基于网络药理学的杠柳苷元治疗骨质疏松的作用机制

基于网络药理学分析杠柳苷元预防骨质疏松症的作用机制。方法:通过有机小分子生物活性数据库Pubchem得到的杠柳苷元的简化分子线性输入系统SMILES结构式,然后利用小分子药物靶点预测SwissTargetPrediction数据库预测其作用的潜在靶标。应用疾病相关的基因与突变位点数据库DisGeNET获取与骨质疏松症相关的疾病靶点。在进行比对分析后,获取杠柳苷元作用于骨质疏松的交集靶点,运用蛋白互作网络数据库STRING数据库建立活性成分-疾病靶标的蛋白相互作用网络(PPI),然后使用R语言通路富集分析clusterProfiler包(版本4.2.1)对交集靶点进行生物学功能分析(GO)及通路富集分析(KEGG)。结果:经SwissTargetPrediction数据库预测,获得杠柳苷元有123个潜在作用靶点,经DisGeNET数据库预测,获得骨1089个骨质疏松靶点,取交集得到31个交集靶点。通过PPI网络筛选出JAK-STAT3,MAPK等关键靶点。GO分析显示生物功能760个,涉及细胞内信号转导、细胞增殖、炎症反应等。KEGG分析显示通路132条,其中MAPK信号通路、JAK-STAT3信号通路等可能为治疗骨质疏松症的关键通路。结论:杠柳苷元可能通过抑制破骨细胞增值和功能,发挥对骨质疏松症的防治作用,MAPK信号通路以及JAK-STAT3信号通路在此过程中可能发挥关键作用,为今后分子机制的深入研究以及相应临床药物的开发提供了参考。

探索莲子心活性成分龙血素A在网络药理学和体外细胞实验中防治骨关节炎的作用机制

基于网络药理学和体外细胞实验探索莲子心活性成分龙血素A防治OA的可能机制。方法 使用疾病相关的基因数据库GeneCards获取与OA相关的靶点,再利用中草药系统药理平台TCSMP得到中药莲子心的活性成分和相关靶点,运用Cytoscape_v3.8.0软件筛选莲子心活性成分-靶点网络中的中心靶点。使用R语言clusterProfiler包对交集靶点进行GO及KEGG分析。通过细胞实验评估莲子心活性提取物龙血素A对促炎因子的影响。结果 通过数据分析得到OA与莲子心的交集靶点共126个。运用软件Cytoscape_v3.8.0筛选出蛋白交互网络中的9个中心靶点。通过GO分析得到与功能、参与的生物途径及细胞中的定位有关的共计2532个。KEGG通路富集分析显示通路155条。细胞实验验证莲子心活性提取物龙血素A可抑制促炎因子Il-1β和Tnf-α的表达。结论 莲子心活性提取物龙血素A可能通过抑制促炎因子的表达从而防治OA。