药物关键活性成分进行分子对接验证。结果共筛选得到72种药物活性成分和760个有效活性成分靶点,PCa疾病相关靶点13001个,交集靶点为659个。药物关键核心成分为莪术双环烯酮、无患子皂苷B、花椒麻素、(2s)-3',4'-亚甲二氧基-5,7-二甲氧基黄酮、芹菜素、天人菊内酯、山奈酚、三棱酸、脱甲氧姜黄素以及5,7,2',3'-四羟基黄酮。PPI网络分析得到SRC、TP53、MAPK3、MAPK1、STAT3、HSP90AA1、AKT1、PIK3R1、RHOA、GRB2核心靶点。GO和KEGG富集分析显示,莪术-三棱治疗PCa主要涉及细胞增殖、凋亡、迁移和信号转导等信号通路。分子对接结果显示核心靶点与活性成分之间存在较强的结合力。结论本研究揭示了莪术-三棱抗PCa的关键活性成分及其与潜在靶点的相互作用,凸显了其多成分、多靶点相互作用的特性,为深入研究莪术-三棱治疗PCa提供了有价值的参考。

基于网络药理和分子对接探讨莪术-三棱药对治疗卵巢癌的作用机制

目的探索莪术-三棱药对治疗卵巢癌的有效活性成分与分子生物学机制。方法通过HERB及PubChem数据库检索并筛选出莪术及三棱的有效活性成分和相应的作用靶点;运用Therapeutic Targets、OMIM及GeneCard等数据库检索卵巢癌的疾病靶点。运用Cytoscape 3.9.0软件绘制药物-成分-靶点网络图,采用STRING数据库及Cytoscape 3.9.0构建PPI网络图,进而使用Cytoscape中MCODE插件筛选出排名前10的核心靶点;使用R 4.2.2对作用靶点进行GO及KEGG通路富集分析;最后使用Auto Dock Vina等软件进行分子对接,验证核心成分与核心靶点的相互作用。结果筛选出了72种活性成分、760个作用靶点,莪术-三棱药对与卵巢癌共同靶基因有617个。核心成分为多梗白菜菊素、天人菊内酯、大花旋覆花素、山奈酚,PPI网络揭示了其主要的靶点,包括MAPK1、MAPK3、JAK1、JAK3、STAT3、MAP2K1、IL6、TYK2、KRAS以及SRC。KEGG富集分析显示共涉及186条通路,根据P<0.05提取与卵巢癌关联紧密的30条通路,主要包括cAMP信号通路、癌症中的蛋白聚糖通路、PI3K-AKT信号通路等。分子对接结果表明,活性成分与核心靶点之间展现出良好的结合亲和性。结论三棱及莪术药对在卵巢癌的综合治疗方面具有多成分、多靶点及多通路的特征,为该药对在临床中的应用提供了信息支撑。

基于肥大细胞相关基因的膀胱癌预后模型构建

目的分析肥大细胞相关基因与膀胱癌预后间的关系,筛选预后关键基因,构建膀胱癌预后风险模型。方法利用肥大细胞批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据提取差异基因,并进行KEGG、GO分析与基因集富集分析(GSEA)。通过查阅文献获得膀胱癌单细胞测序内的肥大细胞特征基因。选取共有基因,使用Lasso回归与多因素COX回归筛选关键预后基因,基于风险评分,将患者分为高风险组和低风险组。最后通过单因素与多因素COX回归分析,结合风险评分与多个独立预后因素共同开发列线图以预测膀胱癌患者的生存率。结果构建预后模型的五个基因是WDR45B、EI24、NCOR1、VEGFA和RNF19A,五个基因成功将患者分为高风险组和低风险组。相较于低风险组,高风险组患者生存预后显著变差。同时成功在GSE31864数据验证模型效能。此外,在整合T/N分期、风险评分和年龄而构建的列线图,在膀胱癌患者生存预后方面具有良好的预测性。结论本研究提出一种基于膀胱癌患者肥大细胞五个基因的预后风险模型,可帮助临床医生评估预后情况,为膀胱癌患者提供个性化治疗建议。

生物信息学筛选骨肉瘤关键基因ITGA3及差异表达验证

目的:生物信息学分析筛选出骨肉瘤关键基因,探讨骨肉瘤潜在分子标记物。方法:从GEO数据库中下载GSE14359、GSE16088、GSE160913个数据库集,利用R语言“SVA”软件包进行合并;差异分析利用R语言“limma”软件包进行分析,并对差异基因运用R语言“clusterProfiler”进行GO和KEGG富集分析。随后,对最显著富集的KEGG通路基因进行筛选出最关键的Top5基因并进行生存分析,筛选对预后具有影响意义的关键基因,然后运用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)验证最关键基因的差异性表达。结果:通过数据合并共得到12547个基因的数据集,分析出723个表达基因有差异;差异基因的KEGG富集最显著通路是PI3K-Akt信号通路,并且该通路的排名前5的关键基因为ITGA3、ITGA4、ITGAV、COL1A1、COL1A2。排名前5的关键基因中,与ITGA3低表达组比较,ITGA3高表达组生存预后较好(P<0.05),在143B、MNNG、U2OS 3个骨肉瘤细胞系中ITGA3相对表达量低于正常成骨细胞系hFOB1.19(P<0.01)。结论:ITGA3在骨肉瘤中呈现出低表达,这可能成为预测骨肉瘤患者预后的潜在生物标记物。

山竹果皮提取物Garcinone E对鼻咽癌S18细胞迁移和侵袭的影响及相关机制研究

目的探讨山竹果皮提取物Garcinone E对鼻咽癌S18细胞迁移和侵袭的影响及相关机制。方法使用不同浓度的Garcinone E处理S18细胞,通过CCK-8法检测细胞活力,通过Transwell实验检测S18细胞迁移、侵袭能力。通过Western blot实验检测S18细胞转移相关蛋白[组织金属蛋白酶抑制剂1(TIMP1)、组织金属蛋白酶抑制剂2(TIMP2)、基质金属蛋白酶2(MMP-2)、基质金属蛋白酶9(MMP-9)]、周期相关蛋白[细胞周期依赖性蛋白激酶抑制因子1A(p21)、周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、周期蛋白依赖性激酶6(CDK6)、周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)、细胞周期蛋白B1(cyclin B1)]及自噬相关蛋白[微管相关蛋白1轻链3β(LC3B)、泛素结合蛋白p62(SQSTM1/p62)、苄氯素1(beclin-1)、自噬相关蛋白3(Atg3)]的表达水平。结果Garcinone E能够显著抑制S18细胞增殖(P<0.05),半抑制浓度(IC 50)=(3.34±0.03)μmol/L,并对S18细胞的迁移和侵袭能力均具有抑制作用(P<0.05)。Garcinone E可以上调S18细胞的TIMP1、TIMP2、p21、LC3B、SQSTM1/p62、beclin-1和Atg3蛋白的表达水平(P<0.05),下调MMP-2、MMP-9、CDK2、CDK6、CDK7和cyclin B1蛋白的表达水平(P<0.05)。结论Garcinone E能抑制鼻咽癌S18细胞的转移和侵袭能力,阻滞细胞周期,抑制细胞自噬,可作为鼻咽癌化疗药物研发的候选先导化合物。