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基于生物信息学辨认阿尔茨海默病关键基因及通路的改变
被引量:
1
1
作者
许灿坤
刘久煜
+2 位作者
郑英伟
牛海晨
杨荣礼
《徐州医科大学学报》
CAS
2022年第7期484-490,共7页
目的使用生物信息学数据处理方法,初步探讨阿尔茨海默病(AD)潜在的分子机制。方法通过GEO2R筛选GSE5281和GSE132903数据集中的差异表达基因(DEGs),利用Metascape、STRING和Cytoscape软件对DEGs进行系统的生物信息学分析,并通过qPCR方法...
目的使用生物信息学数据处理方法,初步探讨阿尔茨海默病(AD)潜在的分子机制。方法通过GEO2R筛选GSE5281和GSE132903数据集中的差异表达基因(DEGs),利用Metascape、STRING和Cytoscape软件对DEGs进行系统的生物信息学分析,并通过qPCR方法在AD模型小鼠中对筛选到的关键基因进行验证。结果在2个数据集中共筛选出250个重叠的DEGs,主要富集于突触传递、神经系统等条目。通过构建蛋白-蛋白作用网络(PPI),筛选关键基因并验证,最终选出4个关键基因,分别为突触相关蛋白25(SNAP25)、突触蛋白Ⅰ(SYN1)、γ-氨基丁酸A型受体γ2亚基(GABRG2)、突触结合蛋白Ⅳ(SYT4)。结论AD的发病与SNAP25、SYN1、GABRG2、SYT4基因密切相关,主要涉及突触神经递质释放过程。这些发现将有助于深入了解AD发病的分子机制,为未来新药物开发提供潜在的作用靶点,为疾病早期诊断及治疗提供新思路。
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关键词
阿尔茨海默病
生物信息学
差异表达基因
化学突触传递
关键基因
下载PDF
职称材料
题名
基于生物信息学辨认阿尔茨海默病关键基因及通路的改变
被引量:
1
1
作者
许灿坤
刘久煜
郑英伟
牛海晨
杨荣礼
机构
薛城区人民医院
徐州医科大学生物信息脑病重点实验室
徐州
医科
大学
附属医院老年医学科
出处
《徐州医科大学学报》
CAS
2022年第7期484-490,共7页
基金
徐州市科技局创新研发计划(KY14042012)。
文摘
目的使用生物信息学数据处理方法,初步探讨阿尔茨海默病(AD)潜在的分子机制。方法通过GEO2R筛选GSE5281和GSE132903数据集中的差异表达基因(DEGs),利用Metascape、STRING和Cytoscape软件对DEGs进行系统的生物信息学分析,并通过qPCR方法在AD模型小鼠中对筛选到的关键基因进行验证。结果在2个数据集中共筛选出250个重叠的DEGs,主要富集于突触传递、神经系统等条目。通过构建蛋白-蛋白作用网络(PPI),筛选关键基因并验证,最终选出4个关键基因,分别为突触相关蛋白25(SNAP25)、突触蛋白Ⅰ(SYN1)、γ-氨基丁酸A型受体γ2亚基(GABRG2)、突触结合蛋白Ⅳ(SYT4)。结论AD的发病与SNAP25、SYN1、GABRG2、SYT4基因密切相关,主要涉及突触神经递质释放过程。这些发现将有助于深入了解AD发病的分子机制,为未来新药物开发提供潜在的作用靶点,为疾病早期诊断及治疗提供新思路。
关键词
阿尔茨海默病
生物信息学
差异表达基因
化学突触传递
关键基因
Keywords
Alzheimer disease
bioinformatics
differentially expressed genes
chemical synaptic transmission
hub genes
分类号
R749.1 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学辨认阿尔茨海默病关键基因及通路的改变
许灿坤
刘久煜
郑英伟
牛海晨
杨荣礼
《徐州医科大学学报》
CAS
2022
1
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