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基于SRAP标记对新疆狗牙根遗传多样性的研究
被引量:
1
1
作者
于辉
张延辉
+3 位作者
帕提古丽
陈家荣
艾福鹏
阿不来提
《新疆农业大学学报》
CAS
2013年第2期124-130,共7页
以采集的新疆典型地域的野生狗牙根材料为研究对象,对其遗传多样性进行分析。通过筛选出的11对具有多态性的SRAP引物组合,PCR扩增共产生77条带,其中64条显示多态性。各材料间遗传相似系数为0.3548~0.7903,差异较大,遗传距离系数为0.195...
以采集的新疆典型地域的野生狗牙根材料为研究对象,对其遗传多样性进行分析。通过筛选出的11对具有多态性的SRAP引物组合,PCR扩增共产生77条带,其中64条显示多态性。各材料间遗传相似系数为0.3548~0.7903,差异较大,遗传距离系数为0.1953~1.0826,说明新疆狗牙根资源间存在着丰富的遗传变异。通过聚类分析,可聚为2类,进一步明确了各野生材料之间的亲缘关系。
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关键词
SRAP
狗牙根
遗传多样性
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职称材料
狗牙根抗寒相关性状与分子标记的关联分析
被引量:
1
2
作者
张延辉
于辉
+2 位作者
马亮
李培英
阿不来提
《新疆农业大学学报》
CAS
北大核心
2016年第3期191-197,共7页
利用152份狗牙根材料在抗寒性上的差异,采用关联分析的方法鉴定与抗寒性状关联的分子标记。结果表明,采用基于数学模型的聚类方法分析狗牙根遗传结构,当群体数目k=4时模型,后验概率LnP(D)最大并有比较稳定的α值,可将供试材料分开,存在...
利用152份狗牙根材料在抗寒性上的差异,采用关联分析的方法鉴定与抗寒性状关联的分子标记。结果表明,采用基于数学模型的聚类方法分析狗牙根遗传结构,当群体数目k=4时模型,后验概率LnP(D)最大并有比较稳定的α值,可将供试材料分开,存在亚群结构。利用SSR、EST-SSR分子标记对狗牙根基因组LD结构进行粗略估计,159个SSR、EST-SSR标记中共检测到6554个成对位点组合存在连锁不平衡,占所有可能成对位点组合的38.8%,其中237个成对位点组合存在较高程度的连锁不平衡(D′>0.5)。通过对遗传结构分析和调整,以各个个体相应的Q值作为协变量,对SSR位点变异进行分析,结果检测到11个位点(S24、S36、S27、S51、S59、S21、S110、S118、S105、S150、S158)的变异分别与抗寒性状相关(P<0.05)。
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关键词
狗牙根
抗寒性
标记
关联分析
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职称材料
狗牙根EST-SSR反应体系优化及其遗传多样性初步分析
被引量:
7
3
作者
帕提古丽·麦麦提敏
张延辉
+1 位作者
李培英
阿不来提
《新疆农业大学学报》
CAS
2014年第2期112-118,共7页
利用 L16(4)5正交实验设计,对新疆狗牙根 EST-SSR反应体系进行优化;并将该体系初步应用于14份新疆典型区域的野生狗牙根材料,通过聚类分析研究供试材料的亲缘关系.结果表明,新疆狗牙根 EST-SSR反应最优体系为:20μL反应体系中含模板...
利用 L16(4)5正交实验设计,对新疆狗牙根 EST-SSR反应体系进行优化;并将该体系初步应用于14份新疆典型区域的野生狗牙根材料,通过聚类分析研究供试材料的亲缘关系.结果表明,新疆狗牙根 EST-SSR反应最优体系为:20μL反应体系中含模板DNA 100 ng,引物0.5μmol/L,2μL 10×Buffer,MgCl21.5 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,Taq DNA聚合酶0.5 U.运用该体系对14份新疆狗牙根材料进行PCR扩增,条带较清晰,可用于新疆狗牙根 EST-SSR标记的进一步研究.对14份狗牙根的多样性及其亲缘关系分析结果表明,狗牙根 Nei’s 基因多样性指数(H)变异范围为0.2077~0.3153,平均为0.2550;Shannon信息指数(I)在0.2540~0.4394.
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关键词
狗牙根
体系优化
多样性
CYNODON
dactylon
L
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职称材料
短期封育对伊犁绢蒿荒漠群落特征的影响
被引量:
13
4
作者
李坤
董乙强
+4 位作者
安沙舟
孔晓晶
杨娇
阿依敏.波拉提
关欣
《草业科学》
CAS
CSCD
2018年第5期978-983,共6页
本研究以新源县和呼图壁县典型的伊犁绢蒿(Seriphidium transiliense)荒漠为研究对象,采用野外调查的方法,测定封育区和放牧区伊犁绢蒿荒漠植被生态经济类群、群落特征及其多样性,研究不同气候区荒漠群落特征对封育的响应规律,为草地资...
本研究以新源县和呼图壁县典型的伊犁绢蒿(Seriphidium transiliense)荒漠为研究对象,采用野外调查的方法,测定封育区和放牧区伊犁绢蒿荒漠植被生态经济类群、群落特征及其多样性,研究不同气候区荒漠群落特征对封育的响应规律,为草地资源的合理利用提供一定的基础资料和科学依据。结果表明:1)封育围栏内,草原植物群落的高度、盖度、密度和生物量有大幅度提高,显著高于围栏外(P<0.05);2)在封育围栏内,草地群落Pielou均匀度指数增大,香浓指数和Patrick指数减小,伊犁绢蒿荒漠植被恢复明显。
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关键词
种群
封育
群落特征
多样性
伊犁绢蒿
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职称材料
题名
基于SRAP标记对新疆狗牙根遗传多样性的研究
被引量:
1
1
作者
于辉
张延辉
帕提古丽
陈家荣
艾福鹏
阿不来提
机构
新疆草地资源与生态自治区重点实验室新疆农业大学草业与环境科学学院
出处
《新疆农业大学学报》
CAS
2013年第2期124-130,共7页
基金
新疆农业大学校前期课题(XJAU201028)
国家自然科学基金项目(31160483)
新疆农业大学国家重点学科项目(XJCYB-2011-05)
文摘
以采集的新疆典型地域的野生狗牙根材料为研究对象,对其遗传多样性进行分析。通过筛选出的11对具有多态性的SRAP引物组合,PCR扩增共产生77条带,其中64条显示多态性。各材料间遗传相似系数为0.3548~0.7903,差异较大,遗传距离系数为0.1953~1.0826,说明新疆狗牙根资源间存在着丰富的遗传变异。通过聚类分析,可聚为2类,进一步明确了各野生材料之间的亲缘关系。
关键词
SRAP
狗牙根
遗传多样性
Keywords
SRAP
bermudagrass
genetic diversity
分类号
S543.9 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
狗牙根抗寒相关性状与分子标记的关联分析
被引量:
1
2
作者
张延辉
于辉
马亮
李培英
阿不来提
机构
新疆
草地
资源与
生态
自治区
重点
实验室
出处
《新疆农业大学学报》
CAS
北大核心
2016年第3期191-197,共7页
基金
新疆草地资源与生态实验室开放课题(XJDX0209-2013-02)
国家自然科学基金项目(31560661)
文摘
利用152份狗牙根材料在抗寒性上的差异,采用关联分析的方法鉴定与抗寒性状关联的分子标记。结果表明,采用基于数学模型的聚类方法分析狗牙根遗传结构,当群体数目k=4时模型,后验概率LnP(D)最大并有比较稳定的α值,可将供试材料分开,存在亚群结构。利用SSR、EST-SSR分子标记对狗牙根基因组LD结构进行粗略估计,159个SSR、EST-SSR标记中共检测到6554个成对位点组合存在连锁不平衡,占所有可能成对位点组合的38.8%,其中237个成对位点组合存在较高程度的连锁不平衡(D′>0.5)。通过对遗传结构分析和调整,以各个个体相应的Q值作为协变量,对SSR位点变异进行分析,结果检测到11个位点(S24、S36、S27、S51、S59、S21、S110、S118、S105、S150、S158)的变异分别与抗寒性状相关(P<0.05)。
关键词
狗牙根
抗寒性
标记
关联分析
Keywords
bermudagrass
cold tolerance
marker
association analysis
分类号
S688.4 [农业科学—观赏园艺]
下载PDF
职称材料
题名
狗牙根EST-SSR反应体系优化及其遗传多样性初步分析
被引量:
7
3
作者
帕提古丽·麦麦提敏
张延辉
李培英
阿不来提
机构
新疆
草地
资源与
生态
自治区
重点
实验室
出处
《新疆农业大学学报》
CAS
2014年第2期112-118,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31160483)
新疆维吾尔自治区高技术项目(20111112)
+1 种基金
新疆农业大学国家重点学科项目(XJCYB-2011-05)
新疆维吾尔自治区重点实验室项目(XJDX0209-2013-02)
文摘
利用 L16(4)5正交实验设计,对新疆狗牙根 EST-SSR反应体系进行优化;并将该体系初步应用于14份新疆典型区域的野生狗牙根材料,通过聚类分析研究供试材料的亲缘关系.结果表明,新疆狗牙根 EST-SSR反应最优体系为:20μL反应体系中含模板DNA 100 ng,引物0.5μmol/L,2μL 10×Buffer,MgCl21.5 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,Taq DNA聚合酶0.5 U.运用该体系对14份新疆狗牙根材料进行PCR扩增,条带较清晰,可用于新疆狗牙根 EST-SSR标记的进一步研究.对14份狗牙根的多样性及其亲缘关系分析结果表明,狗牙根 Nei’s 基因多样性指数(H)变异范围为0.2077~0.3153,平均为0.2550;Shannon信息指数(I)在0.2540~0.4394.
关键词
狗牙根
体系优化
多样性
CYNODON
dactylon
L
Keywords
EST-SSR
EST-SSR
system optimization
diversity
分类号
S688.4 [农业科学—观赏园艺]
下载PDF
职称材料
题名
短期封育对伊犁绢蒿荒漠群落特征的影响
被引量:
13
4
作者
李坤
董乙强
安沙舟
孔晓晶
杨娇
阿依敏.波拉提
关欣
机构
新疆草地资源与生态自治区重点实验室新疆农业大学草业与环境科学学院
出处
《草业科学》
CAS
CSCD
2018年第5期978-983,共6页
基金
国家重点研发计划"科技基础资源调查"专项课题--塔里木-准噶尔盆地荒漠主要植物群落调查(2017FY100201)
文摘
本研究以新源县和呼图壁县典型的伊犁绢蒿(Seriphidium transiliense)荒漠为研究对象,采用野外调查的方法,测定封育区和放牧区伊犁绢蒿荒漠植被生态经济类群、群落特征及其多样性,研究不同气候区荒漠群落特征对封育的响应规律,为草地资源的合理利用提供一定的基础资料和科学依据。结果表明:1)封育围栏内,草原植物群落的高度、盖度、密度和生物量有大幅度提高,显著高于围栏外(P<0.05);2)在封育围栏内,草地群落Pielou均匀度指数增大,香浓指数和Patrick指数减小,伊犁绢蒿荒漠植被恢复明显。
关键词
种群
封育
群落特征
多样性
伊犁绢蒿
Keywords
population
fencing
community characteristic
diversity
Seriphidium transiliense
分类号
S812.8 [农业科学—草业科学]
Q918.25 [天文地球—古生物学与地层学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SRAP标记对新疆狗牙根遗传多样性的研究
于辉
张延辉
帕提古丽
陈家荣
艾福鹏
阿不来提
《新疆农业大学学报》
CAS
2013
1
下载PDF
职称材料
2
狗牙根抗寒相关性状与分子标记的关联分析
张延辉
于辉
马亮
李培英
阿不来提
《新疆农业大学学报》
CAS
北大核心
2016
1
下载PDF
职称材料
3
狗牙根EST-SSR反应体系优化及其遗传多样性初步分析
帕提古丽·麦麦提敏
张延辉
李培英
阿不来提
《新疆农业大学学报》
CAS
2014
7
下载PDF
职称材料
4
短期封育对伊犁绢蒿荒漠群落特征的影响
李坤
董乙强
安沙舟
孔晓晶
杨娇
阿依敏.波拉提
关欣
《草业科学》
CAS
CSCD
2018
13
下载PDF
职称材料
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