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ABCC4基因表达对前列腺癌免疫微环境的影响
1
作者
张清元
刘敏
+5 位作者
陆江婷
袁宗泽
苑佳兴
庞福智
廖金玲
陈阳
《广西医科大学学报》
CAS
2023年第2期245-253,共9页
目的:探究ATP结合盒亚家族C成员4(ABCC4)基因在前列腺癌(PCa)中的表达,分析ABCC4对PCa肿瘤免疫微环境(TME)的影响。方法:使用GEO数据库中的GEO2R计算PCa与癌旁组织的差异表达基因。通过GEPIA2数据库探究ABCC4基因在PCa中的表达。将从UCS...
目的:探究ATP结合盒亚家族C成员4(ABCC4)基因在前列腺癌(PCa)中的表达,分析ABCC4对PCa肿瘤免疫微环境(TME)的影响。方法:使用GEO数据库中的GEO2R计算PCa与癌旁组织的差异表达基因。通过GEPIA2数据库探究ABCC4基因在PCa中的表达。将从UCSC Xena数据库下载的TCGA中的PCa数据分为ABCC4基因高、低表达组。使用clusterprofafiler R包进行GO分析和基因集富集分析(GSEA)。利用TISIDB数据库、ESTIMATE和CIBERSORT分析ABCC4基因表达与免疫指标的相关性。结果:PCa组织中ABCC4基因表达高于癌旁组织(P<0.05)。ABCC4高表达组PCa患者生存能力较差。在GSEA中,ABCC4低表达组中Th1和Th2细胞分化通路被激活,ABCC4基因可能在PCa的TME中起作用。TISIDB分析证实ABCC4基因表达与NK和T细胞丰度呈负相关关系(P<0.05)。ABCC4基因高表达与免疫检查点基因低表达有关。ESTIMATE和CIBERSORT分析表明,ABCC4基因表达可抑制PCa的免疫细胞浸润,尤其CD8 T、NK和Tregs细胞。免疫荧光实验显示,ABCC4蛋白表达低可诱导更多的CD8 T细胞浸润(P<0.05)。结论:ABCC4基因调控PCa的TME的免疫细胞浸润,尤其对T细胞和NK细胞浸润有重要作用,从而影响PCa的发生及其免疫治疗。
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关键词
前列腺癌
ATP结合盒亚家族C成员4
免疫浸润
肿瘤免疫微环境
生物信息学
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职称材料
题名
ABCC4基因表达对前列腺癌免疫微环境的影响
1
作者
张清元
刘敏
陆江婷
袁宗泽
苑佳兴
庞福智
廖金玲
陈阳
机构
广西医科大学
第一附属医院泌尿外科
广西医科大学基因组与个性化医学研究中心广西基因组与个性化医学重点实验室
广西医科大学
学生工作处
出处
《广西医科大学学报》
CAS
2023年第2期245-253,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81901538,No.82060145)
国家大学生创新创业训练计划项目(No.202110598044)。
文摘
目的:探究ATP结合盒亚家族C成员4(ABCC4)基因在前列腺癌(PCa)中的表达,分析ABCC4对PCa肿瘤免疫微环境(TME)的影响。方法:使用GEO数据库中的GEO2R计算PCa与癌旁组织的差异表达基因。通过GEPIA2数据库探究ABCC4基因在PCa中的表达。将从UCSC Xena数据库下载的TCGA中的PCa数据分为ABCC4基因高、低表达组。使用clusterprofafiler R包进行GO分析和基因集富集分析(GSEA)。利用TISIDB数据库、ESTIMATE和CIBERSORT分析ABCC4基因表达与免疫指标的相关性。结果:PCa组织中ABCC4基因表达高于癌旁组织(P<0.05)。ABCC4高表达组PCa患者生存能力较差。在GSEA中,ABCC4低表达组中Th1和Th2细胞分化通路被激活,ABCC4基因可能在PCa的TME中起作用。TISIDB分析证实ABCC4基因表达与NK和T细胞丰度呈负相关关系(P<0.05)。ABCC4基因高表达与免疫检查点基因低表达有关。ESTIMATE和CIBERSORT分析表明,ABCC4基因表达可抑制PCa的免疫细胞浸润,尤其CD8 T、NK和Tregs细胞。免疫荧光实验显示,ABCC4蛋白表达低可诱导更多的CD8 T细胞浸润(P<0.05)。结论:ABCC4基因调控PCa的TME的免疫细胞浸润,尤其对T细胞和NK细胞浸润有重要作用,从而影响PCa的发生及其免疫治疗。
关键词
前列腺癌
ATP结合盒亚家族C成员4
免疫浸润
肿瘤免疫微环境
生物信息学
Keywords
prostate cancer
ATP binding box subfamily C Member 4
immune infiltration
tumor immune microenvironment
bioinformatics
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ABCC4基因表达对前列腺癌免疫微环境的影响
张清元
刘敏
陆江婷
袁宗泽
苑佳兴
庞福智
廖金玲
陈阳
《广西医科大学学报》
CAS
2023
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