数据库分析和验证AURKA为乳腺癌的主要生物标志物

筛选并分析乳腺癌的潜在的枢纽基因。方法 GEO数据库下载 5个乳腺癌基因表达数据集,筛选乳腺癌中的差异表达基因,绘制韦恩图;构建蛋白互作网络PPI,筛选TOP10枢纽基因;GO和KEGG通路分析枢纽基因的功能和通路。分子对接评估10个枢纽基因与刺芒柄花素的结合作用。QPCR检测AURKA在不同乳腺癌细胞株中的表达水平。QPCR检测刺芒柄花素处理后乳腺癌MDA-MB-231细胞中AURKA的表达水平。结果 筛选得到了157个差异基因,确定TOP10的枢纽基因;GO和KEGG通路分析结果显示,TOP10枢纽基因与细胞周期和有丝分裂密切相关,并且主要富集在AMPK信号通路上。分子对接结果显示AURKA结果最优。QPCR结果显示,以正常乳腺细胞MCF-10A为对照,AURKA在乳腺癌细胞MDA-MB-231、MCF-7、HCC-1937的表达水平明显上调。QPCR检测刺芒柄花素处理后MDA-MB-231细胞AURKA的表达显著降低。结论 生物信息学方法筛选可能参与乳腺癌发生发展的枢纽基因,AURKA可能是乳腺癌的主要生物标志物,刺芒柄花素可以下调乳腺癌细胞中AURKA的表达水平。