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微阵列数据分析和错误发现率
被引量:
2
1
作者
王婷
曾平
+1 位作者
黄水平
赵华硕
《郑州大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2013年第1期59-62,共4页
目的:介绍微阵列数据的差异表达分析和基于错误发现率的多重假设检验。方法:通过t检验对一个关于前列腺癌的微阵列数据进行基因差异表达分析,采用BH程序进行错误发现率的控制和经验估计。结果:当错误发现率为0.05时通过BH程序得到21个...
目的:介绍微阵列数据的差异表达分析和基于错误发现率的多重假设检验。方法:通过t检验对一个关于前列腺癌的微阵列数据进行基因差异表达分析,采用BH程序进行错误发现率的控制和经验估计。结果:当错误发现率为0.05时通过BH程序得到21个差异表达基因;当以|t|≥3作为拒绝域时,得到105个基因,对应的错误发现率估计值为0.20。结论:相对传统的总体错误率,错误发现率更加适合于微阵列这种高维数据多重比较的错误控制;而且能同时控制或估计错误发现率。
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关键词
微阵列数据
多重假设检验
错误发现率
控制和估计
前列腺癌
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职称材料
题名
微阵列数据分析和错误发现率
被引量:
2
1
作者
王婷
曾平
黄水平
赵华硕
机构
徐州医学院公共卫生学院流行病学与卫生统计学教研室
南京医科大
学
公共
卫生
学院
流行病
学
与卫生
统计学
教研室
出处
《郑州大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2013年第1期59-62,共4页
基金
江苏省教育厅高校哲学社会科学研究基金资助项目2010SJB790037
徐州医学院公共卫生学院科研课题资助项目201107
201115
文摘
目的:介绍微阵列数据的差异表达分析和基于错误发现率的多重假设检验。方法:通过t检验对一个关于前列腺癌的微阵列数据进行基因差异表达分析,采用BH程序进行错误发现率的控制和经验估计。结果:当错误发现率为0.05时通过BH程序得到21个差异表达基因;当以|t|≥3作为拒绝域时,得到105个基因,对应的错误发现率估计值为0.20。结论:相对传统的总体错误率,错误发现率更加适合于微阵列这种高维数据多重比较的错误控制;而且能同时控制或估计错误发现率。
关键词
微阵列数据
多重假设检验
错误发现率
控制和估计
前列腺癌
Keywords
microarray data
multiple hypotheses testing
false discovery rate
control and estimation
prostate cancer
分类号
R195.1 [医药卫生—卫生统计学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
微阵列数据分析和错误发现率
王婷
曾平
黄水平
赵华硕
《郑州大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2013
2
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