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GeXP系统在恶性疟耐青蒿素基因K13SNP检测中的应用
1
作者
石莹
樊学军
+1 位作者
田绿波
龙娟
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2020年第3期249-252,258,共5页
目的探讨GeXP系统在恶性疟耐青蒿素基因K13SNP检测中的应用价值。方法根据4种SNP的序列特征制备标准品质粒。收集2016-2018年出入境人群中检出的28例临床标本,利用GenBank下载4种SNP的核苷酸序列,利用GeXPexpressProfiler设计特异性引物...
目的探讨GeXP系统在恶性疟耐青蒿素基因K13SNP检测中的应用价值。方法根据4种SNP的序列特征制备标准品质粒。收集2016-2018年出入境人群中检出的28例临床标本,利用GenBank下载4种SNP的核苷酸序列,利用GeXPexpressProfiler设计特异性引物,优化条件采用GeXP系统结合多重PCR检测对应SNP及28份临床标本。结果优化的引物能特异性检测4种K13SNP位点,无交叉反应,灵敏度为100%,特异性为99.81%,检测效能为99.15%,检出限为5×103copies/μl,应用于临床标本检测,结果与测序法的一致性为99.32%。结论GeXP方法检测恶性疟耐青蒿素基因4种K13SNP位点快速、准确可用于输入性恶性疟的检测。
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关键词
恶性疟
耐青蒿素
K13
GeXP
多重PCR
原文传递
题名
GeXP系统在恶性疟耐青蒿素基因K13SNP检测中的应用
1
作者
石莹
樊学军
田绿波
龙娟
机构
成都海关四川国际旅行卫生保健中心
四川
省人民医院检验科
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2020年第3期249-252,258,共5页
基金
四川省科技项目(No.2017RZ0053,No.2018jy0339)。
文摘
目的探讨GeXP系统在恶性疟耐青蒿素基因K13SNP检测中的应用价值。方法根据4种SNP的序列特征制备标准品质粒。收集2016-2018年出入境人群中检出的28例临床标本,利用GenBank下载4种SNP的核苷酸序列,利用GeXPexpressProfiler设计特异性引物,优化条件采用GeXP系统结合多重PCR检测对应SNP及28份临床标本。结果优化的引物能特异性检测4种K13SNP位点,无交叉反应,灵敏度为100%,特异性为99.81%,检测效能为99.15%,检出限为5×103copies/μl,应用于临床标本检测,结果与测序法的一致性为99.32%。结论GeXP方法检测恶性疟耐青蒿素基因4种K13SNP位点快速、准确可用于输入性恶性疟的检测。
关键词
恶性疟
耐青蒿素
K13
GeXP
多重PCR
Keywords
Plasmodium falciparum
resistance to artemisinin
GeXP
multiplex-PCR
分类号
R382.31 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
GeXP系统在恶性疟耐青蒿素基因K13SNP检测中的应用
石莹
樊学军
田绿波
龙娟
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2020
0
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