新疆维吾尔族溃疡性结肠炎患者相关的长链非编码RNA差异表达谱及功能研究

目的:利用微阵列芯片和生物信息学技术,分析溃疡性结肠炎(UC)中长链非编码RNA(lncRNA)表达特征。方法:选取医院确诊的3例维吾尔族UC患者,将其纳入观察组,另选3名维吾尔族健康体检者纳入对照组,运用lncRNA芯片检测两组结肠组织中lncRNAs和信使核糖核酸(mRNAs)表达谱,分析两组间差异表达的lncRNAs。运用在线生物信息学软件对差异lncRNAs的生物学功能和lncRNAs预测的靶向mRNAs进行全基因组关联分析。结果:芯片结果预处理分析中,两组的芯片结果在总体基因的表达一致。通过对lncRNA和mRNA的数据进行聚类分析发现,在两组样本中,lncRNA和mRNA的基因表达存在明显的差异。观察组患者病变结肠组织中表达的lnc RNAs筛选差异倍数≥2,共有1242个,其中表达上调579个,下调663个;差异表达的lncRNAs主要在免疫系统进展、炎症通路及B细胞的激活等功能上显著富集;基因座信息预测差异表达的lncRNA靶基因中有8个与UC发病机制相关的lncRNA-mRNA分子调控机制。结论:新疆维吾尔族UC患者与维吾尔族健康者的结肠组织存在差异表达的lncRNAs,且可能参与UC的致病调控过程。

新疆维吾尔族溃疡性结肠炎患者长链非编码RNA LINC00467表达特征与预后分析

目的探讨新疆维吾尔族溃疡性结肠炎(UC)患者长链非编码RNA(LncRNA)LINC00467表达特征与预后关系。方法回顾性分析2017年1月至2019年6月新疆医科大学第四附属医院收治的维吾尔族UC患者30例,其中活动期20例,缓解期10例。另选择2019年1月至2020年6月新疆医科大学第四附属医院维吾尔族健康人30例作为对照组。受试者均于结肠镜检查时,内镜直视下采用统一型号活检钳,取3块肠黏膜组织。采用荧光定量PCR测定LncRNA LINC00467表达。比较不同分期的UC患者LncRNA LINC00467表达;LncRNA LINC00467表达与UC患者临床特征的关系;比较不同预后的UC患者LncRNA LINC00467表达;采用Cox多因素分析影响预后危险因素。结果LncRNA LINC00467表达比较,活动期组(1.56±0.27)和缓解期组(0.89±0.21)高于对照组(0.34±0.08),活动期组(1.56±0.27)高于缓解期组(0.89±0.21),差异有统计学意义(P<0.05)。不同性别、年龄、病程和病变范围LncRNA LINC00467表达比较无统计学差异(P>0.05);LncRNA LINC00467表达比较,中度(1.30±0.25)和重度(1.67±0.24)高于(0.86±0.16)轻度,且重度(1.67±0.24)高于中度(1.30±0.25),差异有统计学意义(P<0.05)。随访末,预后良好21例,预后不良9例。预后不良组LncRNA LINC00467表达(2.42±0.48)高于预后良好组(0.63±0.12),差异有统计学意义(P<0.05)。经Cox多因素分析显示,疾病活动程度和LncRNA LINC00467表达为影响预后危险因素。结论新疆维吾尔族UC患者LncRNA LINC00467呈高表达,且随着病情加重及预后进展表达越高,及LncRNA LINC00467表达为影响危险因素。