人乳头瘤病毒介导宫颈癌中甲基化修饰的诊断标志物的鉴定

目的:探讨人乳头瘤病毒(HPV)持续感染导致宫颈癌发展的分子变化及潜在的诊断标志物。方法:分别从GSE138080和GSE99511数据集中获取HPV阳性的宫颈上皮、高级别癌前病变(CIN)和鳞状细胞癌(SCC)的宫颈样本的基因表达谱和甲基化谱数据,鉴定在CIN和HPV阳性间及SCC和CIN间差异表达的基因和差异甲基化的位点。对差异表达基因进行共表达分析,筛选与疾病进展显著相关的模块,并对模块基因进行富集分析。进一步在模块中筛选可能受到甲基化修饰的基因,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线。收集自2022年11月至2023年9月于本院接受治疗的30例患者的宫颈组织样本,包含10例HPV阳性的宫颈上皮、10例CIN 3级和10例SCC组织样本。利用实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测基因的表达。结果:共有1832个基因在CIN和HPV阳性之间及SCC和CIN之间同时差异表达。富集分析显示,D4S234E、DOCK9、KLK10、NUCKS1为可能受到甲基化修饰的CIN和HPV阳性之间差异表达基因,TM7SF2为可能受到甲基化修饰的SCC和CIN之间差异表达基因。ROC结果提示,D4S234E、DOCK9、KLK10、NUCKS1和TM7SF2对CIN具有良好的诊断作用。D4S234E、DOCK9、KLK10、TM7SF2在SCC中的表达最低,在HPV阳性中的表达最高(P<0.05);NUCKS1在SCC中的表达最高,在HPV阳性中的表达最低(P<0.05)。结论:D4S234E、DOCK9、KLK10、TM7SF2、NUCKS1可能为宫颈癌提供了潜在的早期诊断标志物。