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艰难梭菌数字化聚合酶链反应-核糖体分型方法及参考图谱的建立
被引量:
3
1
作者
肖克林
王中兴
+3 位作者
周天祥
麦光兴
王秦宁
孔繁荣
《中华传染病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期111-114,共4页
目的建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体分型方法及常见基因型的参考图谱。方法利用荧光毛细管电泳技术代替琼脂糖凝胶电泳检测艰难梭菌PCR-核糖体分型产物,建立数字化PCR-核糖体分型方法;利用40株分属于10种核糖体型(RT)的艰难梭菌参考...
目的建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体分型方法及常见基因型的参考图谱。方法利用荧光毛细管电泳技术代替琼脂糖凝胶电泳检测艰难梭菌PCR-核糖体分型产物,建立数字化PCR-核糖体分型方法;利用40株分属于10种核糖体型(RT)的艰难梭菌参考菌株构建常见基因型的数字化参考图谱。结果荧光毛细管电泳技术准确地检测出40株艰难梭菌参考菌株的PCR-核糖体分型片段,并以数字化的形式呈现,10种核糖体型艰难梭菌的PCR-核糖体分型数字化图谱差异明显。同为RT027的21株菌株间、RT002的3株菌株间和RT015的2株菌株间的数字化分型结果相似性都非常高,而7株RT001菌株则可分为4种亚型,2株RT014分为2种亚型。结论成功建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体分型方法,同时构建了艰难梭菌10种核糖体型的数字化PCR-核糖体分型参考数据库。
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关键词
梭菌
难辨
PCR-核糖体分型
荧光毛细管电泳
数字化
数据库
原文传递
滚环扩增技术检测耐氟康唑白念珠菌TAC1点突变
被引量:
2
2
作者
王惠平
孔繁荣
+1 位作者
王斌
刘全忠
《中华皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第8期529-533,共5页
目的 利用滚环扩增技术检测耐氟康唑白念珠菌的TAC1点突变,建立一种准确、快速、特异的检测核酸单点突变的方法,同时进一步了解TAC1点突变与耐药的关系.方法 收集33株耐氟康唑白念珠菌(8株来自美国,25株来自澳大利亚),根据文献报道的...
目的 利用滚环扩增技术检测耐氟康唑白念珠菌的TAC1点突变,建立一种准确、快速、特异的检测核酸单点突变的方法,同时进一步了解TAC1点突变与耐药的关系.方法 收集33株耐氟康唑白念珠菌(8株来自美国,25株来自澳大利亚),根据文献报道的与耐药有关的点突变和挂锁探针设计原则设计4个挂锁探针.提取DNA、PCR扩增获得TAC1的三个目的 片段;然后用滚环扩增技术检测耐药株的点突变.将滚环扩增所得结果与测序结果进行比较.结果 33株耐氟康唑白念珠菌中,有5株TAC1出现与耐药相关的点突变,分别为T225A(1株)和A736V(4株),其中4株菌来自美国.4株氟康唑敏感白念珠菌中TAC1未见与耐药相关的点突变.结论 滚环扩增技术能准确、快速检测核酸单点突变;TAC1点突变与耐药的关系有待进一步研究.
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关键词
念珠菌
白色
氟康唑
抗药性
真菌
点突变
滚环扩增技术
原文传递
莫西沙星耐药的艰难梭菌多重聚合酶链反应检测和基因分型
被引量:
1
3
作者
黄丽清
肖克林
+2 位作者
周天祥
王中兴
孔繁荣
《中华传染病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期290-293,共4页
目的:建立一种多重 PCR 方法用于莫西沙星耐药的艰难梭菌鉴定和初步基因分型。方法根据艰难梭菌 slpA 可变区间核苷酸序列的差异设计5种 slpA 基因型(gr、hr、fr、gc08和078)的特异性 PCR 引物,同时加入检测艰难梭菌管家基因磷酸甘...
目的:建立一种多重 PCR 方法用于莫西沙星耐药的艰难梭菌鉴定和初步基因分型。方法根据艰难梭菌 slpA 可变区间核苷酸序列的差异设计5种 slpA 基因型(gr、hr、fr、gc08和078)的特异性 PCR 引物,同时加入检测艰难梭菌管家基因磷酸甘油醛异构酶基因 tpi 的种特异性引物,构建多重PCR 方法;利用9种肠道常见的正常或致病菌验证多重 PCR 方法的特异性,利用46株分属于11个slpA 基因型的艰难梭菌参考菌株来验证方法的检测和分型能力;利用建立的多重 PCR 方法检测39株莫西沙星耐药的临床菌株,以 slpA 测序分型法为参照方法,评估该方法的临床实用性。结果多重PCR 检测9种肠道常见的正常或致病菌 tpi 和5种 slpA 基因型均为阴性;46株艰难梭菌参考菌株 tpi均为阳性,36株分属于5种靶 slpA 基因型(gr、hr、fr、gc08和078)的菌株被正确分型,10株分属于其他6种基因型的参考菌株均无法分型。39株莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株 tpi 均为阳性,32株检出具体基因型,其中22株为 slpA 基因型 gc08,6株为 hr,2株为 fr,2株为078,与 slpA 测序分型结果一致;7株多重 PCR 无法分型,slpA 测序分型结果显示其基因型均不包含在多重 PCR 分型范围内。结论成功建立一种简单、快捷、临床实验室适用的艰难梭菌检测,且能够分辨出5种 slpA 基因型的多重PCR 方法;莫西沙星耐药的艰难梭菌主要为 slpA 基因型 gc08。
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关键词
梭菌
难辨
表面膜蛋白A
基因分型
多重聚合酶链反应
原文传递
题名
艰难梭菌数字化聚合酶链反应-核糖体分型方法及参考图谱的建立
被引量:
3
1
作者
肖克林
王中兴
周天祥
麦光兴
王秦宁
孔繁荣
机构
深圳市宝安区妇幼保健院
中心
实验室
深圳市宝安区妇幼保健院检验科
悉尼大学westmead医院感染性疾病和微生物中心
出处
《中华传染病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期111-114,共4页
基金
广东省科技计划项目公益研究与能力建设专项资金(2014A020212703)
广东省医学科研基金(A2015142)
文摘
目的建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体分型方法及常见基因型的参考图谱。方法利用荧光毛细管电泳技术代替琼脂糖凝胶电泳检测艰难梭菌PCR-核糖体分型产物,建立数字化PCR-核糖体分型方法;利用40株分属于10种核糖体型(RT)的艰难梭菌参考菌株构建常见基因型的数字化参考图谱。结果荧光毛细管电泳技术准确地检测出40株艰难梭菌参考菌株的PCR-核糖体分型片段,并以数字化的形式呈现,10种核糖体型艰难梭菌的PCR-核糖体分型数字化图谱差异明显。同为RT027的21株菌株间、RT002的3株菌株间和RT015的2株菌株间的数字化分型结果相似性都非常高,而7株RT001菌株则可分为4种亚型,2株RT014分为2种亚型。结论成功建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体分型方法,同时构建了艰难梭菌10种核糖体型的数字化PCR-核糖体分型参考数据库。
关键词
梭菌
难辨
PCR-核糖体分型
荧光毛细管电泳
数字化
数据库
Keywords
Clostridium difficile
PCR-ribotyping
Fluorescence capillary gel electrophoresis
Digital
Database
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
滚环扩增技术检测耐氟康唑白念珠菌TAC1点突变
被引量:
2
2
作者
王惠平
孔繁荣
王斌
刘全忠
机构
天津医科
大学
总
医院
皮肤
性
病科
澳大利亚
悉尼大学westmead医院感染性疾病和微生物中心
澳大利亚
悉尼大学
逆转录病毒基因研究实验室、病毒研究
中心
、
westmead
千年研究所
出处
《中华皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第8期529-533,共5页
文摘
目的 利用滚环扩增技术检测耐氟康唑白念珠菌的TAC1点突变,建立一种准确、快速、特异的检测核酸单点突变的方法,同时进一步了解TAC1点突变与耐药的关系.方法 收集33株耐氟康唑白念珠菌(8株来自美国,25株来自澳大利亚),根据文献报道的与耐药有关的点突变和挂锁探针设计原则设计4个挂锁探针.提取DNA、PCR扩增获得TAC1的三个目的 片段;然后用滚环扩增技术检测耐药株的点突变.将滚环扩增所得结果与测序结果进行比较.结果 33株耐氟康唑白念珠菌中,有5株TAC1出现与耐药相关的点突变,分别为T225A(1株)和A736V(4株),其中4株菌来自美国.4株氟康唑敏感白念珠菌中TAC1未见与耐药相关的点突变.结论 滚环扩增技术能准确、快速检测核酸单点突变;TAC1点突变与耐药的关系有待进一步研究.
关键词
念珠菌
白色
氟康唑
抗药性
真菌
点突变
滚环扩增技术
Keywords
Candida albicans
Fluconazole
Drug resistance, fungal
Point mutation
Rolling circle amplification
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
莫西沙星耐药的艰难梭菌多重聚合酶链反应检测和基因分型
被引量:
1
3
作者
黄丽清
肖克林
周天祥
王中兴
孔繁荣
机构
深圳市宝安区妇幼保健院检验科
深圳市宝安区妇幼保健院
中心
实验室
悉尼大学westmead医院感染性疾病和微生物中心
出处
《中华传染病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期290-293,共4页
基金
宝安区科技计划项目
文摘
目的:建立一种多重 PCR 方法用于莫西沙星耐药的艰难梭菌鉴定和初步基因分型。方法根据艰难梭菌 slpA 可变区间核苷酸序列的差异设计5种 slpA 基因型(gr、hr、fr、gc08和078)的特异性 PCR 引物,同时加入检测艰难梭菌管家基因磷酸甘油醛异构酶基因 tpi 的种特异性引物,构建多重PCR 方法;利用9种肠道常见的正常或致病菌验证多重 PCR 方法的特异性,利用46株分属于11个slpA 基因型的艰难梭菌参考菌株来验证方法的检测和分型能力;利用建立的多重 PCR 方法检测39株莫西沙星耐药的临床菌株,以 slpA 测序分型法为参照方法,评估该方法的临床实用性。结果多重PCR 检测9种肠道常见的正常或致病菌 tpi 和5种 slpA 基因型均为阴性;46株艰难梭菌参考菌株 tpi均为阳性,36株分属于5种靶 slpA 基因型(gr、hr、fr、gc08和078)的菌株被正确分型,10株分属于其他6种基因型的参考菌株均无法分型。39株莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株 tpi 均为阳性,32株检出具体基因型,其中22株为 slpA 基因型 gc08,6株为 hr,2株为 fr,2株为078,与 slpA 测序分型结果一致;7株多重 PCR 无法分型,slpA 测序分型结果显示其基因型均不包含在多重 PCR 分型范围内。结论成功建立一种简单、快捷、临床实验室适用的艰难梭菌检测,且能够分辨出5种 slpA 基因型的多重PCR 方法;莫西沙星耐药的艰难梭菌主要为 slpA 基因型 gc08。
关键词
梭菌
难辨
表面膜蛋白A
基因分型
多重聚合酶链反应
Keywords
Clostridium difficile
Surface layer protein A
Genotyping
Multiplex polymerase chain reaction
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
艰难梭菌数字化聚合酶链反应-核糖体分型方法及参考图谱的建立
肖克林
王中兴
周天祥
麦光兴
王秦宁
孔繁荣
《中华传染病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
原文传递
2
滚环扩增技术检测耐氟康唑白念珠菌TAC1点突变
王惠平
孔繁荣
王斌
刘全忠
《中华皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010
2
原文传递
3
莫西沙星耐药的艰难梭菌多重聚合酶链反应检测和基因分型
黄丽清
肖克林
周天祥
王中兴
孔繁荣
《中华传染病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
原文传递
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