中国旱獭（M.himalayana）GAPDH分子的部分cDNA克隆及序列分析

目的对新近建立的乙肝研究动物模型喜马拉雅旱獭3-磷酸甘油醛脱氢酶（GAPDH）的部分cDNA序列进行了克隆和序列分析．为该模型在HBV感染研究中的应用奠定基础。方法根据Genbank的人GAPDHeDNA的序列设计特异性引物．以提取的旱獭脾组织总RNA为模板,RT-PCR扩增旱獭GAPDH cDNA序列。纯化的PCR产物连接至T载体（pMD18-T），然后构建重组质粒pMD18-T-mhGAPDH。对重组质粒进行PCR初筛、酶切鉴定，将阳性克隆测序。对序列进行同源性以及种系进化分析。结果扩增的旱獭GAPDH序列为535bp，编码序列为533bp（nt3-335），编码177个氨基酸。获得的序列和其它类哺乳动物GAPDH的同源性均在88％以上，其中与土拨鼠GAPDH的同源性最高（99．62％），氨基酸序列同源性高达100％。构建种系进化树，分析结果提示喜马拉雅旱獭GAPDH与土拨鼠GAPDH的亲缘关系最接近。结论成功的克隆了喜马拉雅旱獭GAPDH的部分序列。序列分析结果提示喜马拉雅旱獭GAPDH与土拨鼠GAPDH的亲缘关系最近，同源性最高。