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EPRS1通过影响趋化因子的表达与功能促进肝癌细胞的恶性表型
被引量:
1
1
作者
杨晨
吴向未
《农垦医学》
2022年第1期1-5,共5页
目的:探讨谷氨酰脯氨酰t RNA合成酶在人肝细胞癌中促癌的潜在机制。方法:siRNA抑制Hep3B细胞中EPRS1的表达,RNA-seq检测其与对照组之间的差异基因,TCGA-LIHC数据集中验证,GO和GSEA分析差异基因参与的细胞生物学过程。结果:检测差异基因...
目的:探讨谷氨酰脯氨酰t RNA合成酶在人肝细胞癌中促癌的潜在机制。方法:siRNA抑制Hep3B细胞中EPRS1的表达,RNA-seq检测其与对照组之间的差异基因,TCGA-LIHC数据集中验证,GO和GSEA分析差异基因参与的细胞生物学过程。结果:检测差异基因304个,其中上调基因98个(32.2%),下调基因206个(67.8%),GO分析提示下调基因主要的分子功能是影响CXCLR受体结合和趋化因子活化。GSEA分析提示随着EPRS1的降低细胞因子与其受体的相互作用相关通路受到影响。而在基因表达水平层面发现趋化因子家族中的5种基因表达水平下降,在TCGA-LIHC数据集中分析表明其中CXCL5和CCL20在肝癌样本中高表达(P<0.05),且与EPRS1表达水平呈正相关。结论:EPRS1通过提高多种趋化因子的表达并影响趋化因子与其受体结合过程发挥促癌作用。
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关键词
肝癌
谷氨酰脯氨酰t
RNA合成酶
趋化因子
高通量测序
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职称材料
题名
EPRS1通过影响趋化因子的表达与功能促进肝癌细胞的恶性表型
被引量:
1
1
作者
杨晨
吴向未
机构
国家卫健委中亚
高
发疾病防治
重点
实验室
/石河子大学
医学院
第一附属医院
新疆地方与民族高发病重点实验室/石河子大学医学院
石河子大学
医学院
第一附属医院肝胆外科
出处
《农垦医学》
2022年第1期1-5,共5页
文摘
目的:探讨谷氨酰脯氨酰t RNA合成酶在人肝细胞癌中促癌的潜在机制。方法:siRNA抑制Hep3B细胞中EPRS1的表达,RNA-seq检测其与对照组之间的差异基因,TCGA-LIHC数据集中验证,GO和GSEA分析差异基因参与的细胞生物学过程。结果:检测差异基因304个,其中上调基因98个(32.2%),下调基因206个(67.8%),GO分析提示下调基因主要的分子功能是影响CXCLR受体结合和趋化因子活化。GSEA分析提示随着EPRS1的降低细胞因子与其受体的相互作用相关通路受到影响。而在基因表达水平层面发现趋化因子家族中的5种基因表达水平下降,在TCGA-LIHC数据集中分析表明其中CXCL5和CCL20在肝癌样本中高表达(P<0.05),且与EPRS1表达水平呈正相关。结论:EPRS1通过提高多种趋化因子的表达并影响趋化因子与其受体结合过程发挥促癌作用。
关键词
肝癌
谷氨酰脯氨酰t
RNA合成酶
趋化因子
高通量测序
Keywords
HCC
EPRS1
Chemokines
RNA-seq
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
EPRS1通过影响趋化因子的表达与功能促进肝癌细胞的恶性表型
杨晨
吴向未
《农垦医学》
2022
1
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职称材料
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参考文献
引证文献
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