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基于宏基因组数据的菌株分析方法及其应用
被引量:
4
1
作者
谭宇翔
胡函
+3 位作者
李陈浩
罗小舟
谭验
戴磊
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期2610-2621,共12页
菌株是微生物研究中最基础的生命实体,其功能多样性对宿主表型有着重要影响。随着微生物组研究的深入,对复杂微生物群落进行菌株水平的构成分析和功能分析,在基础科研、临床应用等方面都有重要的价值。文中介绍了基于宏基因组数据的菌...
菌株是微生物研究中最基础的生命实体,其功能多样性对宿主表型有着重要影响。随着微生物组研究的深入,对复杂微生物群落进行菌株水平的构成分析和功能分析,在基础科研、临床应用等方面都有重要的价值。文中介绍了基于宏基因组数据的菌株分析的主流算法,以及菌株分析在微生物组研究中的潜在应用和未来的发展方向。
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关键词
菌株
宏基因组
单核苷酸多态性
基因多样性
参考基因组
原文传递
题名
基于宏基因组数据的菌株分析方法及其应用
被引量:
4
1
作者
谭宇翔
胡函
李陈浩
罗小舟
谭验
戴磊
机构
中国科学院深圳先进技术
研究院
深圳合成生物学创新
研究院
中国科学院定量工程生物学重点实验室
深圳未知君生物科技有限公司
新加坡基因组研究院
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期2610-2621,共12页
基金
国家重点研发计划(No.2019YFA09006700)
国家自然科学基金(No.31971513)资助。
文摘
菌株是微生物研究中最基础的生命实体,其功能多样性对宿主表型有着重要影响。随着微生物组研究的深入,对复杂微生物群落进行菌株水平的构成分析和功能分析,在基础科研、临床应用等方面都有重要的价值。文中介绍了基于宏基因组数据的菌株分析的主流算法,以及菌株分析在微生物组研究中的潜在应用和未来的发展方向。
关键词
菌株
宏基因组
单核苷酸多态性
基因多样性
参考基因组
Keywords
strain
metagenomic
single nucleotide polymorphism
gene diversity
reference genome
分类号
Q938 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于宏基因组数据的菌株分析方法及其应用
谭宇翔
胡函
李陈浩
罗小舟
谭验
戴磊
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
原文传递
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
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