基于生物信息学探讨miR-15b-5p在头颈部鳞状细胞癌中的诊断价值和潜在作用机制

目的采用生物信息学探讨miR-15b-5p在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的诊断价值和潜在作用机制。方法(1)从GEO数据库和TCGA数据库中收集HNSCC的miR-15b-5p表达数据和/或HNSCC患者的临床资料。通过Meta分析miR-15b-5p在HNSCC中的表达情况及其诊断HNSCC的价值,使用SPSS 26.0软件分析miR-15b-5p表达水平与HNSCC患者临床特征的关系。利用实时荧光定量PCR检测HNSCC细胞和正常细胞中的miR-15b-5p表达水平。(2)通过miRWalk数据库和GEPIA2数据库分别筛选miR-15b-5p的下游靶基因和HNSCC的差异表达基因,对两者取交集后获得miR-15b-5p在HNSCC中的关键靶基因,对关键靶基因进行富集分析。(3)利用UALCAN数据库分析部分靶基因在HNSCC中的表达水平和甲基化水平。利用GEPIA2数据库分析部分关键靶基因表达情况与HNSCC患者无病生存期和总生存期的关系。结果(1)Meta分析结果显示,miR-15b-5p在HNSCC中呈高表达(P<0.05)。与正常细胞相比,miR-15b-5p在HNSCC细胞中的表达水平升高(P<0.05)。miR-15b-5p表达水平诊断HNSCC的敏感度、特异度、阳性似然比、阴性似然比和诊断优势比分别为0.70、0.72、2.15、0.48和7.33,汇总受试者工作特征曲线下面积为0.81。男性、年龄<60岁、N_(1)~N_(3)期患者的miR-15b-5p表达水平分别高于女性、年龄≥60岁、N_(0)期患者(P<0.05)。(2)共获得54个miR-15b-5p在HNSCC中的关键靶基因。功能富集分析结果提示,关键靶基因与细胞外基质密切相关;通路富集分析结果提示关键靶基因与多条信号通路密切相关,其中包含视黄醇代谢通路。(3)与正常组织相比,关键靶基因RDH12和UGT1A7在HNSCC组织中表达下调,关键靶基因UGT1A10和UGT1A7在HNSCC组织中的甲基化水平降低(P<0.05)。与UGT1A7表达量低的HNSCC患者相比,UGT1A7表达量高的HNSCC患者的无病生存期更长(P<0.05),但两者的总生存期差异无统计学意义(P>0.05)。结论miR-15b-5p与HNSCC的发生、发展密切相关,对HNSCC有潜在的诊断价值。miR-15b-5p可能通过靶向作用UGT1A7和RDH12基因来参与调控视黄醇代谢信号通路,从而影响HNSCC的发生、发展。