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广西区内四种鸭蛋卵磷脂与氨基酸测定分析 被引量:2
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作者 吴洁 莫国东 +5 位作者 刘征 凌钦润 罗元义 万火福 廖玉英 韦凤英 《广西畜牧兽医》 2017年第4期189-192,共4页
本试验以广西区内桂林龙胜翠鸭、柳州融水香鸭、防城港上思那琴香鸭和红树林海鸭等四种产蛋鸭的蛋为材料,研究其卵磷脂含量和氨基酸成分差异。结果表明:(1)四种鸭蛋的卵磷脂含量差异极显著(p<0.01),其中防城港红树林海鸭蛋含量最高,... 本试验以广西区内桂林龙胜翠鸭、柳州融水香鸭、防城港上思那琴香鸭和红树林海鸭等四种产蛋鸭的蛋为材料,研究其卵磷脂含量和氨基酸成分差异。结果表明:(1)四种鸭蛋的卵磷脂含量差异极显著(p<0.01),其中防城港红树林海鸭蛋含量最高,达2.894g/100g,其他三种依次为龙胜翠鸭蛋2.788 g/100g、那琴香鸭蛋2.772g/100g、融水香鸭蛋2.211 g/100g。(2)四种鸭蛋的氨基酸总量(T)在12.010~13.491g/100 g之间,其中桂林龙胜翠鸭蛋的氨基酸总量最高,达13.491g/100g,其他三种依次为防城港红树林海鸭蛋13.367 g/100g、柳州融水香鸭蛋13.347 g/100g、上思那琴香鸭蛋12.010 g/100g,各品种间差异极显著(p<0.01)。(3)龙胜翠鸭蛋中的必需氨基酸(E)、儿童必须氨基酸(CE)含量和鲜味氨基酸(F)的含量均为最高。(4)四种鸭蛋中各种必须氨基酸(E)占总氨基酸(T)的质量分数的比值(E/T)均接近或高于WHO/FAO氨基酸模式谱参考值。 展开更多
关键词 鸭蛋 卵磷脂 氨基酸
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广西德保猪抵抗素基因的克隆与分析 被引量:3
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作者 廖玲玲 李俊 +3 位作者 杨厚德 刘庆友 谢炳坤 崔奎青 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期1276-1280,共5页
【目的】克隆广西德保猪抵抗素(Resistin,RENT)基因并进行系统生物信息学分析,阐明德保猪脂肪细胞分化与脂肪生成的分子机制。【方法】根据NCBI已公布的猪RENT基因序列(NM_213783.2)设计特异性引物,以从德保猪血液中提取的总RNA为模板,... 【目的】克隆广西德保猪抵抗素(Resistin,RENT)基因并进行系统生物信息学分析,阐明德保猪脂肪细胞分化与脂肪生成的分子机制。【方法】根据NCBI已公布的猪RENT基因序列(NM_213783.2)设计特异性引物,以从德保猪血液中提取的总RNA为模板,PCR扩增RENT基因序列,T-A克隆至pEASY-T1载体后进行测序分析,并将所得测序结果用BLAST程序、MEGA 5.0软件、EXPASY服务器、SMART程序、SignIP程序、Softberry服务器和DNASTAR软件进行生物信息学分析。【结果】扩增获得468 bp的RENT基因序列片段,包含全长的德保猪RENT基因编码区和部分非编码区序列。多重序列比较分析结果显示,德保猪RENT基因编码区核酸序列与猪、牛、山羊、绵羊、人、兔、猕猴和豚鼠的同源性分别为100.0%、85.5%、85.5%、84.5%、81.2%、80.3%、80.0%和77.3%。德保猪RENT蛋白结构预测结果显示,其理论分子质量11.69 ku,等电点7.82,为弱碱性蛋白;N-末端存在信号肽,定位于胞质外,仅具有1个低复杂度结构域,包含1个α-螺旋、8个β-折叠、7个T-转角及两个无规则卷曲。【结论】RENT基因在德保猪中呈高度保守特征,是其脂肪细胞分化中的重要调控基因。 展开更多
关键词 德保猪 RENT基因 克隆 基因功能分析 同源性 蛋白结构预测
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广西3个地方黄牛品种mtDNA D-loop区序列多态性及起源分析 被引量:3
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作者 曹渊婷 黄英飞 +5 位作者 王自豪 滕少花 黄光云 雷初朝 孙俊丽 廖玉英 《中国牛业科学》 2022年第5期33-38,共6页
[目的]探究广西3个地方黄牛品种线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop区)序列的多态性及其母系起源,为广西地方黄牛品种的选育、系统分类和开发利用提供科学依据。[方法]利用PCR扩增、测序和生物信息学方法对广西3个地方黄牛品种(南丹黄牛、隆... [目的]探究广西3个地方黄牛品种线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop区)序列的多态性及其母系起源,为广西地方黄牛品种的选育、系统分类和开发利用提供科学依据。[方法]利用PCR扩增、测序和生物信息学方法对广西3个地方黄牛品种(南丹黄牛、隆林黄牛和涠洲黄牛)mtDNA D-loop序列进行多态性分析与系统发育进化树构建。[结果]从广西3个地方黄牛品种127个个体mtDNA D-loop区序列中检测到27种单倍型,其核苷酸多态位点65个,多态位点占所测核苷酸总长(908~912 bp)的7.143%,其中有61个转换、3个颠换和1个转换/颠换共存。广西3个地方黄牛品种mtDNA D-loop区单倍型多样度(H)为0.339~0.795,核苷酸多样度(π)为0.31%~2.54%,表明广西3个地方黄牛品种mtDNA D-loop区的遗传多样性存在较大差异,其中,南丹黄牛具有更丰富的遗传多样性,隆林黄牛次之,涠洲黄牛的遗传多样性较贫乏。聚类分析结果表明,广西3个地方黄牛品种具有普通牛和瘤牛2大母系起源,受瘤牛起源影响更明显。[结论]广西3个地方黄牛品种具有瘤牛和普通牛两大母系起源,但受瘤牛影响更明显。隆林黄牛与南丹黄牛为瘤牛和普通牛的混合母系起源,而涠洲黄牛为纯正的瘤牛母系起源,因此,应加强对广西地方黄牛品种资源,尤其是对涠洲黄牛品种资源的保护力度。 展开更多
关键词 广西黄牛 mtDNA D-loop 遗传多样性 母系起源
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广西三黄鸡生长曲线拟合与分析 被引量:19
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作者 万火福 孙俊丽 +7 位作者 黄英飞 张宗尧 秦黎梅 吴强 覃仕善 黄丽 吴亮 廖玉英 《广西畜牧兽医》 2021年第3期99-102,共4页
为了解广西三黄鸡的生长发育规律,研究采用Logistic、Gompertz、Bertalanffy 3种非线性模型对广西三黄鸡0周龄~25周龄的生长情况进行拟合与分析。结果表明:4周龄前广西三黄鸡公、母鸡的生长曲线基本一致,10周龄后公鸡的生长速度明显高... 为了解广西三黄鸡的生长发育规律,研究采用Logistic、Gompertz、Bertalanffy 3种非线性模型对广西三黄鸡0周龄~25周龄的生长情况进行拟合与分析。结果表明:4周龄前广西三黄鸡公、母鸡的生长曲线基本一致,10周龄后公鸡的生长速度明显高于母鸡;3种模型均能很好地拟合其生长曲线,拟合度均在0.995以上,其中Bertalanffyu模型在广西三黄鸡生长曲线中拟合最佳,其拟合结果最接近实测体重,其公鸡拐点体重为765.56g,拐点周龄为7.58周龄,母鸡拐点体重为590.07g,拐点周龄为6.96周龄。 展开更多
关键词 广西三黄鸡 LOGISTIC模型 Gompertz模型 Bertalanffy模型 生长曲线 拟合
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利用微卫星标记和线粒体mtDNA D-loop区分析龙胜凤鸡遗传多样性
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作者 黄英飞 莫国东 +5 位作者 吴强 孙俊丽 周志扬 万火福 韦凤英 廖玉英 《畜牧兽医科学(电子版)》 2019年第18期1-3,共3页
试验利用微卫星标记和线粒体mtDNA D-loop区分析龙胜凤鸡的遗传多样性及其品种资源的保种效果,进而更好的保护和利用。在龙胜凤鸡保种群中随机抽取30只血样,采用PCR和直接测序的方法测定mtDNA D-loop序列。结果表明:18对微卫星检测中,... 试验利用微卫星标记和线粒体mtDNA D-loop区分析龙胜凤鸡的遗传多样性及其品种资源的保种效果,进而更好的保护和利用。在龙胜凤鸡保种群中随机抽取30只血样,采用PCR和直接测序的方法测定mtDNA D-loop序列。结果表明:18对微卫星检测中,龙胜凤鸡的多态信息含量PIC平均为0.5869,4个中度多态位点,14个高度多态位点;线粒体mtDNA D-loop区中,共发现9种单倍型,21个变异位点,变异方式主要是转换,未发现缺失;核苷酸多样度为(0.01129±0.00349),单倍型多态度为(0.5150±0.1110);在NJ系统发生树上,分为3大类群,则具有3个血统来源,结果显示龙胜凤鸡具有比较丰富的遗传多样性和较低的变异程度,说明采用家系保种法对龙胜凤鸡进行保种,方法有效可行。 展开更多
关键词 龙胜凤鸡 微卫星 线粒体 保种效果
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广西三黄鸡的遗传多样性及保种效果分析 被引量:6
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作者 莫国东 黄英飞 +3 位作者 吴强 张细权 韦凤英 廖玉英 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期2021-2027,共7页
广西三黄鸡肉嫩味美,是中国应用广泛、开发利用最好的著名地方品种。为了准确评价广西三黄鸡的遗传多样性和保种效果,以广西自治区内4个保种场314个样品为研究材料,用18个微卫星标记和线粒体DNA D-loop区(mtDNA)联合分析广西三黄鸡群体... 广西三黄鸡肉嫩味美,是中国应用广泛、开发利用最好的著名地方品种。为了准确评价广西三黄鸡的遗传多样性和保种效果,以广西自治区内4个保种场314个样品为研究材料,用18个微卫星标记和线粒体DNA D-loop区(mtDNA)联合分析广西三黄鸡群体的遗传多样性。微卫星标记结果表明:共检测到144个等位基因,平均等位基因数为8个,期望杂合度(HE)为0.6798,观察杂合度(HO)为0.5605,多态信息含量(PIC)为0.6393。线粒体DNA D-loop区结果表明:在检测序列中,共发现31个变异位点,17种单倍型,群体平均核苷酸多态性和单倍型多态性分别为0.01379,0.644;网络中介图表明广西三黄鸡具有5个血统来源,主要起源是东亚和云南或云南周边地区地方鸡血统,但在存在少量外来商业鸡种血统。本研究结果表明,广西三黄鸡具有较为丰富的遗传多样性,个别保种场需进一步提纯保种。 展开更多
关键词 广西三黄鸡 微卫星标记 线粒体DNA 遗传多样性
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广西巴马小香猪体细胞克隆 被引量:2
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作者 朱向星 孙俊丽 +4 位作者 谢炳坤 廖玉英 卢克焕 梁世忠 卢晟盛 《生物资源》 CAS 2018年第5期383-390,共8页
本研究旨在检验新生广西巴马小香猪肾脏成纤维细胞支持克隆胚胎完全的体内发育潜能,亦即能通过其构建出存活的克隆猪,从而为克隆技术在广西巴马小香猪资源保存和开发上的应用奠定基础。首先制备新生雄性广西巴马小香猪肾脏成纤维细胞,... 本研究旨在检验新生广西巴马小香猪肾脏成纤维细胞支持克隆胚胎完全的体内发育潜能,亦即能通过其构建出存活的克隆猪,从而为克隆技术在广西巴马小香猪资源保存和开发上的应用奠定基础。首先制备新生雄性广西巴马小香猪肾脏成纤维细胞,用其制备体细胞核移植胚胎,追踪观察体细胞核移植胚胎体外发育潜能,最后通过胚胎移植检验其完全的体内发育潜能。实验结果表明,制备的新生雄性广西巴马小香猪肾脏成纤维细胞具有良好的细胞增殖活性,用其制备的体细胞核移植胚胎分裂率和囊胚率分别为77.7%(334/430)和16.5%(71/430),将1 658枚克隆胚胎移植给6头代孕母猪,其中2头妊娠并最终产下8头存活雄性克隆小猪和3头死胎,整体克隆效率为0.66%,存活克隆猪健康状况良好。本研究表明,新生猪肾脏成纤维细胞是一种理想的用于生产体细胞克隆广西巴马小香猪的细胞资源。 展开更多
关键词 广西巴马小香猪 体细胞核移植 体细胞克隆 肾脏成纤维细胞 胚胎移植
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四种鸭蛋蛋品质与氨基酸测定分析 被引量:6
8
作者 吴洁 莫国东 +4 位作者 刘征 吴强 黄英飞 廖玉英 韦凤英 《中国家禽》 北大核心 2017年第12期64-67,共4页
试验以广西地区桂林龙胜翠鸭、柳州融水香鸭、防城港上思那琴香鸭和红树林海鸭等四种鸭蛋为材料,研究其蛋品质和氨基酸成分差异。结果表明:(1)四种鸭蛋的蛋重、蛋壳重、哈夫单位差异极显著(P<0.01);蛋壳强度差异显著(P<0.05);(2)... 试验以广西地区桂林龙胜翠鸭、柳州融水香鸭、防城港上思那琴香鸭和红树林海鸭等四种鸭蛋为材料,研究其蛋品质和氨基酸成分差异。结果表明:(1)四种鸭蛋的蛋重、蛋壳重、哈夫单位差异极显著(P<0.01);蛋壳强度差异显著(P<0.05);(2)四种鸭蛋的氨基酸总量(T)在12.010~13.491 g/100 g之间,其中桂林龙胜翠鸭蛋的氨基酸总量最高,达13.491 g/100 g,其他三种依次为防城港红树林海鸭蛋13.367 g/100 g、柳州融水香鸭蛋13.347 g/100 g、上思那琴香鸭蛋12.010 g/100 g,除红树林海鸭蛋和融水香鸭蛋两者间差异不显著(P>0.05),其余各品种间差异极显著(P<0.01);(3)龙胜翠鸭蛋中的必需氨基酸、儿童必需氨基酸含量和特征性鲜味氨基酸含量均为最高;(4)四种鸭蛋中各种必需氨基酸占总氨基酸的质量分数的比值均高于WHO/FAO氨基酸模式谱参考值。 展开更多
关键词 鸭蛋 蛋品质 氨基酸
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陆川猪MYL9基因克隆及其表达差异分析 被引量:6
9
作者 焦迪 谢婉 +6 位作者 潘鹏丞 陈宝剑 关志惠 杨秀荣 兰干球 郭亚芬 谢炳坤 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期454-460,共7页
【目的】克隆陆川猪肌球蛋白调节轻链9基因(MYL9),并进行生物信息学分析及检测其在不同猪种中的表达差异,为明确陆川猪骨骼肌生长规律及研究MYL9的生理功能打下基础。【方法】根据NCBI上的家猪MYL9基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR克... 【目的】克隆陆川猪肌球蛋白调节轻链9基因(MYL9),并进行生物信息学分析及检测其在不同猪种中的表达差异,为明确陆川猪骨骼肌生长规律及研究MYL9的生理功能打下基础。【方法】根据NCBI上的家猪MYL9基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR克隆陆川猪MYL9基因,利用在线软件对其进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测陆川猪和杜洛克猪背最长肌中MYL9基因的表达情况。【结果】陆川猪MYL9基因编码区(CDS)序列长519bp,共编码172个氨基酸;与NCBI上已公布的家猪MYL9基因(NM_001244472.1)CDS序列比对,陆川猪MYL9基因存在2处碱基突变,分别是195 bp处C→A和498 bp处T→C,均为同义突变;陆川猪MYL9基因推导氨基酸序列与家猪MYL9基因推导氨基酸序列的同源性最高,为99.6%,与鸡的同源性最低,为88.4%。陆川猪MYL9蛋白存在3个N糖基化位点和15个磷酸化位点,不存在跨膜结构域和信号肽,符合一般EFh-PEF超家族的结构特征。陆川猪MYL9蛋白二级结构中α-螺旋占54.65%,无规则卷曲占35.47%,β-转角占8.14%,延伸链占1.74%。MYL9基因在杜洛克猪背最长肌中的相对表达量极显著高于陆川猪背最长肌(P<0.01)。【结论】MYL9基因序列在不同物种中具有较高的保守性,其在10周龄陆川猪背最长肌中的相对表达量极显著低于杜洛克猪,与其在不同猪种背最长肌中的磷酸化程度有关,也说明MYL9基因对猪肌肉生长速度有一定影响。 展开更多
关键词 陆川猪 肌球蛋白轻链9基因(MYL9) 克隆 生物信息学分析 肌肉 磷酸化
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东兰乌鸡母鸡体尺性状与产蛋数的相关性分析 被引量:16
10
作者 吴强 蹇慧 +11 位作者 韦凤英 廖玉英 莫国东 邓继贤 黄英飞 万火福 吴洁 覃仕善 文信旺 吴亮 黄丽 张莹 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第10期205-207,共3页
为了解东兰乌鸡的体尺性状与产蛋数的相关性情况,分析是否存在某个或者多个体尺性状与产蛋数的相关性,试验对200只东兰乌鸡母鸡分别在120日龄和300日龄进行体尺以及产蛋数等指标的检测,并应用SPSS软件对数据进行相关及回归分析。结果表... 为了解东兰乌鸡的体尺性状与产蛋数的相关性情况,分析是否存在某个或者多个体尺性状与产蛋数的相关性,试验对200只东兰乌鸡母鸡分别在120日龄和300日龄进行体尺以及产蛋数等指标的检测,并应用SPSS软件对数据进行相关及回归分析。结果表明:120日龄东兰乌鸡母鸡的体重与产蛋数不相关(P〉0.05),产蛋数与冠高呈极显著正相关(P〈0.01);300日龄东兰乌鸡母鸡的体重、体斜长、胫围、骨盆宽与产蛋数呈极显著负相关(P〈0.01),胸宽、胸深与产蛋数呈显著负相关(P〈0.05)。 展开更多
关键词 东兰乌鸡 体尺性状 产蛋数 体重 相关性分析
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黄芪多糖对猪精液冷冻保存效果的影响 被引量:12
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作者 杨尚雪 潘天彪 +5 位作者 黄明光 许春荣 刘德玉 王英群 李珣 胡传活 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第9期179-183,共5页
为了评价黄芪多糖(Astragalus polysaccharides)对外来公猪精液冷冻保存的影响情况,为猪精液冷冻稀释液配方的改良提供理论依据,试验采集美系长白、大约克与杜洛克3种公猪的精液,用添加不同浓度(0、0.01%、0.02%、0.03%、0.04%、0.05%、... 为了评价黄芪多糖(Astragalus polysaccharides)对外来公猪精液冷冻保存的影响情况,为猪精液冷冻稀释液配方的改良提供理论依据,试验采集美系长白、大约克与杜洛克3种公猪的精液,用添加不同浓度(0、0.01%、0.02%、0.03%、0.04%、0.05%、0.06%)黄芪多糖的冷冻稀释液稀释,0.25mL塑料细管分装并冷冻,测定解冻后精子活力、畸形率及顶体完整率,并进行相同浓度3种公猪之间和同种公猪不同浓度之间的比较。结果表明,在相同黄芪多糖浓度下,仅杜洛克公猪冻后精子顶体完整率在不添加黄芪多糖时显著高于大约克公猪(P<0.05),其余均无显著差异(P>0.05);每种公猪的最佳黄芪多糖添加浓度均为0.04%,在该浓度下精液冻后质量均显著优于对照组(P<0.05);各种公猪最佳黄芪多糖添加浓度下的精液冻后质量指标之间均无显著差异(P>0.05)。总之,稀释液中添加0.04%黄芪多糖在长白、大约克与杜洛克3种公猪的精液冷冻都可以取得较好的效果。 展开更多
关键词 精液 冷冻保存 黄芪多糖
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陆川猪IGFBP5基因克隆及其差异表达分析 被引量:4
12
作者 焦迪 潘鹏丞 +6 位作者 谢婉 张其伟 曾令湖 孙甜甜 陈宝剑 关志惠 谢炳坤 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1347-1355,共9页
【目的】克隆陆川猪胰岛素生长因子结合蛋白5(IGFBP5)基因,并明确其在不同猪种中的表达情况,为今后揭示IGFBP5基因在陆川猪肌肉发育中的作用机理提供理论依据。【方法】通过TRIzol法提取陆川猪背最长肌总RNA,反转录合成cDNA后进行PCR扩... 【目的】克隆陆川猪胰岛素生长因子结合蛋白5(IGFBP5)基因,并明确其在不同猪种中的表达情况,为今后揭示IGFBP5基因在陆川猪肌肉发育中的作用机理提供理论依据。【方法】通过TRIzol法提取陆川猪背最长肌总RNA,反转录合成cDNA后进行PCR扩增,将正确的测序结果采用在线生物信息软件进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测分析IGFBP5基因在陆川猪和杜洛克猪背最长肌中的表达差异。【结果】陆川猪IGFBP5基因编码区(CDS)序列全长816bp,编码271个氨基酸,与NCBI上已公布的野猪IGFBP5基因(NM_214099.1)CDS序列相比,存在3处碱基差异,其核苷酸同源性为99.6%。陆川猪IGFBP5氨基酸序列与NCBI上已公布的野猪(NM_214099.1)、牛(NM_001105327.2)、水牛(NM_001290940.1)、马(NM_001308603.2)、人类(NM_000599.3)、猕猴(NM_001284032.1)、小鼠(NM_010518.2)和大鼠(NM_012817.1)IGFBP5氨基酸序列同源性分别为98.9%、98.2%、98.9%、97.4%、96.7%、97.4%、95.2%和95.2%;基于IGFBP5氨基酸序列同源性构建的系统发育进化树也显示,陆川猪与野猪的遗传距离最近。陆川猪IGFBP5蛋白二级结构由α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲组成,其中无规则卷曲占比最高,为65.68%;陆川猪IGFBP5蛋白不存在跨膜结构,在第1~20位氨基酸残基存在1个信号肽序列;蛋白修饰结构预测结果表明,陆川猪IGFBP5蛋白存在2个O糖基化位点、2个N糖基化位点和多个潜在磷酸化位点,包含IB保守结构域和Thyroglobulin-1保守结构域。IGFBP5基因在杜洛克猪背最长肌中的相对表达量极显著高于其在陆川猪背最长肌中的相对表达量(P<0.01)。【结论】IGFBP5基因保守性较强,其在不同猪种间的差异表达可能是导致猪肉瘦肉率差异的主要原因,可作为陆川猪胴体重和瘦肉率等生长性状的遗传标记予以开发利用。 展开更多
关键词 陆川猪 IGFBP5基因 背最长肌 生物信息学 生长发育 差异表达
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猪精液冷冻保存的剂型及品种效应 被引量:2
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作者 刘德玉 杨尚雪 +5 位作者 黄明光 李美珍 李珣 潘天彪 黄光云 胡传活 《湖北农业科学》 北大核心 2014年第20期4917-4919,4923,共4页
为了评价细管类型在不同品种公猪精液冷冻中的效果,为猪精液冷冻的实际生产中冷冻细管的选择提供理论依据,试验将长白、大约克与杜洛克3种美系公猪(每品种7头次)精液进行不同细管类型(5.00、0.50、0.25 m L)的分装冷冻,比较各种细管类... 为了评价细管类型在不同品种公猪精液冷冻中的效果,为猪精液冷冻的实际生产中冷冻细管的选择提供理论依据,试验将长白、大约克与杜洛克3种美系公猪(每品种7头次)精液进行不同细管类型(5.00、0.50、0.25 m L)的分装冷冻,比较各种细管类型下不同品种公猪之间和同一品种公猪不同细管类型精液冻后质量(冻后精子活力、畸形率及顶体完整率)。结果表明,1相同剂型下,除了0.25 m L细管分装时杜洛克公猪冻后精子顶体完整率显著(P<0.05)高于长白公猪外,3种公猪之间在3个指标上差异均不显著(P>0.05);23种公猪冻后精子活力最高的剂型均为0.50 m L细管,冻后精子畸形率及顶体完整率最好的剂型均为5.00 m L细管。总之,3种细管类型中,仅0.25 m L剂型存在品种效应,而3个品种公猪却存在着基本类似的剂型效应。 展开更多
关键词 精液 冷冻保存 剂型 品种
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陆川猪ANKRD1基因克隆及其表达差异分析 被引量:1
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作者 潘鹏丞 焦迪 +3 位作者 谢婉 陈宝剑 关志惠 谢炳坤 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1470-1477,共8页
【目的】克隆陆川猪心肌锚蛋白重复域1基因(ANKRD1),并进行生物信息学及组织表达谱分析,为研究ANKRD1在陆川猪机体内的功能作用提供参考依据。【方法】根据NCBI已公布的野猪ANKRD1基因序列(NM_213922.1)设计特异性引物,采用TRIzol法提... 【目的】克隆陆川猪心肌锚蛋白重复域1基因(ANKRD1),并进行生物信息学及组织表达谱分析,为研究ANKRD1在陆川猪机体内的功能作用提供参考依据。【方法】根据NCBI已公布的野猪ANKRD1基因序列(NM_213922.1)设计特异性引物,采用TRIzol法提取陆川猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌和皮下脂肪的总RNA,反转录合成cDNA,并以此为模板进行ANKRD1基因克隆,通过MegAlign、Protaram、Protscale、MHMM Server和SignalP等在线分析软件进行生物信息学分析,最后以实时荧光定量PCR检测ANKRD1基因在陆川猪各组织中的表达情况。【结果】陆川猪ANKRD1基因蛋白编码区(CDS)序列全长960 bp,编码319个氨基酸残基,与NCBI已公布野猪ANKRD1基因(NM_213922.1)的CDS序列存在4处碱基突变,但均为同义突变,二者的ANKRD1氨基酸序列同源性为99.6%。陆川猪ANKRD1基因编码蛋白分子量为36125.70 Da,理论等电点(pI)为7.09,属于稳定蛋白,其二级结构中α-螺旋占46.39%、无规则卷曲占39.81%、β-转角占9.09%、延伸链占4.70%;陆川猪ANKRD1蛋白不存在跨膜结构,也无信号肽,有多个磷酸化位点。陆川猪ANKRD1基因在其心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌和皮下脂肪等7个组织中均有表达,其中以心脏中的相对表达量最高,显著高于在其他组织中的相对表达量(P<0.05,下同),在脾脏中的相对表达量最低,显著低于在心脏、肝脏、肺脏和背最长肌中的相对表达量。【结论】ANKRD1基因在陆川猪的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌和皮下脂肪等组织中均有表达,且存在明显差异,故推测ANKRD1基因在不同组织中发挥不同作用。 展开更多
关键词 陆川猪 ANKRD1基因 克隆 生物信息学 组织表达谱
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黄羽肉鸡不同品系间的配合力测定 被引量:4
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作者 吴强 莫国东 +4 位作者 蹇慧 黄英飞 廖玉英 韦凤英 雷佳霖 《中国家禽》 北大核心 2016年第7期43-44,共2页
采用广西三黄鸡BB系、XX系和矮小型黄羽鸡DD系为素材,采用不完全双列杂交法,组成包括纯系在内的9个组合,测定1~16周各个周龄的体重、16周龄成活率和饲料转化率的杂种优势率、后代羽色。结果表明,杂交组合B×X组合的1~16周龄体重、1... 采用广西三黄鸡BB系、XX系和矮小型黄羽鸡DD系为素材,采用不完全双列杂交法,组成包括纯系在内的9个组合,测定1~16周各个周龄的体重、16周龄成活率和饲料转化率的杂种优势率、后代羽色。结果表明,杂交组合B×X组合的1~16周龄体重、16周龄成活率、16周龄饲料转化率、后代羽色等各项指标均表现突出,为最佳配套组合,可在生产中推广使用。 展开更多
关键词 黄羽肉鸡 不完全双列杂交 配合力 杂种优势
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陆川猪CSRP3基因克隆及其组织表达差异分析 被引量:2
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作者 陈云 潘鹏丞 +6 位作者 陈钊 姜长津 关志惠 陈宝剑 梁晶 谢炳坤 覃兆鲜 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期977-984,共8页
【目的】克隆陆川猪的富含半胱氨酸和甘氨酸蛋白3(CSRP3)基因,并对其进行生物信息学和组织表达谱分析,为研究CSRP3基因在陆川猪肌肉生长过程中的作用机制打下基础。【方法】根据NCBI已公布的野猪CSRP3基因序列设计特异性定量引物和克隆... 【目的】克隆陆川猪的富含半胱氨酸和甘氨酸蛋白3(CSRP3)基因,并对其进行生物信息学和组织表达谱分析,为研究CSRP3基因在陆川猪肌肉生长过程中的作用机制打下基础。【方法】根据NCBI已公布的野猪CSRP3基因序列设计特异性定量引物和克隆引物,运用RT-PCR克隆CSRP3基因并进行生物信息学在线分析,采用实时荧光定量PCR检测CSRP3基因在陆川猪各组织中的表达差异。【结果】陆川猪CSRP3基因编码区(CDS)全长854 bp,编码194个氨基酸残基,与NCBI已公布的野猪CSRP3基因CDS序列相比存在5处同义碱基突变,且陆川猪与野猪氨基酸序列相似性达100.0%;陆川猪CSRP3基因的编码蛋白分子量为20935.82 Da,分子式为C_(964)H_(1404)N_(262)O_(274)S_(19),理论等电点(pI)为8.89,不稳定系数为39.11,表明其是偏碱性的稳定蛋白;CSRP3蛋白二级结构主要由无规则卷曲构成,三级结构可能有一种模型;陆川猪CSRP3蛋白除有多个磷酸化位点之外,无跨膜结构和信号肽;陆川猪CSRP3基因在心脏中表达量最高,背最长肌次之,在肝脏中的表达量最低。【结论】CSRP3基因在陆川猪心脏中表达量最高,背最长肌次之且明显高于其他组织,说明该基因可能对肌肉生长有一定影响。 展开更多
关键词 陆川猪 CSRP3基因 基因克隆 生物信息学分析
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四种禽类肉质特性及营养风味分析评价 被引量:17
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作者 黄英飞 莫国东 +4 位作者 廖玉英 周志杨 吴强 韦凤英 汪燕玲 《中国家禽》 北大核心 2016年第22期41-45,共5页
本试验以孔雀、贵妃鸡、广西麻鸡、东兰乌鸡4种不同禽类为素材,屠宰后研究其肉质特性,氨基酸成分分析和风味评价。结果:1四种禽类的胸肌、腿肌pH值差异不显著(P>0.05);孔雀胸肌与腿肌的肉色、剪切力和电导率均比其他三个品种高,差异... 本试验以孔雀、贵妃鸡、广西麻鸡、东兰乌鸡4种不同禽类为素材,屠宰后研究其肉质特性,氨基酸成分分析和风味评价。结果:1四种禽类的胸肌、腿肌pH值差异不显著(P>0.05);孔雀胸肌与腿肌的肉色、剪切力和电导率均比其他三个品种高,差异显著(P<0.05);2肌肉中氨基酸类物质总含量最高的是孔雀(42.993 g/100 g),与广西麻鸡(20.861 g/100 g)差异显著(P<0.05),贵妃鸡(17.891 g/100 g)、东兰乌鸡(19.351 g/100 g)差异极显著(P<0.01);孔雀、贵妃鸡、广西麻鸡、东兰乌鸡肉汤中总氨基酸类物质含量分别为0.519 g/100 mL、0.396 g/100 mL、0.121 g/100 mL、0.145 g/100 mL,部分氨基酸种类含量低;3肌肉中各种必需氨基酸占总氨基酸的质量分数的比值大部分高于WHO/FAO推荐的氨基酸模式谱的参考值;4肌肉风味评定得分最高的是广西麻鸡,而肉汤风味评定得分最高的是孔雀。 展开更多
关键词 肉质特性 氨基酸 营养评价 风味评定
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Comparison of Semen Quality and Spermadhesins' m RNA Expression between Luchuan and Exotic Boars
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作者 黄明光 黄光云 +5 位作者 胡安琪 李珣 潘天彪 汪燕玲 杨尚雪 胡传活 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2016年第5期1055-1059,共5页
Spermadhesins,as the most important components of boar semen seminoproteins,play a regulatory role in sperm motility,sperm capacitation and sperm-ovum fusion.In order to study the fertility differences among different... Spermadhesins,as the most important components of boar semen seminoproteins,play a regulatory role in sperm motility,sperm capacitation and sperm-ovum fusion.In order to study the fertility differences among different boar breeds,the sperm motility,sperm viability and sperm deformity,as well as the spermadhesins' m RNA expression in fresh semen of Luchuan,Landrace and Duroc boars were compared.The results showed that the sperm motility and viability of Luchuan boar showed no significant differences with those of Landrace and Duroc boars(P〉 0.05),but its sperm deformity was significantly lower than those of the other two exotic breeds(P〈0.01);no significant differences were found in the m RNA expression levels of spermadhesins between Luchuan and Landrace,Duroc boars(P〉0.05),excepting that the m RNA expression level of AQN1 in Luchuan boar semen was significantly lower than that in Duroc boar semen(P〈0.05);the m RNA expression levels of AQN3,AWN and PSP-II in Landrace boar semen were significantly higher than those in Duroc boar semen(P〈0.05,P〈0.01).In short,there were significant differences in the m RNA expression levels of spermadhesins among different pig breeds,which showed no significant correlations with the differences in sperm motility,viability and deformity. 展开更多
关键词 Luchuan LANDRACE DUROC Spermadhesins Semen quality
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基于TMT蛋白组学及生物信息学分析牦牛抗冻差异蛋白 被引量:4
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作者 贾银海 张成福 +7 位作者 张强 姬秋梅 黄光云 姜辉 文信旺 黄明光 彭夏云 吴柱月 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期1-11,共11页
【目的】从蛋白水平阐明牦牛抗寒性能机理,并进一步从营养学角度提高其代谢性能,为牦牛有效抵御外界恶劣气候条件提供科学依据。【方法】应用TMT蛋白组学技术对寒冷季节(1月)和温暖季节(8月)的牦牛抗冻蛋白进行挖掘,并对鉴定到的牦牛抗... 【目的】从蛋白水平阐明牦牛抗寒性能机理,并进一步从营养学角度提高其代谢性能,为牦牛有效抵御外界恶劣气候条件提供科学依据。【方法】应用TMT蛋白组学技术对寒冷季节(1月)和温暖季节(8月)的牦牛抗冻蛋白进行挖掘,并对鉴定到的牦牛抗冻蛋白进行亚细胞定位、结构域、GO功能富集、KEGG信号通路注释、蛋白相互作用等生物信息学分析。【结果】从牦牛耳组织中共鉴定获得21856个肽段(Peptide),其中特有肽段(Unique peptide)序列为18452个,定量获得4519个蛋白,最终筛选出144个差异蛋白,其中上调蛋白89个、下调蛋白55个。144个牦牛抗冻差异蛋白亚细胞定位到7个条目上,分别是细胞核蛋白56个、细胞质蛋白51个、质膜蛋白24个、细胞外蛋白23个、线粒体蛋白18个、细胞骨架蛋白1个和溶酶体蛋白1个;共鉴定到194个结构域。GO功能富集分析结果显示,生物过程主要富集到细胞过程蛋白79个、代谢过程蛋白70个和生物调控蛋白42个等,分子功能主要富集到结合功能蛋白75个和催化活性蛋白64个等,细胞组分主要富集到细胞部分蛋白89个和细胞蛋白89个等。144个牦牛抗冻差异蛋白在KEGG数据库中注释到205条KEGG信号通路,主要涉及核糖体、氮代谢、胞质DNA感受、动物体内生热作用、氧化磷酸化、白细胞介素-17及钙离子信号等通路。牦牛抗冻差异蛋白相互作用网络分析发现L8IHE5的关联度最高,且冷诱导RNA结合蛋白(CIRP)和HSP70结合蛋白在蛋白相互作用网络中具有更多的相互作用关系。【结论】基于TMT蛋白组学对牦牛抗冻差异蛋白进行挖掘,结果鉴定获得144个抗冻差异蛋白(上调蛋白89个,下调蛋白55个),其中CIRP和HSP70在冷应激条件下呈上调趋势,能促使牦牛肌体适应低温环境,可作为牦牛抗冻性育种的候选分子标记。 展开更多
关键词 牦牛 TMT蛋白组学 生物信息学 抗冻性 差异蛋白
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陆川猪磷酸酪氨酸互作结构域1基因克隆及序列分析 被引量:4
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作者 谢炳坤 覃兆鲜 +4 位作者 吴永绍 农素群 蓝海恩 吕玲燕 潘天彪 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第2期258-263,共6页
试验旨在对陆川猪磷酸酪氨酸互作结构域1(phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID1)基因进行克隆和生物信息学分析。利用GenBank公布的猪序列设计引物,用RT-PCR扩增得到目的基因片段,并用生物信息学方法分析和预测了陆川... 试验旨在对陆川猪磷酸酪氨酸互作结构域1(phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID1)基因进行克隆和生物信息学分析。利用GenBank公布的猪序列设计引物,用RT-PCR扩增得到目的基因片段,并用生物信息学方法分析和预测了陆川猪PID1基因的理化性质与二级结构。结果显示,陆川猪PID1基因编码区全长654bp,编码217个氨基酸;陆川猪PID1基因与莱芜猪、牛、猕猴、人、小鼠、原鸡、大鼠、斑马鱼和非洲爪蟾相对应序列相似性分别为99.08%、87.61%、93.88%、93.58%、90.06%、83.79%、66.94%、66.52%和60.09%。系统进化树分析结果表明,PID1基因在不同物种及进化的过程中具有高度保守性。本研究成功克隆陆川猪PID1基因,为阐明其在陆川猪生长发育及脂肪沉积方面的调控研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 陆川猪 PID1基因 克隆
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