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荧光标记微卫星技术用于凡纳滨对虾不同家系亲权关系鉴定
被引量:
5
1
作者
彭敏
陈秀荔
+5 位作者
赵永贞
陈晓汉
李咏梅
杨春玲
何苹萍
牛生洋
《水生态学杂志》
北大核心
2014年第4期60-67,共8页
应用荧光标记微卫星技术对凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)家系进行亲权鉴定。挑选14个多态信息含量较高的微卫星位点,以人工选育建立的凡纳滨对虾5个全同胞家系为试验材料,采用Cervus 3.0进行亲权分析,并根据家系内个体间的遗传距离...
应用荧光标记微卫星技术对凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)家系进行亲权鉴定。挑选14个多态信息含量较高的微卫星位点,以人工选育建立的凡纳滨对虾5个全同胞家系为试验材料,采用Cervus 3.0进行亲权分析,并根据家系内个体间的遗传距离进行UPGMA聚类分析。结果表明,14个微卫星位点的平均等位基因数为6,平均多态信息含量为0.6896,平均期望杂合度为0.7309,平均观测杂合度为0.7661,第一亲本、第二亲本和双亲的累计排除率分别为0.99721733、0.99996559和0.99999997;进一步模拟分析表明,要达到亲权鉴定的要求,在双亲性别已知时至少需要5个微卫星位点,双亲性别未知时至少需要6个微卫星位点;模拟分析及试验验证所选用的14个微卫星位点最多可以鉴定1 954个已知性别的亲本或1 203个未知性别的亲本。所选用的14个微卫星标记可在生产及科研试验中用于获取凡纳滨对虾系谱信息。
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关键词
凡纳滨对虾
荧光标记微卫星
亲权鉴定
聚类分析
下载PDF
职称材料
题名
荧光标记微卫星技术用于凡纳滨对虾不同家系亲权关系鉴定
被引量:
5
1
作者
彭敏
陈秀荔
赵永贞
陈晓汉
李咏梅
杨春玲
何苹萍
牛生洋
机构
广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室、广西水产科学研究院
河南科技学院
出处
《水生态学杂志》
北大核心
2014年第4期60-67,共8页
基金
国家现代农业产业技术体系广西南美白对虾产业创新团队项目(nycytxgxcxtd-03-14)
广西重点实验室开放基金(GXKL-AQUA-2011-04)
文摘
应用荧光标记微卫星技术对凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)家系进行亲权鉴定。挑选14个多态信息含量较高的微卫星位点,以人工选育建立的凡纳滨对虾5个全同胞家系为试验材料,采用Cervus 3.0进行亲权分析,并根据家系内个体间的遗传距离进行UPGMA聚类分析。结果表明,14个微卫星位点的平均等位基因数为6,平均多态信息含量为0.6896,平均期望杂合度为0.7309,平均观测杂合度为0.7661,第一亲本、第二亲本和双亲的累计排除率分别为0.99721733、0.99996559和0.99999997;进一步模拟分析表明,要达到亲权鉴定的要求,在双亲性别已知时至少需要5个微卫星位点,双亲性别未知时至少需要6个微卫星位点;模拟分析及试验验证所选用的14个微卫星位点最多可以鉴定1 954个已知性别的亲本或1 203个未知性别的亲本。所选用的14个微卫星标记可在生产及科研试验中用于获取凡纳滨对虾系谱信息。
关键词
凡纳滨对虾
荧光标记微卫星
亲权鉴定
聚类分析
Keywords
Litopenaeus vannamei
fluorescent labeled microsatellite
parentage identification
cluster analysis
分类号
Q343 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
荧光标记微卫星技术用于凡纳滨对虾不同家系亲权关系鉴定
彭敏
陈秀荔
赵永贞
陈晓汉
李咏梅
杨春玲
何苹萍
牛生洋
《水生态学杂志》
北大核心
2014
5
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