鄂尔多斯细毛羊LMNB1基因和TXNIP基因多态性与羊毛性状关联分析

该研究旨在寻找细毛羊主要经济性状的分子标记。以462只周岁鄂尔多斯细毛羊母羊为试验动物,联合DNA混池和Snapshot技术,检测LMNB1基因和TXNIP基因多态性,采用SAS9.2对LMNB1基因和TXNIP基因突变位点与羊毛性状进行关联分析。结果表明:鄂尔多斯细毛羊的LMNB1基因有1个Indel(Indel1)、4个SNP同义突变(SNP1、SNP2、SNP3、SNP4);TXNIP基因在3'UTR区有1个突变(SNP5)。LMNB1基因Indel1-SNP1突变位点ATCT基因型和TTTT基因型群体纤维直径变异系数显著高于AACC基因型(P<0.05),ATCT基因型和TTTT基因型之间差异不显著(P>0.05);TXNIP基因SNP5突变位点TT基因型平均纤维直径显著高于CT基因型(P<0.05),极显著高于CC基因型(P<0.01);CC基因型和CT基因型之间平均纤维直径差异不显著(P>0.05)。结果提示,TXNIP基因SNP5可作为影响鄂尔多斯细毛羊绒毛纤维直径的分子标记,为鄂尔多斯细毛羊超细型群体的选育提供试验依据。

西藏绒山羊羊绒细度候选基因筛选及其chi-miR-105a靶基因的验证

为研究西藏绒山羊羊绒细度,以及了解相关候选基因对绒山羊产绒性能的影响,本研究对筛选chi-miR-105a靶基因进行验证,以西藏绒山羊为研究对象,联合RNA测序数据和蛋白质组学数据,筛选与羊绒细度相关的关键候选基因,并通过实时荧光定量和双荧光素酶报告基因试验对候选基因进行调控作用验证。结果表明:1)通过转录组和蛋白组数据整理得到384个DE mRNAs,12个DE miRNAs和29个DEPs。通过多组学联合分析发现CXCL10、SRC、CXCL9、FOS、ETV6、GMPS和PIP5K1B基因与羊毛细度相关。2)通过DEG-DE miRNA互作网络图发现chi-miR-105a与靶基因ETV6和PIP5K1B均在网络当中出现。因此对该调控因子进行验证和分析,根据靶基因表达水平试验发现转染chi-miR-105a mimics后引起毛乳头细胞中ETV6基因的mRNA表达显著降低(P<0.001),而PIP5K1B基因的表达量均无显著变化。3)通过双荧光素酶报告基因试验表明,过表达chi-miR-105a后,ETV6酶活性显著降低,即chi-miR-105a可与ETV6的3′UTR区结合。综上,通过多组学联合分析筛选出与羊毛细度相关基因CXCL10、SRC、CXCL9、FOS、ETV6、GMPS和PIP5K1B。通过双荧光素酶报告基因进行chi-miR-105a与其预测靶基因ETV6和PIP5K1B的靶标验证,确定chi-miR-105a是ETV6潜在的调控因子,本研究为加快优质绒山羊新品种(系)的培养提供理论依据。