基于全外显子组测序的胸腺癌基因组分析和生物标志物探索的回顾性队列研究

目的检测胸腺癌(thymic carcinoma,TC)患者基因突变情况,以探索预后相关因素和治疗的潜在靶点。方法回顾性纳入四川省肿瘤医院2015年1月—2021年2月收治的TC患者。对TC患者肿瘤组织及其对照外周血样本进行全外显子组测序,并对原始数据进行生物信息学分析和统计学分析。结果最终纳入24例TC患者,其中男16例、女8例,中位年龄55(42~74)岁。TC患者单核苷酸突变频率最高的为TTN基因(42%)、HSPG2(29%)和OBSCN(29%)。发生染色体拷贝数变异频率较高的是ZNF276基因(54%,loss),BEND3(50%,loss),DHODH(50%,loss)和VAC14(50%,loss)。其中25%TC患者为微卫星不稳定(microsatellite instability,MSI)型,平均肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)为9.86。结论此研究是迄今为止第一个关于中国TC患者基因突变情况的全面分析。TTN、OBSCN和ZNF276基因的突变频率较高,通过MSI、TMB等生物标志物分析,表明TC患者有从免疫治疗中获益的潜能。

非小细胞肺癌少见/罕见靶点:共识与争鸣

由中国抗癌协会肺癌专业委员会和广东省临床试验协会/中国胸部肿瘤研究协作组主办的“第20届中国肺癌高峰论坛”于2023年3月4日在广州顺利召开。此次论坛以非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)少见/罕见靶点为主题,从少见/罕见靶点的精准检测、新型临床研究与围术期治疗等角度开展相关学术探讨,并最终达成了专家共识。

一项比较力扑素(Lipusu)联合顺铂与吉西他滨联合顺铂一线治疗局部晚期或转移性肺鳞癌的多中心、随机、开放标签、平行对照临床研究

背景与目的 力扑素(Lipusu,LP)是第一个商业化的紫杉醇脂质体制剂,在一项小规模研究中展现出了对局部晚期肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma,LSCC)的疗效。在此,我们进行了一项多中心、随机的Ⅲ期研究,比较顺铂联合LP与顺铂联合吉西他滨(gemcitabine,GP)作为局部晚期或转移性LSCC-线治疗的疗效和安全性。方法 入选患者年龄在18-75岁,局部进展(临床ⅢB期,不适合同步放化疗或手术)或转移性(Ⅳ期)LSCC,在服用试验药物之前,既往未接受过全身化疗,且至少有1处可测量的病变[依据实体瘤疗效评估标准(1.1版)]。主要终点为无进展生存(progression-free survival,PFS)。次要终点包括客观缓解率(objective response rate,ORR)、疾病控制率(disease control rate,DCR)、总生存(overall survival,OS)和安全性。为了探索血浆细胞因子对LP治疗的预测价值,在基线检查和首次疗效评估时收集LP组患者的血浆样本,然后使用45-Plex Procartapex Panel 1进行分析,用Luminex xMAP技术对45种细胞因子进行检测。初步分析评估了细胞因子水平动态变化与治疗结局之间的相关性。结果 中位随访时间为15.4个月。符合方案集(per protocol set,PPS)包括237例LP组患者和253例GP组患者。在PPS中,LP组和GP组的中位PFS分别为5.2个月和5.5个月[风险比(hazard ratio,HR)=1.03,P=0.742]。LP和GP组的中位OS分别为14.6个月和12.5个月(HR=0.83,P=0.215)。LP组和GP组的ORR(41.8%vs.45.9%,P=0.412)和DCR(90.3%vs.88.1%,P=0.443)也相似。LP组中出现导致治疗中断(10.9%vs.26.4%,P <0.001)或治疗终止(14.3%vs.23.1%,P=0.011)的不良事件(adverse events,AEs)的患者比例明显更低。LP组的细胞因子水平分析表明,基线水平较低的27种细胞因子与ORR增加相关,15种细胞因子与PFS改善相关,14种细胞因子(包括TNF-α、IFN-γ、IL-6和IL-8)呈现重叠趋势。结论 对于局部晚期或转移性LSCC患者,LP方案的PFS、OS、ORR和DCR与GP方案相似,但毒副反应方面表现更佳。本研究还鉴定得到一系列不同的细胞因子,这些细胞因子可能与接受LP方案的患者的临床获益相关。

厄洛替尼治疗携带EGFR A289V突变的晚期非小细胞肺鳞癌患者1例并文献复习

目的通过分析1例携带EGFR A289V突变的肺鳞癌患者的临床资料并复习文献,提高对携带少见驱动基因突变的肺鳞癌患者的诊疗水平。方法分析陆军军医大学第一附属医院收治的1例携带EGFR A289V突变的肺鳞癌患者的临床表现、实验室及影像学检查、组织病理学、治疗和预后,并进行相关文献复习。结果患者诊断左上肺鳞癌,二代测序在血浆游离DNA中检出EGFR低频活性突变p.A289V 0.45%,予以厄洛替尼治疗后达到部分缓解,随访4个月疾病稳定。结论本病例是全球首例报道EGFR A289V突变肺鳞癌患者使用厄洛替尼进行治疗并取得了理想疗效,为携带EGFR罕见突变的晚期肺鳞癌患者寻找靶向药物提供了思路。

基于二代测序技术监测肿瘤基因突变谱变化并指导晚期肺腺癌治疗1例并文献复习

目的探讨二代测序(next generation sequencing,NGS)技术监测肿瘤基因突变谱变化在指导晚期肺腺癌患者治疗中的应用。方法采用NGS技术监测1例晚期肺腺癌患者的基因突变谱,根据肿瘤基因突变谱变化,分析该患者的临床表现及实验室、影像学及组织病理学检查结果,调整治疗方案,并对该病例资料进行复习,随访至2017年5月,患者死亡。结果NGS平台的基因检测结果提示该患者存在EGFR、HGF/c-MET、CDK6等多种基因突变,肿瘤呈多克隆演化。随着患者病情的变化,基因突变谱和突变丰度也随之改变。结论NGS技术在晚期肺腺癌患者的全程管理中可发挥重要作用。根据基因突变谱和突变丰度的变化调整治疗方案,可能获得最佳疗效。

MinerVa——一种用于实体瘤微小残留病灶检测的高性能检测算法

如何提高循环肿瘤DNA(ctDNA)信号的获取能力以及判定低频信号的真实性是肿瘤微小残留病灶(MRD)检测的难点问题。本研究开发了多变异联合置信概率分析的MRD生物信息学算法(MinerVa),并在ctDNA标准品和早期非小细胞肺癌患者血浆DNA样本中对算法效能进行评估。结果显示,MinerVa算法对多变异共追踪的特异性稳定在99.62%~99.70%,当追踪30个变异时,可检测低至6.3×10^(-5)变异丰度的变异信号;进一步对27例非小细胞肺癌患者的数据进行分析,ctDNA-MRD动态监测复发的特异性为100%,灵敏度为78.6%。数据表明MinerVa算法可高效地捕获血液ctDNA信号,在MRD检测中具有较好的准确性。