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甘蔗割手密BAG基因家族的鉴定与表达分析
被引量:
1
1
作者
莫心怡
周海连
+3 位作者
何丹丹
王继斌
杨娟
王令强
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期1364-1378,共15页
BAG(Bcl-2 associated athanogene)在真核生物中是一种保守的辅助伴侣蛋白。本研究在甘蔗割手密(Saccharum spon-taneum)基因组中鉴定获得24个BAG基因,分布在19条染色体上,根据其系统发育关系可分为3个组。研究发现,全基因组复制或片段...
BAG(Bcl-2 associated athanogene)在真核生物中是一种保守的辅助伴侣蛋白。本研究在甘蔗割手密(Saccharum spon-taneum)基因组中鉴定获得24个BAG基因,分布在19条染色体上,根据其系统发育关系可分为3个组。研究发现,全基因组复制或片段复制是该家族的主要扩张方式。顺式作用元件预测分析表明,SsBAGs主要参与植物激素调节、非生物胁迫响应、光响应和植物生长发育等。转录表达谱分析表明,多数SsBAGs在茎中的表达量显著高于叶片中的,而在叶片的库源过渡区域的表达高于叶片其他区域的。此外,不同SsBAGs在干旱胁迫下的表达存在差异。亚细胞定位表明,ScBAG1a和ScBAG2a均定位于细胞质和细胞核,与生物信息学分析结果一致。值得指出的是,BAG蛋白的结构域和BAG基因的表达模式在甘蔗和水稻(Oryza sativa)中均相当保守。甘蔗BAG基因家族扩张所造成的家族成员功能冗余在一定程度上可能与甘蔗作为多年生作物的抗逆性、抗病性和再生性有关。本研究初步揭示了SsBAG基因在甘蔗割手密中的生长发育和逆境胁迫响应中发挥的功能,为进一步研究其作用机制奠定了基础。
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关键词
甘蔗割手密
BAG基因家族
基因表达
系统发育分析
基因鉴定
原文传递
题名
甘蔗割手密BAG基因家族的鉴定与表达分析
被引量:
1
1
作者
莫心怡
周海连
何丹丹
王继斌
杨娟
王令强
机构
亚热带农业生物资源保护与利用
国家
重点
实验
室
广西
甘蔗生物学重点
实验
室
广西大学植物科学国家级实验教育示范中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期1364-1378,共15页
基金
广西大学甘蔗专项科研项目(2022GZA001)资助。
文摘
BAG(Bcl-2 associated athanogene)在真核生物中是一种保守的辅助伴侣蛋白。本研究在甘蔗割手密(Saccharum spon-taneum)基因组中鉴定获得24个BAG基因,分布在19条染色体上,根据其系统发育关系可分为3个组。研究发现,全基因组复制或片段复制是该家族的主要扩张方式。顺式作用元件预测分析表明,SsBAGs主要参与植物激素调节、非生物胁迫响应、光响应和植物生长发育等。转录表达谱分析表明,多数SsBAGs在茎中的表达量显著高于叶片中的,而在叶片的库源过渡区域的表达高于叶片其他区域的。此外,不同SsBAGs在干旱胁迫下的表达存在差异。亚细胞定位表明,ScBAG1a和ScBAG2a均定位于细胞质和细胞核,与生物信息学分析结果一致。值得指出的是,BAG蛋白的结构域和BAG基因的表达模式在甘蔗和水稻(Oryza sativa)中均相当保守。甘蔗BAG基因家族扩张所造成的家族成员功能冗余在一定程度上可能与甘蔗作为多年生作物的抗逆性、抗病性和再生性有关。本研究初步揭示了SsBAG基因在甘蔗割手密中的生长发育和逆境胁迫响应中发挥的功能,为进一步研究其作用机制奠定了基础。
关键词
甘蔗割手密
BAG基因家族
基因表达
系统发育分析
基因鉴定
Keywords
Sugarcane Saccharum spontaneum
BAG gene family
Gene expression
Phylogenetic analysis
Gene identification
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘蔗割手密BAG基因家族的鉴定与表达分析
莫心怡
周海连
何丹丹
王继斌
杨娟
王令强
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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