中国两地旋毛虫分离株COX1序列分析

目的:分析广西南丹和河南两地旋毛虫分离株COX1序列,鉴定两地旋毛虫的虫种。方法:分别提取2个分离株基因组DNA,PCR扩增COX1片段,并对扩增产物进行T-A克隆测序;应用相关软件分析序列的同源性、遗传距离,同时构建系统发生树,并与GenBank中已知旋毛虫种相应基因序列比较。结果:我国2个旋毛虫分离株和T.spiralis的COX1序列长度相同,为419bp;南丹和河南分离株与T.spiralis的相似度分别为99.0%和98.8%。南丹与河南分离株之间为99.8%;两地分离株与其它旋毛虫种的相似度低于90.8%。南丹和河南分离株与T.spiralis遗传距离分别为0.005、0.003。两地分离株之间的遗传距离为0.003,与其它旋毛虫的遗传距离均>0.101。2个系统发生树中,我国2个分离株与T.spiralis位于同一分支,自引导值分别为100和99。结论:推断广西、河南两地旋毛虫分离株均为T.spiralis。