基于加权基因共表达网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)分析妊娠期糖尿病胎盘组织mRNA与孕前体重指数(Pre-pregnancy body mass index,BMI)的相关性。寻找胎盘糖、脂代谢的关键基因,探索妊娠期糖尿病防治的新靶...基于加权基因共表达网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)分析妊娠期糖尿病胎盘组织mRNA与孕前体重指数(Pre-pregnancy body mass index,BMI)的相关性。寻找胎盘糖、脂代谢的关键基因,探索妊娠期糖尿病防治的新靶点。2018年5~7月纳入广西壮族自治区妇幼保健院新阳院区孕妇39例,妊娠期糖尿病组18例,健康对照组21例。收集孕妇病历资料、胎盘组织、脐血样本。通过胎盘组织mRNA测序,进行基因网络与临床指标相关性分析。妊娠期糖尿病组的孕前BMI、收缩压、舒张压、口服糖耐量实验(oral glucose tolerance test,OGTT)血糖浓度较对照组的显著增高(P<0.05)。多因素logistic回归分析孕前BMI(OR=1.336,95%CI=1.078~1.655,P=0.008)。WGCNA分析提示胎盘基因表达模块MEdarkorange与孕前BMI具有密切相关性(r=0.33,P=0.04),将该模块进行基因本体(gene ontology,GO)与KEGG(kyotoencyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析,富集到糖、脂代谢以及氧化代谢相关关键通路,c-JUN、FOS、EGR1是该模块的关键基因。以上结果表明孕前高BMI是妊娠期糖尿病的独立危险因素,c-JUN、FOS、EGR1可能是妊娠期脂、糖代谢的关键基因。展开更多
文摘基于加权基因共表达网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)分析妊娠期糖尿病胎盘组织mRNA与孕前体重指数(Pre-pregnancy body mass index,BMI)的相关性。寻找胎盘糖、脂代谢的关键基因,探索妊娠期糖尿病防治的新靶点。2018年5~7月纳入广西壮族自治区妇幼保健院新阳院区孕妇39例,妊娠期糖尿病组18例,健康对照组21例。收集孕妇病历资料、胎盘组织、脐血样本。通过胎盘组织mRNA测序,进行基因网络与临床指标相关性分析。妊娠期糖尿病组的孕前BMI、收缩压、舒张压、口服糖耐量实验(oral glucose tolerance test,OGTT)血糖浓度较对照组的显著增高(P<0.05)。多因素logistic回归分析孕前BMI(OR=1.336,95%CI=1.078~1.655,P=0.008)。WGCNA分析提示胎盘基因表达模块MEdarkorange与孕前BMI具有密切相关性(r=0.33,P=0.04),将该模块进行基因本体(gene ontology,GO)与KEGG(kyotoencyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析,富集到糖、脂代谢以及氧化代谢相关关键通路,c-JUN、FOS、EGR1是该模块的关键基因。以上结果表明孕前高BMI是妊娠期糖尿病的独立危险因素,c-JUN、FOS、EGR1可能是妊娠期脂、糖代谢的关键基因。
