基于网络药理学及分子对接方法探讨金铃子散治疗神经病理性疼痛的作用机制

目的运用网络药理学和分子对接的方法研究及探讨中药方剂金铃子散治疗神经病理性疼痛的作用机制。方法通过检索中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP),筛选出川楝子和延胡索的有效活性成分及作用靶点;同时,从GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD及DrugBank数据库收集整理神经病理性疼痛的相关靶点,取两者的交集得到药物-疾病蛋白靶点,筛选出共有靶点导入String分析平台进行PPI网络构建,通过Cycoscape软件将结果进行网络化展示;通过R语言筛选出核心靶点蛋白,再用薛定谔Maestro软件进行分子对接验证;借助R语言,利用基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)数据库对交集靶点分别进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,同时结合相关文献,分析金铃子散治疗神经病理性疼痛的可能机制。结果根据口服生物利用度(OB)与类药性(DL)筛选出金铃子散58个有效活性成分和1919个作用靶点;通过疾病数据库检索到与神经病理性疼痛相关的已知疾病靶点1420个;筛选出55个核心活性成份和30个核心靶点蛋白,分子对接显示槲皮素(Quercetin)、金黄紫堇碱((S)-Scoulerine)和延胡索乙素(Tetrahydropalmatine)可能为关键活性成份;金铃子散主要作用于神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路及晚期糖基化终末产物(AGE)及其受体(RAGE)协同等信号通路。结论金铃子散通过其多成份、多靶点、多通路治疗神经病理性疼痛。

基于网络药理学及分子对接方法探讨山豆根治疗咽喉痛的潜在作用机制

目的:采用网络药理学和分子对接的方法探讨山豆根治疗咽喉痛的作用机制。方法:通过检索中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP),筛选出山豆根的有效活性成分及潜在作用靶标;同时,从GeneCards数据库、OMIM数据库及DrugBank数据库收集咽喉痛的相关靶标,取两者的交集得到药物-疾病蛋白靶标,筛选出共有靶标基因导入String分析平台进行PPI网络构建,通过Cycoscape软件将结果进行网络化展示;通过R语言筛选出核心靶标蛋白,再用薛定谔Maestro软件进行分子对接验证;借助R软件的Bioconductor集合工具包,利用基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)数据库对交集靶标进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,并结合相关文献,分析山豆根治疗咽喉痛的可能机制。结果:从口服生物利用度(OB)与类药性(DL)数值筛选出山豆根21个有效活性成分和172个作用靶标;通过疾病数据库检索到与咽喉痛相关的已知疾病靶标1962个;筛选出12个核心活性成份和30个核心靶标蛋白,分子对接显示山奈酚(Kaempferol)、槲皮素(Quercetin)、异鼠李素(Isorhamnetin)、芒柄花黄素(Formononetin)、槐果碱(Sophocarpine)、槐定碱(Sophoridine)可能为关键活性成份;山豆根主要作用于流体剪切应力和动脉粥样硬化、晚期糖基化终末产物(AGE)及其受体(RAGE)协同的AGE-RAGE、乙型肝炎及卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染等信号通路。结论:从多维网络分析角度看,山豆根治疗咽喉痛可能是通过多种有效成份、多个作用靶点和多种信号通路共同参与达到消肿、利咽、止痛的疗效。