如皋黄鸡遗传多样性研究

如皋黄鸡是江苏省地方优良鸡种质资源。为阐明如皋黄鸡的遗传多样性和母系起源,采用PCR和测序技术研究了如皋黄鸡群体的线粒体DNA(mitochondria DNA,mtDNA)控制区(displacement loop D-loop)序列,并和GenBank数据库中的红原鸡序列构建系统发育树。如黄鸡线粒体D-loop区序列全长为1231~1232bp,碱基组成为16.4%G、29.3%C、22.8%A和31.5%T;检测到的变异位点数为31个,其中简约性信息位点为24个,单一变异位点为7个。如皋黄鸡群体共发现的23种单倍型,可以分为A~C、E和G等5个母系单倍群,单倍型分布分别为8、6、5、2和2。序列平均核菩酸差异为7.088,单倍型多样度为0.909±0.023,核苷酸多样度为0.00820±0.00131。从线粒体水平来看,如皋黄鸡群体母系来源呈多样性,遗传多样性的水平较高,可开发利用的潜力较大。本研究将为如皋黄鸡种质资源的的进一步评价研究、保存和利用提供参考。