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2010~2012年广西壮族自治区HIV-1流行株pol基因亚型的分布情况
被引量:
9
1
作者
王洪
梁冰玉
+9 位作者
周波
蒋俊俊
黄颉刚
陈荣风
赵芳凝
王敏连
刘洁
李汶蔚
叶力
梁浩
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期79-84,共6页
目的分析广西壮族自治区(广西)HIV-1流行株poz基因亚型的分布情况。方法于2010年1月1日至2012年12月31日,采用方便抽样的方法,在广西11个城市开展调查,通过问卷调查收集调查对象的流行病学资料。纳入标准为:Westernblot确证HIV-1...
目的分析广西壮族自治区(广西)HIV-1流行株poz基因亚型的分布情况。方法于2010年1月1日至2012年12月31日,采用方便抽样的方法,在广西11个城市开展调查,通过问卷调查收集调查对象的流行病学资料。纳入标准为:Westernblot确证HIV-1阳性、病毒载量〉1000拷贝/ml、〉18岁及无特殊重大疾病。共招募到调查对象152例。采集每例调查对象5ml外周血并提取病毒基因组RNA,采用巢式RT—PCR扩增病毒pol区全长基因并测序;对所得序列修正后用Genotyping进行初步分型;采用MEGA5.03软件构建系统进化树对pol序列分型进行验证;采用RIP及jpHMMatGOBICS程序分析未知重组毒株的重组断点。结果152例HIV-1感染者共成功扩增出137例pof区全长基因,共获得127例HIV一1亚型判定,其中CRF01_AE占55.9%(71例),CRF08-BC占29.9%(38例),CRF07-BC占10.2%(13例),B(B’)占2.4%(3例),未知重组型占1.6%(2例)。广西11个城市以CRF01-AE亚型流行为主;异性性传播和注射毒品传播感染HIV-1者间CRF01_AE亚型分布差异有统计学意义(X2=15.07,P〈O.001),其比例分别为67.4%(58/86)和34.1%(14/41);21~35、36~60和〉60岁HIV.1感染者中,CRF01_AE亚型所占比例分别为43.6%(17/39)、57.6%(38/66)、77.3%(17/22),CRF_08BC亚型所占比例分别为43.6%(17/39)、28.8%(19/66)、9.1%(2/22),差异有统计学意义(X2=8.48,P=0.014)。2株未知重组型毒株的模式分别为CRF01_AE/B(B’)和CRF01_AE/C/B(B’)重组型。结论2010--2012年广西HIV-1流行株pol基因主要流行亚型为CRF01_AE,以异性性传播为主;出现的未知重组型毒株是由CRF01_AE与CRF_BC重组产生的。
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关键词
HIV-1
基因
感染
重组毒株
原文传递
题名
2010~2012年广西壮族自治区HIV-1流行株pol基因亚型的分布情况
被引量:
9
1
作者
王洪
梁冰玉
周波
蒋俊俊
黄颉刚
陈荣风
赵芳凝
王敏连
刘洁
李汶蔚
叶力
梁浩
机构
广西医科大学
公共卫生学院
广西
艾滋病
防治
研究
重点
实验室
广西艾滋病防治研究重点实验室广西医科大学医学实验中心
出处
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期79-84,共6页
基金
国家十二五重大专项(2012zxl0004910)
国家自然科学基金(81171624)
+3 种基金
国家自然科学基金(31360033)
国家自然科学基金(81360259)
广西自然科学基金(2013GxNsFBA01966)
广西医科大学青年基金(GxMuYsF201344)
文摘
目的分析广西壮族自治区(广西)HIV-1流行株poz基因亚型的分布情况。方法于2010年1月1日至2012年12月31日,采用方便抽样的方法,在广西11个城市开展调查,通过问卷调查收集调查对象的流行病学资料。纳入标准为:Westernblot确证HIV-1阳性、病毒载量〉1000拷贝/ml、〉18岁及无特殊重大疾病。共招募到调查对象152例。采集每例调查对象5ml外周血并提取病毒基因组RNA,采用巢式RT—PCR扩增病毒pol区全长基因并测序;对所得序列修正后用Genotyping进行初步分型;采用MEGA5.03软件构建系统进化树对pol序列分型进行验证;采用RIP及jpHMMatGOBICS程序分析未知重组毒株的重组断点。结果152例HIV-1感染者共成功扩增出137例pof区全长基因,共获得127例HIV一1亚型判定,其中CRF01_AE占55.9%(71例),CRF08-BC占29.9%(38例),CRF07-BC占10.2%(13例),B(B’)占2.4%(3例),未知重组型占1.6%(2例)。广西11个城市以CRF01-AE亚型流行为主;异性性传播和注射毒品传播感染HIV-1者间CRF01_AE亚型分布差异有统计学意义(X2=15.07,P〈O.001),其比例分别为67.4%(58/86)和34.1%(14/41);21~35、36~60和〉60岁HIV.1感染者中,CRF01_AE亚型所占比例分别为43.6%(17/39)、57.6%(38/66)、77.3%(17/22),CRF_08BC亚型所占比例分别为43.6%(17/39)、28.8%(19/66)、9.1%(2/22),差异有统计学意义(X2=8.48,P=0.014)。2株未知重组型毒株的模式分别为CRF01_AE/B(B’)和CRF01_AE/C/B(B’)重组型。结论2010--2012年广西HIV-1流行株pol基因主要流行亚型为CRF01_AE,以异性性传播为主;出现的未知重组型毒株是由CRF01_AE与CRF_BC重组产生的。
关键词
HIV-1
基因
感染
重组毒株
Keywords
HIV-1
Genes
Infection
Recombinant strain
分类号
R512.91 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2010~2012年广西壮族自治区HIV-1流行株pol基因亚型的分布情况
王洪
梁冰玉
周波
蒋俊俊
黄颉刚
陈荣风
赵芳凝
王敏连
刘洁
李汶蔚
叶力
梁浩
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
9
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