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基于长期研究队列的广西隆安县乙型肝炎病毒准种研究 被引量:2
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作者 贾蕙华 陈钦艳 +6 位作者 蒋智华 王学燕 张文嘉 TIM J Harrison J BROOKS Jackson LI Wu 方钟燎 《中国热带医学》 CAS 2023年第8期822-827,共6页
目的明确广西隆安县队列HBsAg无症状携带者感染的乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)准种序列长期演化特征。方法收集9名广西隆安县队列HBsAg无症状携带者2004年、2007年、2013年、2019年或2020年4个不同时间点血清样本。酶联免疫吸... 目的明确广西隆安县队列HBsAg无症状携带者感染的乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)准种序列长期演化特征。方法收集9名广西隆安县队列HBsAg无症状携带者2004年、2007年、2013年、2019年或2020年4个不同时间点血清样本。酶联免疫吸附测定法检测HBV血清学标志物;聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)荧光探针法检测HBV病毒载量;试剂盒提取HBV DNA;PCR法扩增HBV全基因组,进行二代测序;利用Mega等软件对所获得的序列进行生物信息学分析。结果共获得23份血清样本,309条全长基因准种序列,每份标本平均获得(0.18±0.07)G测序数据量。55.55%(5/9)的研究对象携带的HBV毒株基因型在长期进化过程中发生了基因型转换,PreS/S区系统进化树基因分型结果与全基因组分析结果完全一致;发现B/C、I/C重组体;各研究标本的Sn值范围为0~0.37,D值范围为0~0.11;共检出21种特殊单核苷酸/氨基酸突变位点(S区7种,X区2种,PreC区3种,BCP区9种)和6种缺失突变,发现多联突变组合形式,未发现任何耐药突变,77.8%(7/9)研究对象在2004年携带的HBV毒株发生了BCP区nt1762(A→T)/1764(G→A)双突变和PreC区1896位(G→A)点突变,HBV基因可在无抗病毒药物压力下由突变型可恢复为野生型和(或)野生型转变为突变型;HBV基因组进化率为2.03×10^(-5)~3.50×10^(-3)。结论在HBV自然感染进程中,HBV基因型和重组体、准种复杂性和多样性可随时间发生改变;HBV基因突变型和野生型可相互转换,一定程度上降低了利用基因型和相关突变来预测临床结局的价值;隆安县乙型肝炎表面抗原(hepatitis B surface antigen,HBsAg)无症状携带者HBV基因组进化率很高。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 基因型 二代测序 准种 基因突变
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广西2005—2014年戊型肝炎流行病学分析 被引量:10
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作者 谭超 李海 +3 位作者 方钟燎 王学燕 陈钦艳 杨庆利 《中国热带医学》 CAS 2016年第12期1187-1189,1229,共4页
目的了解广西戊型病毒性肝炎(戊肝)的发病趋势及流行病学特征,为制定防控措施提供科学依据。方法采用描述性流行病学方法对广西2005—2014年戊肝疫情监测资料进行分析。结果广西2005—2014年戊肝发病率逐年上升,2005年发病率为0.35/10... 目的了解广西戊型病毒性肝炎(戊肝)的发病趋势及流行病学特征,为制定防控措施提供科学依据。方法采用描述性流行病学方法对广西2005—2014年戊肝疫情监测资料进行分析。结果广西2005—2014年戊肝发病率逐年上升,2005年发病率为0.35/10万,2014年上升至3.29/10万,平均发病率1.74/10万。发病率较高的地区为梧州市、玉林市、桂林市、南宁市、防城港市等市。病例主要集中于冬春季(1—5月)。40~60岁病例较多,男女性别比3.01∶1,病例职业构成主要为农民、离退人员、家务及待业、工人等。结论广西2005—2014年戊肝发病率逐年上升,南宁等市是高发区,中老年男性、农民是发病高危人群。应重视戊肝疫情形势,采取以切断传播途径为主的综合防控措施,有效遏制戊肝流行。 展开更多
关键词 戊型肝炎 流行病学 发病趋势
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广西柳州市丙型肝炎病毒的基因型和基因亲缘性分析 被引量:3
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作者 尹琦 杨庆利 +4 位作者 王学燕 李海 陈钦艳 谭超 罗洲 《中国热带医学》 CAS 2016年第10期965-969,共5页
目的分析近年来广西柳州市丙型肝炎病毒(HCV)的基因型和基因亲缘性。方法用巢式RT-PCR法对HCV NS5B区进行扩增,通过测序和构建进化树进行基因分型并分析基因亲缘性。结果对182株HCV基因分型:1a型占3.3%,1b型占50.5%,3a型占17.0%,3b型占4... 目的分析近年来广西柳州市丙型肝炎病毒(HCV)的基因型和基因亲缘性。方法用巢式RT-PCR法对HCV NS5B区进行扩增,通过测序和构建进化树进行基因分型并分析基因亲缘性。结果对182株HCV基因分型:1a型占3.3%,1b型占50.5%,3a型占17.0%,3b型占4.9%,6a型占26.4%,6c/d型占2.7%,6型未分亚型(6un)占0.5%。6株1a型HCV与美国参照株属不同分支。2.2%(2/92)的1b型与日本参照株属同一分支;29.3%(27/92)的1b型与来源于上海的参照株属于同一分支,其余67.4%(62/92)的1b型则独立分支;另外1株独立于上述各分支外。95.2%(20/21)的3a型以及77.8%(7/9)的3b型与日本和澳大利亚参照株属同一分支或并列分支。4.8%(1/21)的3a型和22.2%(2/9)的3b型则独立分支。97.9%(47/48)的6a型与越南、香港和英国参照株属同一分支或并列分支;2.1%(1/48)的6a型独立于上述分支外。5株HCV与6c和6d参照株并列分支,1株6型病毒未能区分亚型。结论近年来广西柳州市HCV流行的主导基因型是1b、6a和3a。1b型的大部分具有独立的本地亲缘性特征;而6a和3a型的绝大部分则无此特征。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 基因型 亲缘性分析
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广西隆安县2006-2014年原发性肝癌回顾性调查研究 被引量:12
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作者 方孔雄 农秋峰 +9 位作者 陆雪明 黄建云 谭超 陈钦艳 王富珍 方钟燎 毕胜利 沈立萍 王峰 李海 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期932-935,共4页
目的探讨广西隆安县原发性肝癌流行病学特征及危险因素。方法回顾性调查隆安县2006-2014年发病的原发性肝癌患者共2 170例,通过查阅纸质报告表、病案、肿瘤直报系统等方法收集其基本人口学资料、诊断与报告情况、乙肝病毒和丙肝病毒感... 目的探讨广西隆安县原发性肝癌流行病学特征及危险因素。方法回顾性调查隆安县2006-2014年发病的原发性肝癌患者共2 170例,通过查阅纸质报告表、病案、肿瘤直报系统等方法收集其基本人口学资料、诊断与报告情况、乙肝病毒和丙肝病毒感染以及免疫接种情况,并对上述资料进行统计分析。结果病例以35岁以上中老年男性为主,平均年龄(57.22±14.61)岁,男女性别比为3.50∶1,壮族占绝大多数。2 170名研究对象中,457例(21.06%)患者乙型肝炎病毒表面抗原(hepatitis B surface antigen,HBs Ag)阳性,10例(0.46%)抗-丙肝病毒抗体(anti-hepatitis C virus Ig G,anti-HCV Ig G)阳性,3例HBs Ag和抗-HCV Ig G均为阳性。HBs Ag感染率为65.76%(457/695),丙肝病毒(hepatitis C virus,HCV)感染率为1.79%(10/558)。除24例研究对象乙肝疫苗接种史不详以外,其余均无乙肝疫苗接种史。2006-2014年粗发病率为60.50/10万,中国人口标化发病率为32.11/10万,世界人口标化发病率为43.60/10万。2012-2014年发病率出现逐年上升趋势。结论隆安县是肝癌高发区,且近年发病上升。乙肝病毒感染是隆安县肝癌发病主要危险因素之一。 展开更多
关键词 肝肿瘤 回顾性研究 发病率 危险因素
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华支睾吸虫排泄-分泌产物对小鼠巨噬细胞一氧化氮产生和核转录因子κB活化的影响 被引量:3
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作者 杨庆利 蒋智华 +2 位作者 申继清 陈颖丹 周晓农 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期96-100,共5页
目的研究华支睾吸虫(Clonorchis sinensis)排泄-分泌产物(ESPs)对小鼠巨噬细胞系RAW264.7一氧化氮(NO)产生与核转录因子κB(NF-κB)活化的影响。方法用20μg/ml华支睾吸虫ESPs水溶性浓缩物及其有机溶剂提取物(ESPs-ex)和0.1μg/ml明尼... 目的研究华支睾吸虫(Clonorchis sinensis)排泄-分泌产物(ESPs)对小鼠巨噬细胞系RAW264.7一氧化氮(NO)产生与核转录因子κB(NF-κB)活化的影响。方法用20μg/ml华支睾吸虫ESPs水溶性浓缩物及其有机溶剂提取物(ESPs-ex)和0.1μg/ml明尼苏达沙门氏杆菌脂多糖(LPS-SM)分别刺激RAW264.7细胞,未刺激对照组加入等量Hank’s平衡盐缓冲液(HBSS)。实验同时用0.3 mmol/L诱导型一氧化氮合成酶(i NOS)抑制剂SMT作为干预。细胞培养18 h后,用Griess法检测各组细胞培养上清液NO2-浓度。将p Ni Fty2-SEAP质粒转染至4组刺激后RAW264.7细胞,培养18 h后,检测培养上清液中可溶性胚胎碱性磷酸酶(SEAP)的吸光度(A620值),倒置显微镜观察细胞内SEAP催化显色情况。结果经ESPs-ex和LPS-SM刺激后,细胞培养上清液中NO2-浓度分别为(14.30±1.62)和(14.10±2.17)μmol/L,均较未刺激对照组[(7.70±0.95)μmol/L]显著增加(P<0.05);加入SMT后,两组NO2-浓度显著下降,分别为(8.97±0.81)和(4.96±1.36)μmol/L(均P<0.05)。经ESPs刺激后,上清液中NO2-浓度为(4.06±0.62)μmol/L,较未刺激对照组显著降低(P<0.05);加入SMT后,NO2-浓度为(3.99±0.87)μmol/L,无明显变化(P>0.05)。ESPs刺激后,上清液SEAP的A620值为0.836±0.005,显著高于未刺激对照组(0.097±0.009)(P<0.05);镜下可见细胞内出现广泛、强烈的蓝色显色反应。ESPs-ex和LPS刺激后,上清液SEAP的A620值分别为0.112±0.004和0.116±0.009,略高于未刺激对照组(P>0.05);镜下见部分细胞内出现蓝色显色反应。结论华支睾吸虫ESPs能够促进RAW264.7细胞活化NF-κB,其水溶性浓缩物可抑制NO产生,ESPs-ex和LPS-SM可促进NO产生。 展开更多
关键词 华支睾吸虫 排泄-分泌产物 病原相关分子模式 一氧化氮 核转录因子&kappa B
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广西地区水域隐孢子虫和贾第鞭毛虫的污染调查
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作者 林源 蒋智华 +7 位作者 唐雯茜 刘健 钟格梅 石云良 杨益超 黄江平 孟军 罗佐杰 《热带医学杂志》 CAS 2024年第7期1031-1035,共5页
目的了解广西部分城市、乡镇的水源水、出厂水及污水中隐孢子虫和贾第鞭毛虫污染情况,为医疗卫生、水利部门制定科学合理的防控措施提供理论依据。方法于2015年12月-2023年3月以广西地区珠江流域、红河流域、桂南沿海诸河的9条江以及中... 目的了解广西部分城市、乡镇的水源水、出厂水及污水中隐孢子虫和贾第鞭毛虫污染情况,为医疗卫生、水利部门制定科学合理的防控措施提供理论依据。方法于2015年12月-2023年3月以广西地区珠江流域、红河流域、桂南沿海诸河的9条江以及中部3个县的18个镇为采样点,使用《生活饮用水标准检验方法》(GB/T 5750.12-2023)中的多孔海绵滤膜模块采样及快速淘洗步骤对原水和出厂水进行采集并做隐孢子虫和贾第鞭毛虫检测,同时对水厂进行基本情况调查,检测39份出厂水中的水质相关指标,包括色度、浊度、pH、菌落总数、总大肠菌群、耐热大肠菌群、氯化物、硫酸盐、溶解性总固体、总硬度、耗氧量和氨氮。结果采集水样193份,隐孢子虫检出率为17.6%,贾第鞭毛虫检出率为14.5%;39份出厂水的其他水质检测指标超标率情况,色度为5.1%,浊度为2.6%,pH为5.1%,菌落总数为10.3%,总大肠菌群与耐热大肠菌群均为15.4%,耗氧量为5.1%,氨氮为10.3%,氯化物、硫酸盐、溶解性总固体、总硬度未超标。隐孢子虫与原水氯化物(r=-0.35,P<0.05)、原水硫酸盐(r=-0.34,P<0.05)、原水溶解性总固体(r=-0.45,P<0.05)、原水总硬度(r=-0.38,P<0.05)成负相关,与出厂水菌落总数(r=0.38,P<0.05)、原水浊度(r=0.34,P<0.05)成正相关;贾第鞭毛虫与原水溶解性总固体(r=-0.32,P<0.05)、原水总硬度(r=-0.39,P<0.05)、出厂水总硬度(r=-0.35,P<0.05)、出厂水pH(r=-0.35,P<0.05)成负相关,与出厂水菌落总数(r=0.34,P<0.05)成正相关。结论调查地区的部分原水和出厂水受到隐孢子虫和贾第鞭毛虫的污染,山泉水、水库水、江河水和地下水均有受到污染的风险,完善的水厂处理工艺可以有效地去除水中隐孢子虫和贾第鞭毛虫。 展开更多
关键词 隐孢子虫 贾第鞭毛虫 流域 污染
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