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基于肿瘤免疫循环相关基因的宫颈癌预后模型的构建和验证
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作者 黄春桃 文天斌 +2 位作者 吕思慧 梁金兰 王琪 《中国癌症防治杂志》 CAS 2023年第4期398-405,共8页
目的基于肿瘤免疫循环相关基因(tumor immune cycle related-genes,TICRGs)构建宫颈癌预后模型,并检测临床组织样本中建模因子的表达以验证模型效能。方法将TCGA数据库中宫颈癌样本转录组数据作为训练集,GEO数据库的宫颈癌基因表达谱GSE... 目的基于肿瘤免疫循环相关基因(tumor immune cycle related-genes,TICRGs)构建宫颈癌预后模型,并检测临床组织样本中建模因子的表达以验证模型效能。方法将TCGA数据库中宫颈癌样本转录组数据作为训练集,GEO数据库的宫颈癌基因表达谱GSE44001作为验证集。差异比较肿瘤样本与正常宫颈组织转录组数据,获得宫颈癌TICRGs,通过单因素Cox回归筛选预后相关的TICRGs,LASSO-Cox算法构建宫颈癌预后模型。采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下的面积(area under the curve,AUC)和一致性指数(concordance index,C-index)对模型进行评价。用GSE44001数据集对模型进行外部验证,多色荧光免疫组化实验验证模型的可行性。结果本研究构建了由CCL17、CXCL3和VTCN1组成的宫颈癌预后模型,生存分析显示高风险组与低风险组预后差异有统计学意义(P<0.001)。AUC和C-index提示该模型具有中等程度的预测效能;多因素Cox回归显示风险评分是宫颈癌患者的独立预后因素(P=0.010);免疫浸润分析显示CD8+T细胞是宫颈癌预后的保护因子(P=0.017)。多色荧光免疫组化实验结果构建验证模型与预后模型结果一致。结论由肿瘤免疫循环相关基因CCL17、CXCL3和VTCN1构建的预后模型对预测宫颈癌患者预后具有中等程度的预测效能。 展开更多
关键词 宫颈癌 预后模型 肿瘤免疫循环相关基因 多色荧光免疫组化
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