基于GEO数据库和临床样本验证CXCL9作为类风湿关节炎生物标志物的研究

目的基于生物信息学分析和临床样本验证,寻找类风湿关节炎(RA)新型生物标志物。方法从基因表达综合数据库(GEO)中获取RA和骨关节炎(OA)患者的转录组芯片数据(GSE12021数据集和GSE55235数据集),筛选差异表达基因。对筛选出的差异表达基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路富集分析,构建蛋白互作(PPI)网络,并鉴别关键基因。选取2023年3—9月无锡市第九人民医院RA患者30例(RA组)、OA患者30例(OA组)和健康体检者30名(正常对照组),收集所有研究对象相关临床资料,检测外周血单个核细胞(PBMC)中关键基因的表达情况。采用受试者工作特征(ROC)曲线评价关键基因对RA的诊断效能。采用Spearman相关分析评估关键基因与RA临床症状评价指标[关节压痛计数(TJC)、关节肿胀计数(SJC)和基于红细胞沉降率(ESR)的疾病活动指数28(DAS28)评分(DAS28-ESR评分)]的相关性。结果共筛选出120个差异表达基因,其中表达上调56个、表达下调64个。GO富集和KEGG通路富集分析结果显示,筛选出的差异表达基因主要集中于免疫调节、白细胞增殖、适应性免疫、细胞因子和趋化因子介导信号通路等生物学进程。通过PPI网络鉴定出3个关键基因[C-X-C基序趋化因子配体(CXCL)9、CXCL11和鸟苷酸结合蛋白1(GBP1)]。RA组PMBC中CXCL9相对表达量显著高于OA组和正常对照组(P<0.01),RA组PMBC中CXCL11相对表达量显著高于正常对照组(P<0.05);3组之间GBP1相对表达量差异无统计学意义(P>0.05);ROC曲线分析结果显示,以正常对照组为对照,CXCL9相对表达量诊断RA的曲线下面积(AUC)为0.890;以OA组为对照,CXCL9相对表达量诊断RA的AUC为0.660。相关性分析结果显示,CXCL9相对表达量与TJC、SJC、DAS28-ESR评分均呈正相关(r值分别为0.6046、0.7526、0.7896,P<0.001)。结论RA患者PMBC中CXCL9表达显著升高,且与RA严重程度有关。CXCL9或可作为新的RA诊断生物标志物。

外周血单个核细胞CCL5表达水平作为类风湿关节炎与骨性关节炎潜在鉴别诊断标志物的研究

目的 探讨类风湿关节炎(RA)与骨性关节炎(OA)患者外周血单个核细胞(PMBC)中C-C模式趋化因子配体5(CCL5)表达水平差异,以及其作为类风湿关节炎与骨性关节炎潜在鉴别诊断标志物的可能性。方法 收集临床RA与OA患者外周血样本,以健康人做对照,提取PMBC中mRNA,利用Q-PCR方法检测CCL5表达水平。比较RA、OA患者PMBC中CCL5表达差异,并对比类风湿因子(RF)与抗环瓜氨酸肽抗体(ACPA)在RA与OA鉴别诊断中的作用,利用ROC曲线明确CCL5表达水平对RA与OA的区分情况,对CCL5表达水平与RA严重程度进行相关性分析。结果 收集RA与OA患者外周血样本各30例,RA患者PMBC中CCL5表达水平显著高于OA患者(P<0.05),其在RA与OA鉴别诊断中的灵敏度、特异性、阳性预测值、阴性预测均高于RF,ROC曲线表明,CCL5表达水平可以有效区分RA与OA患者(AUC=0.823),RA患者CCL5表达水平与TJC(关节压痛指数)、SJC(肿胀关节指数)、DAS28评分呈显著正相关(P<0.05),其相关系数分别为0.60、0.75、0.79。结论 RA患者PMBC中CCL5表达水平显著高于OA患者,并与RA严重程度呈显著正相关,PMBC中CCL5可作为潜在的RA与OA鉴别诊断标志物。

基于Joinpoint回归模型的1999-2020全国血吸虫病流行趋势分析

目的了解1999-2020年全国血吸虫病流行趋势变化,为制定消除血吸虫病策略提供科学依据。方法收集1999-2020年全国血吸虫病疫情年报数据,采用Joinpoint回归模型,利用年均百分比变化(average annual percent change,AAPC)、年度百分比变化(annual percent change,APC)评价整体、局部血吸虫病疫情时间序列趋势变化。结果2002-2020年全国居民血检阳性率年均下降8.60%(AAPC=-8.60%,P<0.05),在2008年出现1个拐点,分为2个阶段,2002-2008年和2008-2020年(APC=-12.67%,P<0.05);1999-2020年居民粪检阳性率年均下降14.10%(AAPC=-14.10%,P<0.05),在2007年出现1个拐点,分为2个阶段,1999-2007年(APC=14.50%,P<0.05)和2007-2020年(APC=-28.01%,P<0.05)。1999-2012年耕牛阳性率年均下降13.20%(AAPC=-13.20%,P<0.05),在2004年出现1个拐点,分为2个阶段,1999-2004年和2004-2012年(APC=-22.42%,P<0.05);2013-2020年耕牛粪检阳性率逐年下降(APC=AAPC=-19.69%,P<0.05)。1999-2020年查出钉螺面积占查螺总面积比例年均上升1.5%(AAPC=1.5%,P>0.05),在2004年出现1个拐点,分为2000-2004年(APC=35.02%,P<0.05)和2004-2020年(APC=-0.08%,P<0.05);2000-2020年湖沼型流行区有螺面积占有螺总面积比例年均无变化(AAPC=0%,P>0.05),在2013年有1个拐点,分为2个阶段,2000-2013年(APC=0.16%,P<0.05)和2013-2020年(APC=-0.35%,P<0.05);水网型流行区有螺面积占有螺总面积比例年均下降14.7%(AAPC=-14.7%,P<0.05),在2007年出现1个拐点,分为2个阶段,2000-2013年和2013-2020年(APC=-34.36%,P<0.05);山丘型流行区有螺面积占有螺总面积比例有3个趋势变化连接点(AAPC=1%,P>0.05),分为4个阶段,分别为2000-2005年、2005-2014年(APC=-5.12%,P<0.05),2014-2017年(APC=19.53%,P<0.05)和2017-2020年。结论1999-2020年全国血吸虫病疫情呈下降趋势,在迈向消除阶段应继续采取以传染源控制为主的综合性防冶策略。