90份有棱丝瓜种质资源熟性鉴定

鉴定90份有棱丝瓜(Luffa acutangula Roxb.)品种熟性,在同等水肥和统一田间管理下,测定90份有棱丝瓜第一雄花节位、第一雌花节位、始花期、第一坐果节位、始收期、早期产量6个熟性相关性状,对熟性相关性状进行相关性分析,了解各性状间联系,并通过聚类分析将有棱丝瓜种质进行分类。结果表明,不同有棱丝瓜种质熟性差异较大,6个熟性相关性状的平均变异系数为38.59%,早期产量变异系数最高,为64.68%,其次为第一雌花节位,为45.96%;相关性分析表明熟性相关性状间存在较强关联;将有棱丝瓜种质熟性相关性状进行聚类分析,可分为早熟类群、中熟类群和晚熟类群。

11份越夏香葱种质资源农艺性状鉴定及耐热性评价

为鉴定评价广西越夏香葱种质资源的农艺性状及耐热性,筛选出具有潜力的适宜广西夏秋季种植的香葱资源,本试验以从广西各香葱主产区收集的11份香葱种质资源为研究对象,开展夏季田间品比及鉴定筛选试验,同时对香葱种质农艺性状及耐热性采用主成分分析、聚类分析以及回归分析等方法进行综合评价。结果显示:通过农艺性状对比分析,筛选出灵香2号AF90、白头葱AF131、贺州钟山撒子葱AF65在越夏产量表现较佳。香葱农艺性状指标中数量性状指标变异系数分析显示单株质量、分蘖数2个指标变异较丰富,质量性状分布频率显示11份香葱种质材料质量性状分布较为广泛。主成分分析将原有19个农艺性状指标转化为6个综合因素指标,累计贡献率达到84.754%。通过聚类分析将耐热香葱种质分为强耐热性、中耐热性、弱耐热性种质3类,其中灵香2号AF90、白头葱AF131均为强耐热性种质,适宜在广西推广越夏栽培。通过逐步回归分析建立香葱耐热性评价的数学模型Y(耐热性)=7.376-0.001X1(产量),可用于后续耐热育种材料鉴定。

基于NCBI香葱转录组数据库的SSR标记开发

为了明确香葱转录组中SSR的总体分布特点,开发香葱EST-SSR标记用以香葱遗传多样性研究,本研究从NCBI数据库上获取葱属转录组数据(SRR3144570)并利用MISA软件筛选香葱转录组测序,共获得94805条转录本序列,检测出9511个SSR位点,SSR出现频率为10.03%。在搜索的6种SSR位点类型中,1~3个核苷酸重复类型为香葱SSR重复的主要类型(占98.63%),其中单核苷酸占55.80%、二核苷酸占21.32%、三核苷酸重复类型占21.51%。SSR重复基元主要有41种,其中以一核苷酸重复基元类型A/T(55.01%)、二核苷酸重复基元类型AC/GT(8.11%)和AT/AT(7.95%)频率最高。分析得到转录组SSR重复序列的长度在10~158 bp之间,平均长度为53.23 bp。根据这些SSR位点,利用Primer Premier 3.0进行引物开发,共设计出9492对SSR引物。随机选取200对引物,其中有197对能进行有效扩增,占选取SSR引物对的98.5%,同时37对引物在6份表型差异显著的香葱种质资源中呈现多态性。采用该37对引物对56份香葱种质鉴定多样性,发现在相似系数为0.68时,可将56份香葱种质分为4个类群,聚类结果与表型结果一致。以上结果表明,基于NCBI数据库香葱转录组测序开发的SSR标记丰富了香葱的分子标记数量,为香葱遗传多样性分析、种质资源鉴定提供充足可靠的标记来源。