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基于机器学习模型探索节点综合拓扑属性在精神分裂症研究中的应用价值
1
作者
刘洋洋
张帅奇
+2 位作者
刘佩
丁宁宁
张海三
《中华神经医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期705-710,共6页
目的基于机器学习模型探索节点综合拓扑属性(NITA)在精神分裂症研究中的应用价值。方法选择新乡医学院第二附属医院精神科自2022年1月至2023年8月收治的56例首发精神分裂症患者(患者组)及向社会招募的56例健康志愿者(对照组)为研究对象...
目的基于机器学习模型探索节点综合拓扑属性(NITA)在精神分裂症研究中的应用价值。方法选择新乡医学院第二附属医院精神科自2022年1月至2023年8月收治的56例首发精神分裂症患者(患者组)及向社会招募的56例健康志愿者(对照组)为研究对象,采集其功能MRI数据,对数据进行预处理后构建大脑网络,并基于图论的方法提取全局和节点拓扑属性指标作为训练特征。将受试者分为训练组(46∶46)和测试组(10∶10),在训练组中分别使用两种特征训练随机森林(RFC)、支持向量机(SVM)和梯度提升树(XGboost)模型,计算出各模型的准确率、召回率、F1值及受试者工作特征曲线下面积(AUC)以进行性能评估,并结合测试组表现分析各模型的泛化能力,筛选出表现优秀的拓扑属性指标。将所选拓扑属性指标通过主成分分析算法降至一维,并用该新维度特征再次分别训练上述模型,根据训练组和测试组的表现筛选出适配模型。对患者组与对照组各脑区新维度特征进行统计学分析并结合错误发现率(FDR)校正,筛选出差异有统计学意义的脑区新维度特征,并再次用其训练适配模型。结果训练组中各机器学习模型使用节点拓扑属性指标的分类模型的准确率、召回率、F1值、AUC均高于使用全局拓扑属性指标的分类模型,测试组中SVM模型使用节点拓扑属性指标的分类模型表现出稳定的泛化性(准确率为75.00%,召回率为100.00%,F1分数为0.80,AUC为0.92)。将节点拓扑属性指标降维并命名新维度特征为NITA。依据SVM模型使用NITA的分类模型在训练组中的验证结果(准确率为77.00%、召回率为72.00%、F1值为0.76、AUC为0.86)及测试组中的泛化表现(准确率为66.67%、召回率为83.33%、F1值为0.71、AUC为0.61),选择SVM作为分类NITA的适配模型。患者组与对照组间右侧额中回腹外侧区、左侧额下回背侧区、右侧中央前回尾腹侧区、左侧颞上回喙部、右侧梭状回中央区、右侧顶下小叶前背侧区及左侧枕极皮层NITA的差异有统计学意义(P<0.05,FDR校正)。将上述脑区NITA作为特征训练得出最优模型FDR-NITA-SVM,其在训练组中准确率为93.74%、召回率为98.00%、F1值为0.94、AUC为0.96,测试组中准确率为83.33%、召回率为66.67%、F1值为0.80、AUC为0.92。结论NITA可能是诊断精神分裂症的潜在影像标志物。NITA异常脑区是精神分裂症患者大脑网络间信息交流和整合的关键节点。
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关键词
精神分裂症
机器学习模型
数据降维
节点综合拓扑属性
原文传递
题名
基于机器学习模型探索节点综合拓扑属性在精神分裂症研究中的应用价值
1
作者
刘洋洋
张帅奇
刘佩
丁宁宁
张海三
机构
新乡
医学院
医学
工程
学院
新乡
医学院
第二
附属
医院
(
河南省
精神病医院
)
新乡市
多模态
脑
影像
重点
实验室
出处
《中华神经医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期705-710,共6页
基金
国家卫健委学研基金-河南省医学科技攻关计划省部共建项目(SBGJ202302096)
河南省科技攻关计划项目(222102310462、232102310032)。
文摘
目的基于机器学习模型探索节点综合拓扑属性(NITA)在精神分裂症研究中的应用价值。方法选择新乡医学院第二附属医院精神科自2022年1月至2023年8月收治的56例首发精神分裂症患者(患者组)及向社会招募的56例健康志愿者(对照组)为研究对象,采集其功能MRI数据,对数据进行预处理后构建大脑网络,并基于图论的方法提取全局和节点拓扑属性指标作为训练特征。将受试者分为训练组(46∶46)和测试组(10∶10),在训练组中分别使用两种特征训练随机森林(RFC)、支持向量机(SVM)和梯度提升树(XGboost)模型,计算出各模型的准确率、召回率、F1值及受试者工作特征曲线下面积(AUC)以进行性能评估,并结合测试组表现分析各模型的泛化能力,筛选出表现优秀的拓扑属性指标。将所选拓扑属性指标通过主成分分析算法降至一维,并用该新维度特征再次分别训练上述模型,根据训练组和测试组的表现筛选出适配模型。对患者组与对照组各脑区新维度特征进行统计学分析并结合错误发现率(FDR)校正,筛选出差异有统计学意义的脑区新维度特征,并再次用其训练适配模型。结果训练组中各机器学习模型使用节点拓扑属性指标的分类模型的准确率、召回率、F1值、AUC均高于使用全局拓扑属性指标的分类模型,测试组中SVM模型使用节点拓扑属性指标的分类模型表现出稳定的泛化性(准确率为75.00%,召回率为100.00%,F1分数为0.80,AUC为0.92)。将节点拓扑属性指标降维并命名新维度特征为NITA。依据SVM模型使用NITA的分类模型在训练组中的验证结果(准确率为77.00%、召回率为72.00%、F1值为0.76、AUC为0.86)及测试组中的泛化表现(准确率为66.67%、召回率为83.33%、F1值为0.71、AUC为0.61),选择SVM作为分类NITA的适配模型。患者组与对照组间右侧额中回腹外侧区、左侧额下回背侧区、右侧中央前回尾腹侧区、左侧颞上回喙部、右侧梭状回中央区、右侧顶下小叶前背侧区及左侧枕极皮层NITA的差异有统计学意义(P<0.05,FDR校正)。将上述脑区NITA作为特征训练得出最优模型FDR-NITA-SVM,其在训练组中准确率为93.74%、召回率为98.00%、F1值为0.94、AUC为0.96,测试组中准确率为83.33%、召回率为66.67%、F1值为0.80、AUC为0.92。结论NITA可能是诊断精神分裂症的潜在影像标志物。NITA异常脑区是精神分裂症患者大脑网络间信息交流和整合的关键节点。
关键词
精神分裂症
机器学习模型
数据降维
节点综合拓扑属性
Keywords
Schizophrenia
Machine learning model
Data dimensional reduction
Nodal integrated topological attribute
分类号
TP181 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
R749.3 [医药卫生—神经病学与精神病学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于机器学习模型探索节点综合拓扑属性在精神分裂症研究中的应用价值
刘洋洋
张帅奇
刘佩
丁宁宁
张海三
《中华神经医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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