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柴胡-白芍药对治疗肝纤维化作用机制网络药理学研究
被引量:
3
1
作者
阎思宁
李奇洪
+5 位作者
卢朝睿
郭峻峰
李紫钰
赵泽玮
王佳艺
王宝家
《河北中医》
2022年第2期309-317,共9页
目的基于网络药理学及分子对接技术探讨柴胡-白芍药对配伍治疗肝纤维化的作用机制。方法应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索柴胡和白芍的活性成分及其作用的靶点,应用OMIM及GeneCard数据库检索肝纤维化疾病相关靶点,...
目的基于网络药理学及分子对接技术探讨柴胡-白芍药对配伍治疗肝纤维化的作用机制。方法应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索柴胡和白芍的活性成分及其作用的靶点,应用OMIM及GeneCard数据库检索肝纤维化疾病相关靶点,通过Draw Venn Diagram平台获得交集靶点,利用Cytoscape 3.7.2软件构建“药对-活性成分-关键靶点-肝纤维化”网络图,使用String数据库对关键靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)分析,将计算结果导入Cytoscape 3.7.2软件进行网络构建,并应用Metascape数据库对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析与京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,最后用AutoDockTools 1.5.6软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接。结果筛选出柴胡-白芍配伍活性成分20种、靶点187个,肝纤维化疾病相关靶点1081个,两者交集靶点共92个,关键活性成分3个,关键靶点18个,靶点蛋白之间具有直接或间接的相互作用关系。GO功能富集分析发现,靶点所在的细胞组成主要为囊腔,生物过程主要富集在脂多糖反应和无机物反应,分子功能主要为调节细胞因子受体结合及DNA结合转录因子。KEGG通路富集分析发现,癌症通路为核心通路,糖尿病并发症中的晚期糖基化产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)为又一重要通路。分子对接结果显示,关键活性成分与核心靶点的结合能均<-4.25 kcal/mol,且其中的大部分结合能<-5.0 kcal/mol,表明这些关键活性成分与核心靶点之间可以形成稳定结构。结论柴胡-白芍药对治疗肝纤维化的作用机制涉及多种复杂的生物学过程,主要作用靶点集中在囊腔由脂多糖反应终末产物介导的癌症通路中。
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关键词
柴胡
白芍
肝纤维化
药理学
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职称材料
题名
柴胡-白芍药对治疗肝纤维化作用机制网络药理学研究
被引量:
3
1
作者
阎思宁
李奇洪
卢朝睿
郭峻峰
李紫钰
赵泽玮
王佳艺
王宝家
机构
成都中医药大学
成都中医药大学基础医学院温病教研室
出处
《河北中医》
2022年第2期309-317,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(编号:81904080)
成都中医药大学“杏林学者”学科人才科研提升计划(编号:BSH2018004)。
文摘
目的基于网络药理学及分子对接技术探讨柴胡-白芍药对配伍治疗肝纤维化的作用机制。方法应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索柴胡和白芍的活性成分及其作用的靶点,应用OMIM及GeneCard数据库检索肝纤维化疾病相关靶点,通过Draw Venn Diagram平台获得交集靶点,利用Cytoscape 3.7.2软件构建“药对-活性成分-关键靶点-肝纤维化”网络图,使用String数据库对关键靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)分析,将计算结果导入Cytoscape 3.7.2软件进行网络构建,并应用Metascape数据库对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析与京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,最后用AutoDockTools 1.5.6软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接。结果筛选出柴胡-白芍配伍活性成分20种、靶点187个,肝纤维化疾病相关靶点1081个,两者交集靶点共92个,关键活性成分3个,关键靶点18个,靶点蛋白之间具有直接或间接的相互作用关系。GO功能富集分析发现,靶点所在的细胞组成主要为囊腔,生物过程主要富集在脂多糖反应和无机物反应,分子功能主要为调节细胞因子受体结合及DNA结合转录因子。KEGG通路富集分析发现,癌症通路为核心通路,糖尿病并发症中的晚期糖基化产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)为又一重要通路。分子对接结果显示,关键活性成分与核心靶点的结合能均<-4.25 kcal/mol,且其中的大部分结合能<-5.0 kcal/mol,表明这些关键活性成分与核心靶点之间可以形成稳定结构。结论柴胡-白芍药对治疗肝纤维化的作用机制涉及多种复杂的生物学过程,主要作用靶点集中在囊腔由脂多糖反应终末产物介导的癌症通路中。
关键词
柴胡
白芍
肝纤维化
药理学
Keywords
Chaihu
Baishao
Liver fibrosis
Pharmacology
分类号
R285.6 [医药卫生—中药学]
R575.2 [医药卫生—消化系统]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
柴胡-白芍药对治疗肝纤维化作用机制网络药理学研究
阎思宁
李奇洪
卢朝睿
郭峻峰
李紫钰
赵泽玮
王佳艺
王宝家
《河北中医》
2022
3
下载PDF
职称材料
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参考文献
引证文献
统计分析
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