三倍体茶树‘西莲1号’叶绿体基因组特征及系统发育分析

三倍体茶树品种‘西莲1号’是桑植白茶产业发展的主推品种,与湖南现有茶树品种相比具有很强的特异性。为揭示‘西莲1号’的分类和演化地位,项目采用叶绿体(Chloroplast,cp)全基因组测序技术进行了‘西莲1号’全基因组测序,并对其所有的SSR标记进行了开发与筛选。结果表明:(1)‘西莲1号’叶绿体基因组全长为157038 bp,GC含量为37.30%,为一个四分体结构,包括1个大的单拷贝(LSC)、一个小的单拷贝(SSC)和一对反向重复序列(IR),长度分别为86612 bp、18282 bp和26072 bp。cpDNA共注释得到132个基因,其中unigenes有114个,包含80个编码基因,30个tRNA基因和4个rRNA基因。(2)共鉴定出245个简单序列重复(SSR),通过筛选有15个SSR具有较高的多态性。获得了cpDNA基因组20个氨基酸的偏好密码子,‘西莲1号’密码子偏好以A/T碱基结尾。(3)基因选择压力分析表明,与茶组其他资源相比,6个基因(accD、ndhC、petB、rpl16、rpoC1、rpoC2)可能处于正选择状态。(4)基于叶绿体基因组序列构建了基于22份茶组植物的系统发育树,聚类结果显示‘西莲1号’与其他栽培型茶树品种(Camellia sinensis var.sinensis)处于系统发育树的末端,属于进化的茶树资源类型。

“西莲云雾”茶的二十年

西莲乡位于我国武陵山脉优质绿茶产业带的张家界市桑植县东部，海拔800m左右，年降水量1200～1600mm，常年云雾缭绕，生态条件十分优越，独特的自然环境形成了优良的茶叶内在品质。该地加工的“西莲云雾”绿茶因品质优异，在清朝乾隆年间就已作为贡品而誉满三湘。为了促进当地茶产业发展，发挥当地传统优势特色产业，1992年，唐兴次与唐怀廷父子在西莲乡玉京村创办了“玉京茶厂”——张家界西莲茶业有限责任公司前身。经过20年的发展，公司已由原来的小作坊发展成为一家集种植、收购、加工、销售于一体的市级龙头企业。