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基于单细胞RNA测序探讨膀胱癌患者外周血单个核细胞特征的研究
被引量:
1
1
作者
包梦颖
曾燕玉
+7 位作者
代艳
黄荣
毛星宁
颜赟坤
张庆云
郭冰倩
叶雨
莫曾南
《广西医科大学学报》
CAS
2021年第4期636-643,共8页
目的:探讨利用单细胞RNA测序技术研究膀胱癌患者外周血特征的效果,为研究膀胱癌患者外周血提供新的策略。方法:分别收集膀胱癌患者和健康人的外周血,提取外周血单个核细胞(PBMC)进行单细胞RNA测序。对测序结果进行差异基因分析,根据基...
目的:探讨利用单细胞RNA测序技术研究膀胱癌患者外周血特征的效果,为研究膀胱癌患者外周血提供新的策略。方法:分别收集膀胱癌患者和健康人的外周血,提取外周血单个核细胞(PBMC)进行单细胞RNA测序。对测序结果进行差异基因分析,根据基因表达情况降维聚类分群,定义各细胞亚群的细胞类型和比较各亚群之间的差异。结果:单细胞RNA测序检测到健康人PBMC有7523个细胞,膀胱癌患者PBMC有5289个细胞,根据上述细胞的基因的表达情况将细胞聚类分为15个亚群。健康人和膀胱癌患者的PBMC细胞类型具有相似性但细胞亚型的分布具有差异性,尤其是CD8^(+)和CD4^(+)T细胞,并且在膀胱癌患者PBMC中发现了膀胱癌患者特有的细胞亚群。结论:单细胞RNA测序能够实现对PBMC做到精细分群,通过展示来自健康人和膀胱癌患者PBMC的表达谱,能够更精准的反映PBMC细胞间的差异,为研究膀胱癌患者PBMC提供了一个新的研究方案。
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关键词
单细胞RNA测序
外周血单个核细胞
膀胱癌
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职称材料
题名
基于单细胞RNA测序探讨膀胱癌患者外周血单个核细胞特征的研究
被引量:
1
1
作者
包梦颖
曾燕玉
代艳
黄荣
毛星宁
颜赟坤
张庆云
郭冰倩
叶雨
莫曾南
机构
广西医科大学
基因组
与个体化
医学
研究
中心
广西医科大学
广西
生物医药协同创新中心
广西
-东盟重大疾病防治协同创新中心
广西医科大学广西基因组与个体化医学研究重点实验室
广西医科大学
广西
基因组
与个体化
医学
研究
协同创新中心
广西医科大学
第二附属医院
广西医科大学
附属肿瘤医院
出处
《广西医科大学学报》
CAS
2021年第4期636-643,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81770759)
国家重点研究开发资助项目(No.2017YFC0908000)
广西基因组与个体化医学研究重点实验室资助项目(No.16-380-54,No.117-259-45,No.119-050-22,No.119-185-33,No.120-065-33)。
文摘
目的:探讨利用单细胞RNA测序技术研究膀胱癌患者外周血特征的效果,为研究膀胱癌患者外周血提供新的策略。方法:分别收集膀胱癌患者和健康人的外周血,提取外周血单个核细胞(PBMC)进行单细胞RNA测序。对测序结果进行差异基因分析,根据基因表达情况降维聚类分群,定义各细胞亚群的细胞类型和比较各亚群之间的差异。结果:单细胞RNA测序检测到健康人PBMC有7523个细胞,膀胱癌患者PBMC有5289个细胞,根据上述细胞的基因的表达情况将细胞聚类分为15个亚群。健康人和膀胱癌患者的PBMC细胞类型具有相似性但细胞亚型的分布具有差异性,尤其是CD8^(+)和CD4^(+)T细胞,并且在膀胱癌患者PBMC中发现了膀胱癌患者特有的细胞亚群。结论:单细胞RNA测序能够实现对PBMC做到精细分群,通过展示来自健康人和膀胱癌患者PBMC的表达谱,能够更精准的反映PBMC细胞间的差异,为研究膀胱癌患者PBMC提供了一个新的研究方案。
关键词
单细胞RNA测序
外周血单个核细胞
膀胱癌
Keywords
single cell RNA sequencing
peripheral blood mononuclear cells
bladder cancer
分类号
R737.1 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于单细胞RNA测序探讨膀胱癌患者外周血单个核细胞特征的研究
包梦颖
曾燕玉
代艳
黄荣
毛星宁
颜赟坤
张庆云
郭冰倩
叶雨
莫曾南
《广西医科大学学报》
CAS
2021
1
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