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高毒力艰难梭菌的基因型和毒力相关基因检测
被引量:
2
1
作者
肖克林
金萍
+5 位作者
黄丽清
梁霞
周天祥
王中兴
王秦宁
孔繁荣
《国际检验医学杂志》
CAS
2015年第8期1021-1025,共5页
目的鉴定莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株的基因型和毒素相关基因的携带情况。方法 22株莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株收集自澳大利亚悉尼地区,利用基于荧光毛细管电泳的聚合酶链反应(PCR)-核糖体分型技术对其进行基因分型;利用PCR方...
目的鉴定莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株的基因型和毒素相关基因的携带情况。方法 22株莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株收集自澳大利亚悉尼地区,利用基于荧光毛细管电泳的聚合酶链反应(PCR)-核糖体分型技术对其进行基因分型;利用PCR方法检测其毒素A、B编码基因tcdA、tcdB和二元毒素编码基因cdtA、cdtB;利用PCR-基因测序方法检测毒素调节基因tcdC的基因序列,通过与参考菌株VPI 10463(Genbank收录号:X92982)比对了解其基因突变情况,通过与Genbank中的序列比对确定其序列型。结果 21株菌株为高毒力核糖体型027(RT027),另1株为RT078;22株菌株毒力编码基因均为tcdA+tcdB+cdtA+cdtB+;21株RT027 tcdC序列型为sc1,另1株RT078序列型为WA39,与参考株VPI 10463比较,RT027菌株tcdC序列均出现连续18个核苷酸(nt330-347)的缺失和第117位单核苷酸的缺失,RT078菌株则出现连续39个核苷酸(nt341-379)的缺失和第184位(C>T)的突变。结论高毒力RT027是最常见的莫西沙星耐药的艰难梭菌基因型;高毒力RT027和RT078均携带毒素A、B和二元毒素编码基因,且毒素调节基因tcdC均存在基因突变。
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关键词
艰难梭菌
基于荧光毛细管电泳的PCR-核糖体分型
毒素A、B
二元毒素
毒素调节基因
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职称材料
题名
高毒力艰难梭菌的基因型和毒力相关基因检测
被引量:
2
1
作者
肖克林
金萍
黄丽清
梁霞
周天祥
王中兴
王秦宁
孔繁荣
机构
深圳市宝安区妇幼保健院
中心
实验室
深圳市宝安区妇幼保健院儿科ICU
深圳市宝安区妇幼保健院检验科
深圳市宝安区妇幼保健院药剂科
悉尼大学韦德特米德医院感染性疾病和微生物中心
出处
《国际检验医学杂志》
CAS
2015年第8期1021-1025,共5页
基金
深圳市宝安区科技计划项目(2013071
2014083)
文摘
目的鉴定莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株的基因型和毒素相关基因的携带情况。方法 22株莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株收集自澳大利亚悉尼地区,利用基于荧光毛细管电泳的聚合酶链反应(PCR)-核糖体分型技术对其进行基因分型;利用PCR方法检测其毒素A、B编码基因tcdA、tcdB和二元毒素编码基因cdtA、cdtB;利用PCR-基因测序方法检测毒素调节基因tcdC的基因序列,通过与参考菌株VPI 10463(Genbank收录号:X92982)比对了解其基因突变情况,通过与Genbank中的序列比对确定其序列型。结果 21株菌株为高毒力核糖体型027(RT027),另1株为RT078;22株菌株毒力编码基因均为tcdA+tcdB+cdtA+cdtB+;21株RT027 tcdC序列型为sc1,另1株RT078序列型为WA39,与参考株VPI 10463比较,RT027菌株tcdC序列均出现连续18个核苷酸(nt330-347)的缺失和第117位单核苷酸的缺失,RT078菌株则出现连续39个核苷酸(nt341-379)的缺失和第184位(C>T)的突变。结论高毒力RT027是最常见的莫西沙星耐药的艰难梭菌基因型;高毒力RT027和RT078均携带毒素A、B和二元毒素编码基因,且毒素调节基因tcdC均存在基因突变。
关键词
艰难梭菌
基于荧光毛细管电泳的PCR-核糖体分型
毒素A、B
二元毒素
毒素调节基因
Keywords
Clostridium difficile
sequencer capillary gel electrophoresis based PCR-ribotyping
toxin A and B
binary toxin
toxin regulator gene
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高毒力艰难梭菌的基因型和毒力相关基因检测
肖克林
金萍
黄丽清
梁霞
周天祥
王中兴
王秦宁
孔繁荣
《国际检验医学杂志》
CAS
2015
2
下载PDF
职称材料
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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