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李属坏死环斑病毒(PNRSV)新疆巴旦木分离物外壳蛋白基因(CP)片断的克隆与序列分析
被引量:
3
1
作者
殷智婷
韩剑
+3 位作者
周国辉
张祥林
罗明
潘亚南
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期740-746,共7页
【目的】为了查明新疆巴旦木果树病原病毒的种类,为病毒的分子检测提供基础。【方法】采用双抗体夹心酶联免疫吸附法(DAS-ELISA),从巴旦木果树叶片中检测到李属坏死环斑病毒(PNRSV)。以阳性样品的总RNA为模板进行PNRSV外壳蛋白基因(CP)R...
【目的】为了查明新疆巴旦木果树病原病毒的种类,为病毒的分子检测提供基础。【方法】采用双抗体夹心酶联免疫吸附法(DAS-ELISA),从巴旦木果树叶片中检测到李属坏死环斑病毒(PNRSV)。以阳性样品的总RNA为模板进行PNRSV外壳蛋白基因(CP)RT-PCR扩增,对预期430 bp大小的4个扩增产物进行克隆、测序和序列分析。【结果】结果表明,PNRSV新疆巴旦木分离物CP基因的核苷酸和氨基酸序列与世界各地已报道的分离物具有较高的同源性,分别为80.0%~97.2%和80.1%~94.1%,其中与阿根廷分离物AY217的同源性最高;而与同属03亚组的苹果花叶病毒(ApMV)同源性较低,仅为52.9%~55.4%和45.6%~48.6%。新疆PNRSV各分离物之间CP基因高度同源。序列比对与系统发生树的分析显示,PNRSV新疆巴旦木分离物的株系属于GroupⅠ组。【结论】确定了PNRSV为侵染新疆巴旦木果树的病原病毒。这是PNRSV在新疆发现的首次报道。
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关键词
巴旦木
李属坏死环斑病毒(PNRSV)
双抗体夹心酶联免疫吸附法(DAS—ELISA)
RT—PCR
CP基因
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职称材料
李属坏死环斑病毒(PNRSV)RT-LAMP检测方法的建立
被引量:
4
2
作者
韩剑
罗明
+2 位作者
殷智婷
周国辉
张祥林
《新疆农业大学学报》
CAS
2014年第4期327-332,共6页
针对李属坏死环斑病毒(PNRSV)外壳蛋白(CP)基因保守序列,设计了1套特异性识别CP基因中6个不同区段的环介导等温扩增(LAMP)引物。通过对反应条件的优化,建立了适用于PNRSV的RT-LAMP检测技术,对优化后的方法进行特异性、灵敏度评价。结果...
针对李属坏死环斑病毒(PNRSV)外壳蛋白(CP)基因保守序列,设计了1套特异性识别CP基因中6个不同区段的环介导等温扩增(LAMP)引物。通过对反应条件的优化,建立了适用于PNRSV的RT-LAMP检测技术,对优化后的方法进行特异性、灵敏度评价。结果显示,此方法能够特异性的检测出PNRSV,对马铃薯X病毒(PVX)、马铃薯Y病毒(PVY)、黄瓜花叶病毒(CMV)、蚕豆萎蔫病毒(BBWV)的检测均为阴性,灵敏度高于RT-PCR 10倍。
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关键词
李属坏死环斑病毒(PNRSV)
反转录环介导等温扩增(RT-LAMP)
CP基因
检测
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职称材料
题名
李属坏死环斑病毒(PNRSV)新疆巴旦木分离物外壳蛋白基因(CP)片断的克隆与序列分析
被引量:
3
1
作者
殷智婷
韩剑
周国辉
张祥林
罗明
潘亚南
机构
新疆
农业大学农学院
华南农业大学资源与环境学院
新疆出入境检疫检验局
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期740-746,共7页
基金
新疆自治区自然科学基金(2012211B25)
新疆自治区科技支疆项目(200991238)
文摘
【目的】为了查明新疆巴旦木果树病原病毒的种类,为病毒的分子检测提供基础。【方法】采用双抗体夹心酶联免疫吸附法(DAS-ELISA),从巴旦木果树叶片中检测到李属坏死环斑病毒(PNRSV)。以阳性样品的总RNA为模板进行PNRSV外壳蛋白基因(CP)RT-PCR扩增,对预期430 bp大小的4个扩增产物进行克隆、测序和序列分析。【结果】结果表明,PNRSV新疆巴旦木分离物CP基因的核苷酸和氨基酸序列与世界各地已报道的分离物具有较高的同源性,分别为80.0%~97.2%和80.1%~94.1%,其中与阿根廷分离物AY217的同源性最高;而与同属03亚组的苹果花叶病毒(ApMV)同源性较低,仅为52.9%~55.4%和45.6%~48.6%。新疆PNRSV各分离物之间CP基因高度同源。序列比对与系统发生树的分析显示,PNRSV新疆巴旦木分离物的株系属于GroupⅠ组。【结论】确定了PNRSV为侵染新疆巴旦木果树的病原病毒。这是PNRSV在新疆发现的首次报道。
关键词
巴旦木
李属坏死环斑病毒(PNRSV)
双抗体夹心酶联免疫吸附法(DAS—ELISA)
RT—PCR
CP基因
Keywords
Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV)
Almond
Double-Antibody Sandwich Enzyme-Linked Immunosorbent Assays (DAS-ELISA)
RT-PCR
CP gene
分类号
S662.9 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
李属坏死环斑病毒(PNRSV)RT-LAMP检测方法的建立
被引量:
4
2
作者
韩剑
罗明
殷智婷
周国辉
张祥林
机构
新疆
农业大学农学院
华南农业大学资源与环境学院
新疆出入境检疫检验局
出处
《新疆农业大学学报》
CAS
2014年第4期327-332,共6页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2012211B25)
文摘
针对李属坏死环斑病毒(PNRSV)外壳蛋白(CP)基因保守序列,设计了1套特异性识别CP基因中6个不同区段的环介导等温扩增(LAMP)引物。通过对反应条件的优化,建立了适用于PNRSV的RT-LAMP检测技术,对优化后的方法进行特异性、灵敏度评价。结果显示,此方法能够特异性的检测出PNRSV,对马铃薯X病毒(PVX)、马铃薯Y病毒(PVY)、黄瓜花叶病毒(CMV)、蚕豆萎蔫病毒(BBWV)的检测均为阴性,灵敏度高于RT-PCR 10倍。
关键词
李属坏死环斑病毒(PNRSV)
反转录环介导等温扩增(RT-LAMP)
CP基因
检测
Keywords
prunus necrotic ringspot virus(PNRSV)
reverse transcription loop-mediated isothermal amplification(RT-LAMP)
coat protein gene(CP)
detection
分类号
S436.629 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
李属坏死环斑病毒(PNRSV)新疆巴旦木分离物外壳蛋白基因(CP)片断的克隆与序列分析
殷智婷
韩剑
周国辉
张祥林
罗明
潘亚南
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
下载PDF
职称材料
2
李属坏死环斑病毒(PNRSV)RT-LAMP检测方法的建立
韩剑
罗明
殷智婷
周国辉
张祥林
《新疆农业大学学报》
CAS
2014
4
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职称材料
已选择
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引证文献
统计分析
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