红花黄色素治疗颅脑损伤作用机制的生物信息学分析

目的应用生物信息学方法分析红花黄色素(YS)治疗颅脑损伤(TBI)的作用机制。方法通过GEO数据库查询检索基因表达微阵列芯片数据集GSE21854,筛选差异表达基因(DEGs),并与YS靶点基因互相印射取交集。采用DAVID/String数据库对共同靶基因进行GO分析和KEGG通路分析,构建PPI网络。结果筛选出140个DEGs,与YS靶点基因互相印射后得到26个共同靶基因;进一步GO分析前5个基因功能富集为信号转导、DNA转录调节、血小板活化、信号与聚集、免疫系统及转录调控区DNA结合,KEGG通路途径分析筛选出前5条信号通路包括MAPK信号通路、趋化因子信号通路、PI3K/AKT信号通路、EG⁃FR1信号通路和肿瘤信号通路。PPI分析筛选发现节点最高的中心蛋白编码基因是MAPK3。结论应用生物信息学方法,可有效获取YS治疗TBI靶向基因的生物学功能、相关信号通路及核心关键蛋白,为后续研究和临床治疗提供了依据。