无锡市水产养殖人群肠道大肠埃希菌及克雷伯菌药物敏感性特征分析

目的调查无锡市水产养殖健康人群肠道中耐药细菌组成及耐药情况,为流行病学研究及临床合理用药提供参考依据。方法 2017年6月,采集无锡市两个渔村的水产养殖健康人群粪便样本,分别用含有头孢他啶(4μg/mL)和多粘菌素E(4μg/mL)的营养琼脂平板初步筛选能够生长的肠道耐药菌,鉴定细菌种类并用微量肉汤稀释法对分离得到的大肠埃希菌和克雷伯菌进行药物敏感性试验。结果共采集到符合条件的健康人群粪便标本175份,经过两种初筛平板的分离培养和细菌鉴定,得到245株大肠埃希菌和138株克雷伯菌。药敏试验结果显示,除替加环素外,大肠埃希菌和克雷伯菌对于其他12种抗菌药物均有不同程度的耐药。其中,大肠埃希菌耐药情况更为突出,对哌拉西林(41.7%)、四环素(48.7%)和复方新诺明(47.2%)的耐药率较高。克雷伯菌对四环素耐药率达31.2%,对其他药物耐药率均未超过30.0%。此外,大肠埃希菌的多重耐药现象也较为普遍,有超过80.0%的大肠埃希菌对3种及3种以上的药物产生耐药。结论无锡市水产养殖人员肠道中普遍存在耐药菌,其中大肠埃希菌的多重耐药现象较为严重,耐药传播的风险性较高。

2016年江苏省江阴市一起伤寒疫情的实验室检测及溯源分析

针对一起于2016年6-9月发生在江阴市新桥镇的伤寒疫情开展暴发确认和传播因素分析。首先收集分离自确诊病例的14株伤寒沙门菌;再采集与疫情相关的外环境样本65份和食品样本13份,运用实时荧光PCR法检测样本中伤寒沙门菌特异基因,采用常规分离培养法分离伤寒沙门菌。对所有伤寒沙门菌分离株进行药敏试验及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析。从外环境样本(K熟食店加工厂井水)中分离得到1株伤寒沙门菌。15株伤寒沙门菌均对萘啶酸耐药,经脉冲场凝胶电泳后共获得2种带型,其中13株病例分离株和环境分离株的PFGE指纹图谱完全一致,另外1株病例分离株的PFGE带型存在1个条带的差异。结合流行病学调查和实验室检测结果,判定本次暴发疫情是由同一伤寒沙门菌遗传克隆的传播而导致,食品加工厂应属于是传播环节之一。

新型冠状病毒感染核酸和抗体检测方法比较

目的比较实时荧光RT-PCR法和胶体金法在新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染中的诊断价值。方法本研究采用回顾性研究,收集无锡市各医疗机构及集中隔离点2020年1月25日—2020年2月12日送至无锡市疾病预防控制中心实验室的新型冠状病毒冠肺炎(COVID-19)相关的实验室检测血清标本和鼻咽拭子标本各192份。33份为核酸检测阳性样本,159份为核酸检测阴性样本,包括68例确诊患者的密切接触者和91例门诊发热病例样本。采用胶体金法对所有研究对象的血清进行IgM、IgG抗体检测,比较抗体检测和核酸检测结果,进行统计学差异分析。结果病毒核酸阳性率17.19%(33/192),IgM抗体阳性率7.29%(14/192),IgG抗体阳性率11.46%(22/192),IgM和IgG联合检测阳性率11.46%(22/192)。病毒核酸和IgM、IgG、联合IgM和IgG抗体检测结果分别进行Kappa一致性检验,一致性较好,Kappa值分别为0.502、0.726、0.726,P值均<0.001。两种检测方法总符合率93.23%(179/192)。以实时荧光RT-PCR法为金标准,联合IgM和IgG抗体检测灵敏度63.64%,特异度99.37%,阳性预测值95.45%,阴性预测值92.94%,准确度63.01%。结论胶体金法具有方便、快捷、灵敏度和特异度高等优点,实现SARS-CoV-2的快速筛查,可用作实时荧光RT-PCR检测阴性病例的补充检测。两种检测方法联合应用,发挥各自优势,对SARS-CoV-2感染的诊断和防控具有重要的意义。

一起无菌性脑膜炎疫情中埃可病毒30型的全基因组分析

对引起一起无菌性脑膜炎的埃可病毒30型(Echovirus 30,E30)毒株进行全基因组测序,并分析其遗传变异和分子进化特征。提取病毒RNA,荧光RT-PCR确定为肠道病毒,再扩增其VP1区,测序确定为E30,设计针对E30全基因组的引物,RT-PCR扩增和序列测定获得全基因序列。利用DNAMAN 9.0、MEGA X、RDP 5和SimPlot 3.5.1软件分析全基因序列。E30无锡株基因组全长7 425 bp个核苷酸(nt),5′端和3′端分别为743 nt和97 nt的UTR,二个UTR之间为一个6 585 nt长的开放阅读框,编码一个含2 195个氨基酸(aa)的多聚蛋白。与GenBank中基因组序列比对,最同源的是毒株USA/2017/CA-RGDS-1048 (基因登录号:MN153801),核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为99.1%。VP1基因进化树分析显示,E30无锡株属于h型,并可归类于h型下分的基因簇GroupⅣ。种系进化分析和同源性分析提示E30无锡株可上溯到中国江苏毒株FDJS03毒株。分析还发现E30无锡株在非结构区存在重组,重组序列可能来自E30毒株(KY888274)和E18毒株(MN815813)。E30无锡株归类为h型E30,它是一个包含了E30毒株和E18毒株序列的重组病毒。