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用图论方法研究核酸序列的密码子使用与基因表达水平的关系
被引量:
8
1
作者
张连顺
王吉华
姜万禄
《生物数学学报》
CSCD
1998年第1期65-73,共9页
研究了Escherichiacoli(115个基因)和SacharomycesYeast(97个基因)核酸序列的密码子使用频率与基因表达水平的关系.将同义密码子按使用频率统计值分成三种特性的密码子:最适密码子(H)、非最适密码子(L)和稀有密码子(R),对...
研究了Escherichiacoli(115个基因)和SacharomycesYeast(97个基因)核酸序列的密码子使用频率与基因表达水平的关系.将同义密码子按使用频率统计值分成三种特性的密码子:最适密码子(H)、非最适密码子(L)和稀有密码子(R),对每一基因序列的编码区,算出它们各自出现的概率P(H),P(L)和P(R).以P(H)和P(R)为指标,用图论法聚类,发现每种生物的高低表达基因明显分开,基因表达水平被分为四级:甚高表达基因(VH)、高表达基因(H)、较低表达基因(LM)和低表达基因(LL).每类基因的表达水平与实验结果保持了很好的相关性,与E.coli和Yeast的现有资料相比,符合很好.
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关键词
密码子
核酸序列
基因表达水平
最小支撑树
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职称材料
论信息熵和似然函数的极值关系
2
作者
姜万碌
王吉华
《曲阜师范大学学报(自然科学版)》
CAS
1994年第S2期17-18,共2页
给出似然函数与熵函数的关系式,得出熵极大时,似然极小;似然极大时,熵极小的结论。
关键词
信息熵
似然函数
熵函数
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职称材料
低能电子同原子弹性散射的半经典交换势
3
作者
苏春清
李毓成
《辽宁大学学报(自然科学版)》
CAS
1994年第1期39-44,共6页
本文在原有的半经典交换势(SCE)基础上,考虑高阶修正后给出新的半经典交换势,并利用这种新的交换势计算了e-He弹性散射,发现在低能区的相移和微分截面都有明显改进,并与实验和其它理论值符合较好.
关键词
电子
弹性散射
半经典交换势
原子
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职称材料
等熵方程与生物熵限方程
4
作者
王吉华
《生物数学学报》
CSCD
北大核心
1996年第S1期110-113,共4页
本文分析了等熵方程;推导出核酸序列的熵限方程,率先提出了生物进化过程中核酸序列选择的熵原则;绘制了分析核酸序列熵变的等熵图.
关键词
等熵方程
等熵图
生物熵限方程
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职称材料
e-He弹性散射的相移计算
5
作者
柳永亮
苏春清
《烟台师范学院学报(自然科学版)》
1999年第1期35-38,共4页
用与半经典交换势(SCE)不同的三种交换势计算了低能e-He弹性散射的相移,结果表明,这三种势均在不同程度上改善了SCE势的结果.
关键词
弹性散射
相移
半经典交换势
氦原子
交换势
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职称材料
题名
用图论方法研究核酸序列的密码子使用与基因表达水平的关系
被引量:
8
1
作者
张连顺
王吉华
姜万禄
机构
德州师专物理系
出处
《生物数学学报》
CSCD
1998年第1期65-73,共9页
基金
山东省自然科学基金
文摘
研究了Escherichiacoli(115个基因)和SacharomycesYeast(97个基因)核酸序列的密码子使用频率与基因表达水平的关系.将同义密码子按使用频率统计值分成三种特性的密码子:最适密码子(H)、非最适密码子(L)和稀有密码子(R),对每一基因序列的编码区,算出它们各自出现的概率P(H),P(L)和P(R).以P(H)和P(R)为指标,用图论法聚类,发现每种生物的高低表达基因明显分开,基因表达水平被分为四级:甚高表达基因(VH)、高表达基因(H)、较低表达基因(LM)和低表达基因(LL).每类基因的表达水平与实验结果保持了很好的相关性,与E.coli和Yeast的现有资料相比,符合很好.
关键词
密码子
核酸序列
基因表达水平
最小支撑树
Keywords
Codon usage,gene expression level,minimum support tree
分类号
Q753 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
论信息熵和似然函数的极值关系
2
作者
姜万碌
王吉华
机构
德州师专物理系
出处
《曲阜师范大学学报(自然科学版)》
CAS
1994年第S2期17-18,共2页
文摘
给出似然函数与熵函数的关系式,得出熵极大时,似然极小;似然极大时,熵极小的结论。
关键词
信息熵
似然函数
熵函数
分类号
O172 [理学—基础数学]
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职称材料
题名
低能电子同原子弹性散射的半经典交换势
3
作者
苏春清
李毓成
机构
德州师专物理系
出处
《辽宁大学学报(自然科学版)》
CAS
1994年第1期39-44,共6页
文摘
本文在原有的半经典交换势(SCE)基础上,考虑高阶修正后给出新的半经典交换势,并利用这种新的交换势计算了e-He弹性散射,发现在低能区的相移和微分截面都有明显改进,并与实验和其它理论值符合较好.
关键词
电子
弹性散射
半经典交换势
原子
Keywords
Low-energyelectron,Elastic scattering,Semiclassical exchange potential.
分类号
O562.5 [理学—原子与分子物理]
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职称材料
题名
等熵方程与生物熵限方程
4
作者
王吉华
机构
德州师专物理系
出处
《生物数学学报》
CSCD
北大核心
1996年第S1期110-113,共4页
基金
山东省自然科学基金
文摘
本文分析了等熵方程;推导出核酸序列的熵限方程,率先提出了生物进化过程中核酸序列选择的熵原则;绘制了分析核酸序列熵变的等熵图.
关键词
等熵方程
等熵图
生物熵限方程
Keywords
The isentropic equation the entropy limit equation of species
分类号
Q-332 [生物学]
下载PDF
职称材料
题名
e-He弹性散射的相移计算
5
作者
柳永亮
苏春清
机构
德州师专物理系
出处
《烟台师范学院学报(自然科学版)》
1999年第1期35-38,共4页
文摘
用与半经典交换势(SCE)不同的三种交换势计算了低能e-He弹性散射的相移,结果表明,这三种势均在不同程度上改善了SCE势的结果.
关键词
弹性散射
相移
半经典交换势
氦原子
交换势
Keywords
elastic scattering,phase shift,semiclassical exchange potential
分类号
O562.5 [理学—原子与分子物理]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用图论方法研究核酸序列的密码子使用与基因表达水平的关系
张连顺
王吉华
姜万禄
《生物数学学报》
CSCD
1998
8
下载PDF
职称材料
2
论信息熵和似然函数的极值关系
姜万碌
王吉华
《曲阜师范大学学报(自然科学版)》
CAS
1994
0
下载PDF
职称材料
3
低能电子同原子弹性散射的半经典交换势
苏春清
李毓成
《辽宁大学学报(自然科学版)》
CAS
1994
0
下载PDF
职称材料
4
等熵方程与生物熵限方程
王吉华
《生物数学学报》
CSCD
北大核心
1996
0
下载PDF
职称材料
5
e-He弹性散射的相移计算
柳永亮
苏春清
《烟台师范学院学报(自然科学版)》
1999
0
下载PDF
职称材料
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