基于生物信息学筛选与铁死亡有关的非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药DEGs

目的基于生物信息学筛选与铁死亡有关的非小细胞肺癌(NSCLC)表皮生长因子受体(EGFR)-酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)耐药差异表达基因(DEGs)。方法从基因表达综合数据库(GEO)中选取NSCLC EGFR-TKIs耐药的细胞测序基因集GSE117846,从中筛选P<0.05且|log 2FC|≥1(FC表示变化倍数)的DEGs。利用FerrDb数据库获取铁死亡相关基因。采用jvenn对从GSE117846数据集中筛选得到的DEGs与从FerrDb数据库中获取的铁死亡相关基因取交集。对交集基因进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并绘制蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。采用Cytoscape软件中的Cytohubba插件计算交集基因的评分,取评分前10的基因用于Hub基因的筛选。利用ULCAN和GEPIA2数据库分析Hub基因在NSCLC中的表达及对患者生存预后的影响。通过实时荧光定量PCR(qPCR)检测Hub基因mRNA在NSCLC患者癌组织和癌旁组织及体外细胞中的相对表达水平,验证生物信息学的分析结果。结果共筛选获得60个与铁死亡有关的NSCLC EGFR-TKIs耐药DEGs,包括30个上调基因和30个下调基因。这60个基因主要富集在P53信号通路、铁死亡通路、FoxO信号通路。PPI网络中有57个节点和99条边,平均聚类系数为0.377,PPI富集P<0.01。Cytohubba插件筛选得到的Hub基因为肿瘤蛋白P63(TP63)。ULCAN和GEPIA2数据库分析显示,肺腺癌组织中的TP63表达水平低于正常组织,而肺鳞癌组织中的TP63表达水平高于正常组织,差异均有统计学意义(P<0.05);在肺腺癌患者中,TP63高、低表达组的生存预后比较,差异无统计学意义(P>0.05),而在肺鳞癌患者中,TP63低表达组的生存预后较好,差异有统计学意义(P<0.05)。qPCR检测显示,与癌旁组织相比,TP63 mRNA在肺鳞癌组织中高表达,在肺腺癌组织中低表达,差异均有统计性意义(P<0.05);在体外细胞中检测到TP63 mRNA在对吉非替尼耐药的PC9/GR细胞中表达下调(P<0.05),与生物信息学的分析结果一致。结论TP63可能为连接NSCLC EGFR-TKIs耐药与铁死亡的重要基因。

基于CEASE理论的ICU医疗设备临床警报管理方案构建及实践

目的:构建基于CEASE理论的医疗设备临床警报管理模式,评价其实施效果,探索病人安全管理的新方法。方法:以多参数心电监护仪为例,基于CEASE理论中沟通、电极、合理、设置、教育5个重要方面,建立多学科警报管理团队,共同制订警报管理策略,并进行实践。结果:重症监护室(ICU)医疗设备警报数量明显减少,警报应答率显著提高,护士的警报知识、态度和行为得分也较前提升。结论:通过实施基于CEASE理论的ICU医疗设备临床警报管理模式,提升了护士的警报管理能力,有效改进了医疗设备的警报管理效果。