TCR DNA疫苗在自身免疫病中的研究进展

自身免疫病(AID)是由于机体对自身抗原失去耐受,免疫系统攻击自身组织或细胞引起组织器官或细胞损伤,并出现一定临床表现的疾病。研究证明,在AID的治疗中,致病性T细胞可以被TCR疫苗选择性抑制或杀伤,应用前景很广阔。本文从TCR疫苗的作用机制、相关疾病以及疫苗的安全性等方面,对其在AID领域的研究现状进行简要综述。

基于16S rDNA测序检测原发性胆汁性胆管炎患者肠道菌群的变化

目的研究原发性胆汁性胆管炎(PBC)患者的肠道菌群丰度和多样性。方法收集2018年1月至2019年1月期间浙江大学医学院附属第一医院收治的9例原发性胆汁性胆管炎患者(另有8名健康者作为健康对照),分别提取肠道菌群DNA,采用16S rDNA高通量测序方法扩增V3~V4区序列相应基因片段,建库测序及生物信息学分析。结果Alpha多样性分析中,两组间Ace指数、Chao指数、Simpson指数、Shannon指数比较,差异无统计学意义(P>0.05)。通过OTU聚类和物种注释,发现两组间部分菌群的丰度比较,差异有统计学意义(P<0.05)。与健康对照组(NC)相比,原发性胆汁性胆管炎组(PBC)解纤维素根瘤菌(Cellulosilyticum)、霍尔德曼氏菌(Holdemanella)、毛螺菌(Lachnospiraceae)、乳酸乳球菌(Lactococcus)和摩根菌(Morganella)降低,亨盖特拉菌(Hungatella)显著升高。此外,采用实时定量PCR技术检测PBC组和NC组肠道中大肠杆菌的含量,发现PBC组中的含量显著高于NC组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论与健康对照组(NC)相比,原发性胆汁性胆管炎组(PBC)在一定水平上肠道菌群发生了改变。进一步分析肠道菌群的变化,有望为研究原发性胆汁性胆管炎的发生发展和寻找新的敏感微生物标志物提供新的思路。

异槲皮苷调控PTP1B改善胰岛素抵抗的网络药理学研究及体外实验验证

目的采用网络药理学法及分子对接技术探析异槲皮苷改善胰岛素抵抗的分子机制,并通过体外实验研究异槲皮苷对胰岛素抵抗的干预作用及机制。方法利用PubChem、PharmMapper、GEO、CTD、GeneCards、OMIM等多个数据库筛选异槲皮苷活性成分及胰岛素抵抗相关靶点;采用Cytoscape软件将异槲皮苷治疗胰岛素抵抗的潜在靶点构建蛋白质相互作用(PPI)网络,并根据度值筛选核心靶点。利用基因本体(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析寻找与靶点蛋白相关的生物学通路,采用AutoDock Tools软件模拟分子对接,预测异槲皮苷与关键靶点的结合度。体外实验采用异槲皮苷干预蛋白酪氨酸磷酸酶1B(PTP1B)质粒转染HepG2细胞,检测不同浓度异槲皮苷干预后PTP1B的活性;构建PTP1B质粒转染HepG2胰岛素抵抗细胞模型,给予异槲皮苷(40μmol/L)干预,葡萄糖氧化酶法、qRT-PCR、Western Blotting法检测PTP1B等相关因子的表达。结果网络药理学筛选得到异槲皮苷改善胰岛素抵抗的交集靶点21个,富集到GO条目2761个,主要涉及胰岛素受体信号通路、糖原生物合成过程的调控等,富集到KEGG通路89条,涉及包括胰岛素信号通路、胰岛素抵抗、磷脂酰肌醇-3-羟激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、磷酸腺苷活化的蛋白激酶(AMPK)信号通路等。分子对接结果显示,异槲皮苷与靶点PTP1B、磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1(PDPK1)、胰岛素受体(INSR)、糖原合酶激酶3β(GSK3β)、AKT2均有一定的结合活性。体外实验结果显示,异槲皮苷能有效抑制PTP1B活性,降低PTP1B过表达HepG2胰岛素抵抗细胞中PTP1B、GSK3β的表达,升高胰岛素受体底物1(IRS-1)、葡萄糖转运蛋白-1(GLUT-1)等因子的表达,改善细胞胰岛素抵抗。结论异槲皮苷可能通过抑制PTP1B调控PI3K/Akt信号通路因子活性改善胰岛素抵抗。

广西桂林地区4580例遗传咨询患者外周血淋巴细胞染色体核型检测结果分析

分析广西桂林地区遗传咨询患者外周血淋巴细胞染色体核型异常率及类型,探讨染色体异常与不孕不育、反复流产、不良孕史等疾病的相关性。方法:采用外周血淋巴细胞培养方法制备染色体标本,G显带核型分析,分析染色体核型异常率及类型。结果:4580例遗传咨询患者共检出异常核型322例,异常率为7.03%。男性异常核型112例,异常率为2.44%,其中结构异常、数目异常和染色体多态分别为22例(19.64%)、19例(16.96%)和71例(63.40%);女性异常核型210例,异常率为4.59%,女性异常核型中,结构异常、其中数目异常和染色体多态分别为15例(7.14%)、112例(53.33%)和83例(39.53%)。常染色体异常核型185例,异常率为57.45%,其中男、女常染色体异常核型分别为87例(47.02%)和98例(52.98%);性染色体异常核型137例,异常率为42.55%,其中男、女性染色体异常核型分别为25例(18.25%)和112例(81.75%)。常染色体核型异常率高于性染色体核型异常率。结论:染色体异常是引起不孕不育、复发性流产、不良孕史等多种疾病的重要原因之一,对这些患者进行染色体核型分析,对降低染色体异常婴儿出生率、提高出生人口素质具有重要意义。

基于生物信息学筛选胃癌预后相关lncRNAs

目的探讨胃癌预后相关lncRNAs,并构建胃癌预后相关lncRNAs风险模型。方法应用TCGA数据库下载胃癌数据集中lncRNAs表达谱及样本临床信息,首先采用单因素Cox回归筛选胃癌相关预后lncRNAs,其次用筛选后的lncRNAs进行Lasso预后风险模型的构建,Kaplan-Meier生存曲线对lncRNAs进行胃癌预后生存影响的评估,多因素Cox分析明确lncRNAs风险模型为胃癌预后的独立性因素,ROC曲线用来评估lncRNAs预后风险模型的预测准确率。结果筛选出14个胃癌预后相关的关键lncRNAs并构建风险模型,14-lncRNA风险模型可作为影响胃癌患者不良预后的独立性因素[HR 1.21(95%CI:1.05~1.40,P=0.011)];此外,训练集和测试集3年及5年生存期的ROC曲线AUC最大值分别为:0.743、0.837、0.868及0.993,表明14-lncRNA风险模型对胃癌的预后的判定敏感性及特异性均较高。结论构建的14-lncRNA风险模型可对胃癌患者的预后进行有效的判定,14个lncRNAs作为胃癌预后标志物具有重要的临床应用价值。