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贝塔-葡萄糖苷酶催化反应的最适pH值和最适温度的同时预测(英文) 被引量:3
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作者 严少敏 师德强 +1 位作者 农浩 吴光 《广西科学》 CAS 2011年第3期253-260,共8页
利用氨基酸特征同时预测贝塔-葡萄糖苷酶反应的最适pH值和最适温度。首先,用不同的氨基酸特征对贝塔-葡萄糖苷酶进行量化作为输入,以最适pH值和最适温度作为输出;然后用20-2前馈反向传播的神经网络进行训练;最后用子集验证、刀切验证和... 利用氨基酸特征同时预测贝塔-葡萄糖苷酶反应的最适pH值和最适温度。首先,用不同的氨基酸特征对贝塔-葡萄糖苷酶进行量化作为输入,以最适pH值和最适温度作为输出;然后用20-2前馈反向传播的神经网络进行训练;最后用子集验证、刀切验证和交叉验证三种方法进行验证。结果表明,在24个氨基酸特征中只有4个特征可以用于模型预测,其中氨基酸分布概率的预测结果优于其它指标,为基于氨基酸属性预测酶的功能参数提供了方法。 展开更多
关键词 氨基酸 贝塔-葡萄糖苷酶 最适PH值 最适温度 预测 工作条件
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Caerin的二维HP折叠结构
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作者 王何健 严少敏 吴光 《计算生物学》 2012年第4期34-41,共8页
采用标准化氨基酸疏水性指数将7种Caerins的氨基酸序列转换为28种疏水性(H)或极性(P)的序列,通过二维疏水性–极性(HP)模型分析其全部可能的折叠结构。结果显示Caerins有许多具有相同最小能量的天然形态,这些形态有各种各样对称的折叠结... 采用标准化氨基酸疏水性指数将7种Caerins的氨基酸序列转换为28种疏水性(H)或极性(P)的序列,通过二维疏水性–极性(HP)模型分析其全部可能的折叠结构。结果显示Caerins有许多具有相同最小能量的天然形态,这些形态有各种各样对称的折叠结构,而且这些天然形态可以根据标准化的氨基酸疏水性指标进一步从数值上加以区分。这项研究从疏水性–极性角度揭示了Caerin折叠结构的多样性,有助于理解蛋白质的折叠过程,并提示通过工程学方法修改抗菌肽的可能途径。 展开更多
关键词 Caerin 折叠结构 HP模型 疏水性指标 最小能量
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用随机漫步模型拟合39个贝塔世界城市1901~1998年的降水量(英文)
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作者 严少敏 吴光 《广西科学院学报》 2011年第3期205-210,共6页
用随机漫步模型拟合1901年至1998年39个贝塔世界城市的年降水量。先将每个城市的降水量转换为降水漫步和随机降水,再用随机漫步模型分别对转换数据和实际数据进行拟合。结果显示,该模型能够拟合降水漫步和实际降水,为降水建模提供了一... 用随机漫步模型拟合1901年至1998年39个贝塔世界城市的年降水量。先将每个城市的降水量转换为降水漫步和随机降水,再用随机漫步模型分别对转换数据和实际数据进行拟合。结果显示,该模型能够拟合降水漫步和实际降水,为降水建模提供了一种模型,表明此期间这些城市的降水呈现随机变化。 展开更多
关键词 贝塔世界城市 拟合 降水量 随机漫步
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