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BIRC5 mRNA及蛋白表达水平在肺腺癌组织中的临床病理意义研究
1
作者
林锐
李国盛
+4 位作者
党裔武
杨达平
曾能永
孔晋亮
陈罡
《岭南现代临床外科》
2023年第6期490-497,共8页
目的 探讨BIRC5在LUAD组织中的表达及其临床病理意义。方法 收集GEO、TCGA,以及GTEx等高通量数据集中的BIRC5 mRNA在LUAD和非癌肺组织中的表达数据,计算SMD及sROC的AUC;使用Kaplan-Meier曲线研究BIRC5表达和LUAD患者预后的关联;使用LUA...
目的 探讨BIRC5在LUAD组织中的表达及其临床病理意义。方法 收集GEO、TCGA,以及GTEx等高通量数据集中的BIRC5 mRNA在LUAD和非癌肺组织中的表达数据,计算SMD及sROC的AUC;使用Kaplan-Meier曲线研究BIRC5表达和LUAD患者预后的关联;使用LUAD组织芯片进行免疫组织化学检测BIRC5蛋白表达水平。在高通量数据集中,对BIRC5相关的上调基因进行GO功能注释,GSEA,以及KEGG信号通路分析。使用CIBERCORT算法探究BIRC5表达与LUAD的免疫微环境的关系。结果 全球范围内,共纳入114个高通量数据集,分别来自22个国家或地区,包含3897例LUAD和2993非癌肺组织,最后合并为37个平台。与非癌肺组织相比,BIRC5 mRNA在LUAD组织中表达水平显著升高(SMD=1.36,AUC=0.90);高表达BIRC5的LUAD患者的总体生存期显著低于低表达者(hazard ratio=2.017,P<0.05);同时,组织芯片部分实验发现226例LUAD中BIRC5蛋白水平显著表达上调(P<0.05)。LUAD中BIRC5相关基因可能参与构成染色体等细胞成分,涉及DNA复制、细胞核分裂及染色体分离等生物学过程,并发挥ATP酶活性以及DNA解旋酶活性等分子功能。此外,BIRC5高表达组具有更高的免疫细胞浸润水平(P<0.05)。结论 高表达的BIRC5可能通过多个通路和免疫因素发挥促进LUAD的发生和进展。
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关键词
BIRC5
肺腺癌
组织芯片
预后
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职称材料
题名
BIRC5 mRNA及蛋白表达水平在肺腺癌组织中的临床病理意义研究
1
作者
林锐
李国盛
党裔武
杨达平
曾能永
孔晋亮
陈罡
机构
广西医科大学
第一
附属
医院
病理科
广西医科大学
第一
附属
医院
胸心外科
广西医科大学
第八
附属
医院
/贵港市
人民医院
病理科
广西医科大学附属钦州市第二人民医院呼吸与危重症医学科
广西医科大学
第一
附属
医院
呼吸
与危重症
医学科
出处
《岭南现代临床外科》
2023年第6期490-497,共8页
文摘
目的 探讨BIRC5在LUAD组织中的表达及其临床病理意义。方法 收集GEO、TCGA,以及GTEx等高通量数据集中的BIRC5 mRNA在LUAD和非癌肺组织中的表达数据,计算SMD及sROC的AUC;使用Kaplan-Meier曲线研究BIRC5表达和LUAD患者预后的关联;使用LUAD组织芯片进行免疫组织化学检测BIRC5蛋白表达水平。在高通量数据集中,对BIRC5相关的上调基因进行GO功能注释,GSEA,以及KEGG信号通路分析。使用CIBERCORT算法探究BIRC5表达与LUAD的免疫微环境的关系。结果 全球范围内,共纳入114个高通量数据集,分别来自22个国家或地区,包含3897例LUAD和2993非癌肺组织,最后合并为37个平台。与非癌肺组织相比,BIRC5 mRNA在LUAD组织中表达水平显著升高(SMD=1.36,AUC=0.90);高表达BIRC5的LUAD患者的总体生存期显著低于低表达者(hazard ratio=2.017,P<0.05);同时,组织芯片部分实验发现226例LUAD中BIRC5蛋白水平显著表达上调(P<0.05)。LUAD中BIRC5相关基因可能参与构成染色体等细胞成分,涉及DNA复制、细胞核分裂及染色体分离等生物学过程,并发挥ATP酶活性以及DNA解旋酶活性等分子功能。此外,BIRC5高表达组具有更高的免疫细胞浸润水平(P<0.05)。结论 高表达的BIRC5可能通过多个通路和免疫因素发挥促进LUAD的发生和进展。
关键词
BIRC5
肺腺癌
组织芯片
预后
Keywords
BIRC5
lung adenocarcinoma
tissue chip,prognosis
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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作者
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1
BIRC5 mRNA及蛋白表达水平在肺腺癌组织中的临床病理意义研究
林锐
李国盛
党裔武
杨达平
曾能永
孔晋亮
陈罡
《岭南现代临床外科》
2023
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