不同产驹数阳原驴血液转录组分析

【目的】筛选影响阳原驴产驹数的关键基因与相关通路,提高阳原驴繁殖性能。【方法】以健康产双驹和产单驹阳原驴静脉全血为样本进行转录组高通量测序,与参考基因组非洲野驴(Equus asinus(ass))比对后筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行GO功能及KEGG通路富集分析,筛选与阳原驴产驹数相关的基因。随机挑选5个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证。【结果】与产单驹组相比,产双驹组共筛选出1336个差异表达基因,其中723个上调,613个下调。GO功能富集分析显示,差异表达基因主要在受体活性、信号转导等条目中富集;KEGG通路富集分析显示,卵巢胆固醇生成和雌激素信号通路在富集通路前20位,并筛选出IGF1、IGF1R、INSR和ADCY3共4个与阳原驴产驹数相关的候选基因。实时荧光定量PCR结果与转录组测序结果一致,证实转录组测序结果可靠。【结论】不同产驹数阳原驴差异表达基因富集在卵巢类固醇生成和雌激素信号通路,IGF1、IGF1R、INSR和ADCY3基因参与卵巢激素分泌且均在产双驹组中表达上调。研究结果可为进一步阐明阳原驴不同产驹数的分子机制提供参考。