德宏水牛微卫星标记分析的群体遗传变异

德宏水牛是云南省地方水牛的优良品种之一,为了进一步阐明其群体遗传变异和遗传结构,筛选了分别位于水牛14条染色体上的15对微卫星引物,对德宏水牛81个个体进行了检测分析。共检测到62个等位基因,每个座位等位基因数目从2到6个不等,平均等位基因数为4.13,该水牛群体期望杂合度和多态信息含量分别为0.6520±0.1526和0.5863±0.1789,各座位的遗传分化系数在0～0.0919之间,平均值为0.0202。每个座位的基因流较大,平均12.1502。研究结果表明德宏水牛群体遗传多样性较丰富,亚群间的遗传分化程度低,基因流较大,且很少发生近交。

德宏水牛和摩拉水牛及杂交后代的遗传差异分析

为了解德宏水牛、摩拉水牛及二者杂交后代之间的遗传差异,本研究采用随机扩增多态性DNA标记技术,从70个随机引物中筛选出11个多态性丰富的引物对德宏水牛、摩拉水牛及二者杂交后代共80个个体进行了遗传变异检测,结果11条引物共产生89种扩增片段,多态片段73条,多态率82.02%。两亲本群体相对遗传距离为0.2203,杂交后代群体与德宏水牛、摩拉水牛群体的相对遗传距离分别为0.1017和0.1353,表明杂交后代群体与两亲本群体间的遗传差异小于两亲本群体间的遗传差异,杂交后代群体与德宏水牛群体遗传关系更接近。

12个水牛群体催乳素基因第4外显子遗传特征分析

催乳素对水牛乳腺发育、泌乳和乳蛋白基因的表达有明显的调控作用。该研究采用直接测序并结合PCR-SSCP技术,分析沼泽型水牛和河流型水牛12个群体385个个体的催乳素基因(PRL)第4外显子(exon4)的遗传特征。结果表明:水牛PRLexon4由180个核苷酸组成,在不同物种中具有高度保守性。序列分析发现水牛中该外显子的第109位碱基处有C>T替换,为沉默突变,与泌乳性状之间无显著相关性。在9个沼泽型水牛群体中均检测到该突变位点,其中PBA基因在7个沼泽型水牛群体中为优势基因,PBB基因在德宏和富钟群体中为优势基因,沼泽型水牛群体中PBA基因频率在0.400～0.917之间,群体平均值为0.629±0.049,具有地域分布特征。在3个河流型水牛群体中,第109位核苷酸处均为C,未检测到多态。提示河流型水牛与沼泽型水牛已有较大的遗传分化。

配子共孵育时间对水牛卵母细胞体外受精的影响

试验对比了配子共孵育17 h、18 h、20 h、21 h、22 h、23 h和24 h对卵裂率的影响。结果表明,延长精卵共孵育时间使卵裂率有下降的趋势,卵裂率最高的共孵育时间为18 h,在17～24 h的共孵育时间内,卵裂率具有明显的波动。

季节对沼泽型水牛采卵效果和卵母细胞体外成熟的影响

利用屠宰场屠宰的沼泽型水牛卵巢采集卵母细胞,统计了一年中4个季度1—3、4—6、7—9、10—12月份每个卵巢平均获卵母细胞总数、可用卵母细胞数及不可用卵母细胞数。结果:每个卵巢平均获卵母细胞总数分别为4.06枚±0.63枚、4.62枚±0.75枚、4.50枚±1.06枚、3.87枚±1.34枚,其中可用卵母细胞数分别为1.70枚±0.57枚、1.86枚±0.55枚、2.06枚±0.63枚和1.67枚±0.50枚;4个季度卵母细胞成熟率分别为:(81.5±6.2)%、(70.7±5.6)%、(70.7±9.3)%和(77.0±6.9)%。以上结果表明,在每个卵巢平均获卵母细胞总数上,4—6月份、7—9月份两季度显著高于10—12月份(P<0.05),其他季节间没有显著性差异(P>0.05);7—9月份每个卵巢平均获可用卵母细胞数最高,显著高于1—3月份和10—12月份(P<0.05),但与4—6月份之间没有显著性差异(P>0.05);4个季度不可用卵母细胞数之间没有差异(P>0.05);4个季度卵母细胞的体外成熟能力上也没有显著差异(P>0.05)。

黑色素皮质素受体1基因对水牛毛色遗传的影响

MC1R在很多动物的色素沉积过程中发挥关键作用.为了阐明MC1R基因是否与水牛毛色性状相关,本研究对216头遗传背景清楚的水牛进行了该基因编码区DNA序列测定.研究的样品包括49头黑色河流型水牛(包括摩拉水牛和尼里-拉菲水牛),136头毛色为灰色或白色的沼泽型水牛(包括德宏水牛、滇东南水牛、德昌水牛、贵州水牛和西林水牛)和31头尼里-拉菲水牛或摩拉水牛与沼泽型水牛的杂交后代.序列分析发现在水牛群体中存在3个单核苷酸突变位点(SNPs),其中SNP684是同义替换,而SNP310和SNP384为非同义替换,并分别导致p.G104S和p.M128I氨基酸的改变.只有基因型为河流型等位基因纯合子EBR/EBR的个体毛色表型为黑色.对黑色河流型水牛与灰色沼泽型水牛的杂交后代基因型和毛色表型的分析进一步揭示:河流型等位基因EBR或编码p.104S的等位基因对保证MC1R具有正常功能起重要作用.生物信息学功能分析显示,p.G104S和p.M128I两个氨基酸替换对MC1R的功能有显著影响,进一步支持EBR等位基因或编码p.104S的等位基因与水牛黑色性状相关.