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蝗虫微孢子虫套式PCR检测方法的建立及应用
被引量:
4
1
作者
扈鸿霞
马宇轩
+3 位作者
王艳红
林峻
李占武
季荣
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第21期4239-4245,共7页
【目的】建立一种灵敏、快捷的检测蝗虫微孢子虫(Paranosema locustae)的套式PCR方法,为运用微孢子虫防治蝗虫提供技术支持。【方法】以GenBank数据库中公布的保守性高的微孢子虫小核糖体亚单位RNA为目的基因,采用PrimerSelect软件设计...
【目的】建立一种灵敏、快捷的检测蝗虫微孢子虫(Paranosema locustae)的套式PCR方法,为运用微孢子虫防治蝗虫提供技术支持。【方法】以GenBank数据库中公布的保守性高的微孢子虫小核糖体亚单位RNA为目的基因,采用PrimerSelect软件设计两对特异的套式PCR引物P.L.-F1/P.L.-R1和P.L.-F2/P.L.-R2,将微孢子虫液用0.2 mol·L^(-1) KOH处理后得到的发芽液作为模板进行PCR扩增,建立以P.L.-F1/P.L.-R1为外侧引物、P.L.-F2/P.L.-R2为内侧引物的套式PCR,扩增产为分别为298和242 bp。对引物浓度、退火温度及循环数进行优化,建立套式PCR方法,以此方法对梯度稀释的微孢子虫液进行灵敏性检测,并对采自哈密地区巴里坤北山的蝗虫样品进行检测。同时对提取的微孢子虫液进行传统的显微镜检测,并比较两种方法的灵敏度。【结果】建立了蝗虫微孢子虫的套式PCR快速特异性检测方法,优化后的PCR反应体系均为20μL:Buffer(10×)2.0μL,d NTPs(10 mmol·L^(-1))0.3μL,TaqDNA酶(250 U)0.3μL,上、下游引物(10μmol·L^(-1))各0.3μL,微孢子虫发芽液(第2轮以第1轮产物10×稀释液为模板)1μL,加水补充至20μL;PCR反应程序为:94℃预变性3 min;94℃变性30 s,第1轮60℃退火(第2轮62℃退火)30 s,72℃延伸20 s,共35个循环;72℃延伸10 min,10℃保存。灵敏度试验显示,检测的微孢子虫数量可以达到12.2个孢子/μL(DNA量为1.07 pg·μL^(-1))。应用建立的套式PCR方法,对采自新疆哈密地区巴里坤北山的240头蝗虫样品进行了微孢子虫检测,检测结果为23.3%的阳性,而显微镜检测结果阳性仅为3.8%。【结论】研究建立的套式PCR方法能够快速特异地检测蝗虫微孢子虫的感染,为蝗虫微孢子虫致病性研究及田间应用提供了技术支持。
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关键词
蝗虫微孢子虫
套式PCR
检测
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职称材料
蝗虫微孢子TaqMan探针Real-time PCR检测新方法
2
作者
扈鸿霞
郑秋英
+2 位作者
叶小芳
赵贝
季荣
《中国生物防治学报》
CSCD
北大核心
2017年第6期796-802,共7页
蝗虫微孢子已被广泛运用于蝗虫防治。本研究采用蝗虫微孢子保守性高的小核糖体亚单位RNA为目的基因,将其克隆到pMD18-T载体上构建重组质粒,制备质粒标准品。设计一对特异性引物和TaqMan探针,并对引物浓度、探针浓度分别进行了优化,建立...
蝗虫微孢子已被广泛运用于蝗虫防治。本研究采用蝗虫微孢子保守性高的小核糖体亚单位RNA为目的基因,将其克隆到pMD18-T载体上构建重组质粒,制备质粒标准品。设计一对特异性引物和TaqMan探针,并对引物浓度、探针浓度分别进行了优化,建立了蝗虫微孢子TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。该检测方法的灵敏度达1.29×105 copies/L,各浓度质粒标准品的组内和组间重复的变异系数均小于1%。这里建立的蝗虫微孢子TaqMan探针荧光定量PCR检测方法较快速、简便和准确,适用于生产中蝗虫微孢子的快速检测。
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关键词
蝗虫微孢子
REAL-TIME
PCR
TAQMAN探针
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职称材料
题名
蝗虫微孢子虫套式PCR检测方法的建立及应用
被引量:
4
1
作者
扈鸿霞
马宇轩
王艳红
林峻
李占武
季荣
机构
新疆师范大学生命科学学院/新疆特殊环境物种多样性应用与调控实验室/中亚区域跨境有害生物联合控制国际研究中心
新疆
哈密地区蝗虫鼠害预测预报防治站
新疆
维吾尔自治区蝗虫鼠害预测预报防治
中心
站
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第21期4239-4245,共7页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金面上项目(2014211A042)
文摘
【目的】建立一种灵敏、快捷的检测蝗虫微孢子虫(Paranosema locustae)的套式PCR方法,为运用微孢子虫防治蝗虫提供技术支持。【方法】以GenBank数据库中公布的保守性高的微孢子虫小核糖体亚单位RNA为目的基因,采用PrimerSelect软件设计两对特异的套式PCR引物P.L.-F1/P.L.-R1和P.L.-F2/P.L.-R2,将微孢子虫液用0.2 mol·L^(-1) KOH处理后得到的发芽液作为模板进行PCR扩增,建立以P.L.-F1/P.L.-R1为外侧引物、P.L.-F2/P.L.-R2为内侧引物的套式PCR,扩增产为分别为298和242 bp。对引物浓度、退火温度及循环数进行优化,建立套式PCR方法,以此方法对梯度稀释的微孢子虫液进行灵敏性检测,并对采自哈密地区巴里坤北山的蝗虫样品进行检测。同时对提取的微孢子虫液进行传统的显微镜检测,并比较两种方法的灵敏度。【结果】建立了蝗虫微孢子虫的套式PCR快速特异性检测方法,优化后的PCR反应体系均为20μL:Buffer(10×)2.0μL,d NTPs(10 mmol·L^(-1))0.3μL,TaqDNA酶(250 U)0.3μL,上、下游引物(10μmol·L^(-1))各0.3μL,微孢子虫发芽液(第2轮以第1轮产物10×稀释液为模板)1μL,加水补充至20μL;PCR反应程序为:94℃预变性3 min;94℃变性30 s,第1轮60℃退火(第2轮62℃退火)30 s,72℃延伸20 s,共35个循环;72℃延伸10 min,10℃保存。灵敏度试验显示,检测的微孢子虫数量可以达到12.2个孢子/μL(DNA量为1.07 pg·μL^(-1))。应用建立的套式PCR方法,对采自新疆哈密地区巴里坤北山的240头蝗虫样品进行了微孢子虫检测,检测结果为23.3%的阳性,而显微镜检测结果阳性仅为3.8%。【结论】研究建立的套式PCR方法能够快速特异地检测蝗虫微孢子虫的感染,为蝗虫微孢子虫致病性研究及田间应用提供了技术支持。
关键词
蝗虫微孢子虫
套式PCR
检测
Keywords
Paranosema locustae
nested polymerase chain reaction
detection
分类号
S433.2 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
蝗虫微孢子TaqMan探针Real-time PCR检测新方法
2
作者
扈鸿霞
郑秋英
叶小芳
赵贝
季荣
机构
新疆师范大学生命科学学院/新疆特殊环境物种多样性应用与调控实验室/中亚区域跨境有害生物联合控制国际研究中心
出处
《中国生物防治学报》
CSCD
北大核心
2017年第6期796-802,共7页
基金
新疆维吾尔自治区高校科研计划科学研究重点项目(20140705135643406)
新疆维吾尔自治区教育厅重点实验室项目(XJKJT1322-016-01)
新疆维吾尔自治区天山创新团队计划
文摘
蝗虫微孢子已被广泛运用于蝗虫防治。本研究采用蝗虫微孢子保守性高的小核糖体亚单位RNA为目的基因,将其克隆到pMD18-T载体上构建重组质粒,制备质粒标准品。设计一对特异性引物和TaqMan探针,并对引物浓度、探针浓度分别进行了优化,建立了蝗虫微孢子TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。该检测方法的灵敏度达1.29×105 copies/L,各浓度质粒标准品的组内和组间重复的变异系数均小于1%。这里建立的蝗虫微孢子TaqMan探针荧光定量PCR检测方法较快速、简便和准确,适用于生产中蝗虫微孢子的快速检测。
关键词
蝗虫微孢子
REAL-TIME
PCR
TAQMAN探针
Keywords
Paranosema locustae
fluorescent quantitative PCR
TaqMan probe
分类号
S476.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蝗虫微孢子虫套式PCR检测方法的建立及应用
扈鸿霞
马宇轩
王艳红
林峻
李占武
季荣
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
4
下载PDF
职称材料
2
蝗虫微孢子TaqMan探针Real-time PCR检测新方法
扈鸿霞
郑秋英
叶小芳
赵贝
季荣
《中国生物防治学报》
CSCD
北大核心
2017
0
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职称材料
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