新疆细粒棘球绦虫EgAgB8/3蛋白的生物信息学分析及意义

目的分析新疆细粒棘球蚴EgAgB8/3蛋白氨基酸序列,了解该蛋白特性,预测其抗原表位,为进一步研究和选择包虫病免疫学诊断与防治的最佳候选抗原提供理论依据。方法利用生物信息学方法推测EgAgB8/3蛋白氨基酸序列及理化性质,用不同的生物信息学软件分析EgAgB8/3蛋白的特性及二级结构,并结合多参数预测其抗原表位。结果 EgAgB8/3抗原是由75个氨基酸残基组成的多肽,相对分子质量为8.58×10~3,等电点为8.5;蛋白特性分析显示EgAgB8/3蛋白α螺旋、β折叠、β转角和无规卷曲等二级结构特点,有3个β转角较好区域可作为表位所在参考区段;3种软件多参数综合分析预测,EgAgB8/3蛋白抗原表位集中在1~7(FVVVAHA)、6~19(HADDDDDEVTKTKK)、32~38(FQSDPLG)区段。结论运用生物信息学分析方法预测到EgAgB8/3抗原3个B细胞的优势表位,对进一步研究EgAgB8/3抗原性和研发更有价值的包虫病免疫诊断与防治靶标具有重要意义。

细粒棘球蚴AgB1、AgB2、AgB4抗原表位的特性分析

目的分析新疆细粒棘球蚴AgB1、AgB2、AgB4蛋白的氨基酸序列,了解其蛋白二级结构特点,预测抗原表位,为包虫病的进一步免疫学诊断和研究提供理论支持。方法利用生物信息分析软件DNAstar分析3种抗原的蛋白二级结构特点,运用在线软件IEDB对3种抗原各参数进行综合分析并预测其抗原表位。结果EgAgB1、EgAgB2和EgAgB4分别是由78、90、91个氨基酸残基组成的不同多肽。其蛋白质二级结构中均有α-螺旋、β-折叠、转角区域和卷曲区域。综合分析各参数推测EgAgB1具有2个抗原表位,分别是14～23位氨基酸残基（DDGLTSTSRS）、37～42位氨基酸残基（RDPLGQ）。推测EgAgB2的2个抗原表位分别为41～49位氨基酸残基（DFFRNDPLG）、83～90位氨基酸残基（EEKDDDSk）。EgAgB4可能含有的2个抗原表位分别是43～50位氨基酸残基（RSDPLGQR）、84～89位氨基酸残基（EEEDDS）。结论采用生物信息技术对新疆细粒棘球蚴AgB1、AgB2、AgB4进行B细胞表位特点的研究和分析,对更准确诊断包虫病具有重要意义。