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海岛棉枯萎病抗性与类黄酮代谢途径基因表达量的相关性
被引量:
11
1
作者
黄启秀
曲延英
+2 位作者
姚正培
李梦雨
陈全家
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第12期1791-1801,共11页
枯萎病是危害海岛棉生产的重要因素之一,研究枯萎病抗性分子机制将为培育抗病海岛棉品种、解决枯萎病对海岛棉的危害问题提供坚实的基础。本研究在前期转录组测序的基础上,对海岛棉枯萎病抗性差异表达基因进行分析(Differentially Expre...
枯萎病是危害海岛棉生产的重要因素之一,研究枯萎病抗性分子机制将为培育抗病海岛棉品种、解决枯萎病对海岛棉的危害问题提供坚实的基础。本研究在前期转录组测序的基础上,对海岛棉枯萎病抗性差异表达基因进行分析(Differentially Expressed Gene,DEG);以7个抗病性表现不同的海岛棉品种为材料,利用qRT-PCR方法研究抗病差异表达基因在接种0~40 h的表达量差异,分析基因表达量与病情指数的相关性。结果表明,DEG分析得出类黄酮代谢通路相关基因与海岛棉枯萎病抗性有关。qRT-PCR分析显示抗病材料中类黄酮代谢通路关键基因的表达量显著高于感病材料。在接菌后多个时间点,类黄酮代谢通路中的关键基因TT7、CHI和DFR在抗病材料中的表达量显著或极显著高于感病材料,其中CHI和DFR基因的表达量与病情指数呈显著负相关。综上所述,类黄酮代谢通路相关基因对海岛棉枯萎病抗性均有影响,且CHI、TT7和DFR基因是关键基因。
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关键词
海岛棉
枯萎病
类黄酮
表达分析
转录组测序
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职称材料
陆地棉HRD转录因子基因原核表达与亚细胞定位分析
2
作者
陈琴
曲延英
+3 位作者
倪志勇
韩玉慧
程浩然
陈全家
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2019年第2期121-128,共8页
【目的】AP2/ERF家族基因在植物生长和逆境胁迫中起重要作用,GhHRD转录因子基因是该家族的一员。本试验首次克隆了GhHRD基因,为研究其功能提供理论依据。【方法】选用相对耐旱的新陆中36作为试验材料,通过反转录聚合酶链式反应的方法获...
【目的】AP2/ERF家族基因在植物生长和逆境胁迫中起重要作用,GhHRD转录因子基因是该家族的一员。本试验首次克隆了GhHRD基因,为研究其功能提供理论依据。【方法】选用相对耐旱的新陆中36作为试验材料,通过反转录聚合酶链式反应的方法获得GhHRD基因,并通过生物信息学、原核表达、亚细胞定位和酵母杂交分析预测其结构和功能。【结果】GhHRD基因开放阅读框为555 bp,编码184个氨基酸,相对分子质量为19.539×10~3 Da,等电点为5,具有典型的AP2/ERF保守结构域。原核表达分析发现,pET-28a(+)-GhHRD可以被诱导表达,且在37℃、IPTG浓度1 mmol·L^(-1)条件下高效表达。与GFP融合的重组蛋白GhHRD-GFP定位在细胞核,且具有明显的转录自激活特征。【结论】推测GhHRD可能参与了棉花逆境胁迫应答反应,为进一步探索该转录因子的DNA结合位点和转录调控网络奠定了基础。
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关键词
HRD转录因子
原核表达
亚细胞定位
酵母杂交
下载PDF
职称材料
题名
海岛棉枯萎病抗性与类黄酮代谢途径基因表达量的相关性
被引量:
11
1
作者
黄启秀
曲延英
姚正培
李梦雨
陈全家
机构
新疆农业大学农学院/新疆农业大学农业技术重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第12期1791-1801,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31560409)资助~~
文摘
枯萎病是危害海岛棉生产的重要因素之一,研究枯萎病抗性分子机制将为培育抗病海岛棉品种、解决枯萎病对海岛棉的危害问题提供坚实的基础。本研究在前期转录组测序的基础上,对海岛棉枯萎病抗性差异表达基因进行分析(Differentially Expressed Gene,DEG);以7个抗病性表现不同的海岛棉品种为材料,利用qRT-PCR方法研究抗病差异表达基因在接种0~40 h的表达量差异,分析基因表达量与病情指数的相关性。结果表明,DEG分析得出类黄酮代谢通路相关基因与海岛棉枯萎病抗性有关。qRT-PCR分析显示抗病材料中类黄酮代谢通路关键基因的表达量显著高于感病材料。在接菌后多个时间点,类黄酮代谢通路中的关键基因TT7、CHI和DFR在抗病材料中的表达量显著或极显著高于感病材料,其中CHI和DFR基因的表达量与病情指数呈显著负相关。综上所述,类黄酮代谢通路相关基因对海岛棉枯萎病抗性均有影响,且CHI、TT7和DFR基因是关键基因。
关键词
海岛棉
枯萎病
类黄酮
表达分析
转录组测序
Keywords
Gossypium barbadense
Fusarium wilt
Flavonoids
Expression analysis
RNA-seq
分类号
S435.62 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
下载PDF
职称材料
题名
陆地棉HRD转录因子基因原核表达与亚细胞定位分析
2
作者
陈琴
曲延英
倪志勇
韩玉慧
程浩然
陈全家
机构
新疆农业大学农学院/新疆农业大学农业技术重点实验室
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2019年第2期121-128,共8页
基金
国家科技重大专项--转基因生物新品种培育(201XZX08005-004)
文摘
【目的】AP2/ERF家族基因在植物生长和逆境胁迫中起重要作用,GhHRD转录因子基因是该家族的一员。本试验首次克隆了GhHRD基因,为研究其功能提供理论依据。【方法】选用相对耐旱的新陆中36作为试验材料,通过反转录聚合酶链式反应的方法获得GhHRD基因,并通过生物信息学、原核表达、亚细胞定位和酵母杂交分析预测其结构和功能。【结果】GhHRD基因开放阅读框为555 bp,编码184个氨基酸,相对分子质量为19.539×10~3 Da,等电点为5,具有典型的AP2/ERF保守结构域。原核表达分析发现,pET-28a(+)-GhHRD可以被诱导表达,且在37℃、IPTG浓度1 mmol·L^(-1)条件下高效表达。与GFP融合的重组蛋白GhHRD-GFP定位在细胞核,且具有明显的转录自激活特征。【结论】推测GhHRD可能参与了棉花逆境胁迫应答反应,为进一步探索该转录因子的DNA结合位点和转录调控网络奠定了基础。
关键词
HRD转录因子
原核表达
亚细胞定位
酵母杂交
Keywords
HRD transcriptor factor
prokaryotic expression
subcellular localization
yeast hybridization
分类号
S562 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海岛棉枯萎病抗性与类黄酮代谢途径基因表达量的相关性
黄启秀
曲延英
姚正培
李梦雨
陈全家
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
11
下载PDF
职称材料
2
陆地棉HRD转录因子基因原核表达与亚细胞定位分析
陈琴
曲延英
倪志勇
韩玉慧
程浩然
陈全家
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2019
0
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职称材料
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